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高温酸性α-淀粉酶基因的定向突变及在地衣芽孢杆菌中的表达
作 者: 牛丹丹
导 师: 王正祥
学 校: 江南大学
专 业: 发酵工程
关键词: 高温酸性α-淀粉酶 密码子偏好性 定向突变 表达
分类号: TQ920.1
类 型: 硕士论文
年 份: 2005年
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内容摘要
耐高温α-淀粉酶是目前最重要的工业酶制剂之一,广泛应用于发酵、制糖等工业。Pyrococcus furiosus产生的胞外α-淀粉酶(PFA)具有耐热性能好、最适pH低和钙离子不依赖性。本文主要针对异源高表达PFA编码基因的关键基础问题进行研究。以大肠杆菌为例,研究其tRNA组成的变化对PFA表达的影响。将重组质粒pET-PFA转化大肠杆菌DE3 CondonPlus-RIL,PFA表达量提高约9倍,验证了胞内tRNA的组成影响PFA的表达水平。根据PFA编码基因的序列及地衣芽孢杆菌密码子使用频率,对PFA编码基因的密码子进行全面改组,即将PFA编码基因中使用的地衣芽孢杆菌稀有密码子改为相应的同义密码子。在计算机的协助下,运用DNAMAN软件设计全基因合成寡核苷酸,共78条寡核苷酸。经过组合反应和特异性PCR扩增技术,获得全合成的DNA片段。将此扩增片段克隆入pBlueScript SK(-),得到pSK-amyF。测序结果表明,全合成基因的核苷酸序列与实验设计完全一致,与原始PFA编码基因的核苷酸序列存在9.62%的差异。进一步研究了amyF在以地衣芽孢杆菌为宿主细胞中的表达。重组质粒pSK-amyF经EcoR I和Sma I酶切后,通过胶回收得到amyF。将amyF克隆入质粒pBL-WZX的EcoR I和Sma I处,获得在地衣芽孢杆菌中表达的整合型表达pBL-amyF。再以pBL-amyF为模板扩增出片段PamyL-SamyL-amyF-Tart-?Km-3’amyL’,克隆入pHY300PLK中形成游离型表达质粒pHY-amyF。重组质粒pBL-amyF和pHY-amyF纯化后,通过电转化方法转化地衣芽孢杆菌。转化混合物涂布在5μg/mL的卡那霉素的LB平板筛选出阳性转化子。对重组α-淀粉酶的酶学性质进行了初步研究,结果表明重组酶的最适pH5.0,最适温度95-98oC,与天然PFA基本相似。重组菌的产酶水平较前期研究有了很大的提高。
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全文目录
中文摘要 5-6 Abstract 6-7 1 前言 7-15 1.1 淀粉水解工业的主要加工工序 7-9 1.2 高效淀粉液化工艺要求α-淀粉酶具有新的性能 9 1.3 α-淀粉酶分子改性的研究概况 9-11 1.3.1 BLA 热稳定的分子基础和分子改性 10-11 1.3.2 适应低pH 环境的分子改性 11 1.4 酶分子改性技术的研究和应用概况 11-12 1.5 具有新性能的天然α-淀粉酶的筛选 12-13 1.6 本研究立题背景和依据 13-15 2. 材料和方法 15-25 2.1 菌株和质粒 15 2.2 工具酶和试剂 15-16 2.2.1 酶和试剂盒 15 2.2.2 质粒提取与纯化试剂 15 2.2.3 蛋白电泳试剂 15-16 2.3 培养基和培养条件 16-17 2.4 B. licheniformis 染色体的提取 17 2.5 质粒DNA 的提取 17 2.6 大肠杆菌感受态细胞的制备和转化 17-18 2.6.1 感受态细胞制备 18 2.6.2 转化 18 2.7 地衣芽孢杆菌转化 18-19 2.8 amyF 基因的合成与重组质粒的构建 19-23 2.8.1 amyF 基因的全合成 19-22 2.8.2 应用于amyF 表达的重组质粒的构建 22-23 2.9 常见分子克隆操作 23 2.10 发酵试验 23 2.11 耐高温α-淀粉酶酶活测定 23 2.12 SDS-PAGE 23-24 2.13 主要仪器 24-25 3 结果和讨论 25-38 3.1 不同生物体同义密码子使用频率存在较大差异 25-27 3.2 改善宿主细胞胞内氨基酰tRNA 池有助于提高异源基因表达水平 27-28 3.3 PFA 编码基因的分子改造 28-32 3.4 重组质粒pBL-amyF 和pHY-amyF 的构建 32-36 3.5 重组菌的构建和初步发酵试验 36-38 论文主要结论 38-39 参考文献 39-42 致谢 42-43 硕士研究生期间在科学技术期刊上发表的文章 43
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中图分类: > 工业技术 > 化学工业 > 其他化学工业 > 发酵工业 > 一般性问题 > 基础理论
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