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酵母双杂交系统筛选与禽流感病毒NS1相互作用的宿主因子
作 者: 李丽
导 师: 常城
学 校: 兰州大学
专 业: 动物学
关键词: 禽流感病毒 非结构蛋白 宿主因子 酵母双杂交
分类号: S852.65
类 型: 硕士论文
年 份: 2008年
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内容摘要
禽流感病毒非结构蛋白1(NS1蛋白)全长约为230个氨基酸,理论分子量约为26KDa,主要包括两个功能结构域,即N-末端的RNA结合结构域和和C-末端的效应结构域。NS1蛋白是一个多功能的病毒蛋白,它不仅影响着该病毒其他基因的表达,更能通过与宿主多种细胞因子的相互作用干预宿主细胞的正常功能,抵抗宿主的抗病毒系统。NS1蛋白因此被认为是禽流感病毒的一个重要毒力因子。为了寻找与NS1相互作用的其它宿主蛋白以及试图探索NS1的新功能,最终阐明禽流感的致病性机制,我们利用酵母双杂交系统,以NS1为诱饵蛋白,从人胸腺cDNA文库中筛到了8个宿主因子可与NS1蛋白相互作用,我们选择U蛋白作为我们研究的目的蛋白,并作了点对点酵母双杂交回转实验。结果发现两者确实是互作的,并且互作的部位位于NS1蛋白的RNA结合结构域上。同时我们利用GST Pull-down进一步验证了二者的相互作用。在研究当中还发现,高致病性禽流感病毒H5N1亚型NS1蛋白的80-84位氨基酸缺失可能对禽流感的致病性很重要,这提示针对H5N1型高致病性禽流感病毒可能是一个新的药物靶点。
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全文目录
中文摘要 7-8 英文摘要 8-9 引言 9-11 1 研究的目的和意义 9 2 主要研究内容 9 3 研究技术路线 9-11 第一章 论文综述 11-24 1.1 禽流感病毒研究进展 11-15 1.1.1 禽流感病毒的形态和化学成分 11 1.1.2 禽流感病毒的分子结构与分类 11-13 1.1.3 禽流感病毒的复制与致病机理 13-14 1.1.4 存在问题与展望 14-15 1.2 NS1蛋白的结构 15-17 1.2.1 N-末端RNA结合区的结构 15-16 1.2.2 C-末端效应区的结构 16-17 1.3 NS1蛋白的功能 17-20 1.3.1 抑制和利用宿主细胞的转录翻译系统 17-18 1.3.2 拮抗干扰素的抗病毒作用 18-19 1.3.3 NS1蛋白下调细胞凋亡 19-20 1.4 NS1蛋白与其他宿主蛋白相互作用 20 1.4.1 NS1蛋白和importina/β相互作用 20 1.4.2 NS1蛋白和nucleolin相互作用 20 1.5 酵母双杂交系统 20-24 1.5.1 酵母双杂交系统的作用原理 20-21 1.5.2 酵母双杂交系统选用酵母作为报告株的优点 21-22 1.5.3 酵母双杂交系统相对其他方法具有的优点 22 1.5.4 酵母双杂交系统中常见的问题 22-24 第二章 材料与方法 24-36 2.1 材料 24-29 2.1.1 菌株及细胞系 24 2.1.2 质粒载体 24-25 2.1.3 引物 25 2.1.4 酶类、分子量标准与试剂盒 25 2.1.5 主要化学试剂及常规溶液的配制 25-29 2.2 方法 29-36 2.2.1 PCR扩增 29-30 2.2.2 DNA片段的回收(DNA片段凝胶回收试剂盒) 30 2.2.3 限制性内切酶酶切反应 30-31 2.2.4 酶切DNA片段与酶切载体的连接 31 2.2.5 感受态细胞的制备(RbCI法) 31 2.2.6 RbC1感受态细胞的转化 31 2.2.7 质粒快速抽提(质粒小量纯化试剂盒) 31-32 2.2.8 酵母感受态的制备与转化 32 2.2.9 酵母蛋白的提取 32-33 2.2.10 酵母质粒的提取 33 2.2.11 酵母转化子β-半乳糖苷酶的固体测活 33-34 2.2.12 细胞培养及转染 34 2.2.13 Western Blotting 34-35 2.2.14 融合蛋白的原核表达与纯化 35 2.2.15 GST Pull Down分析 35-36 第三章 实验结果 36-42 3.1 pGBKT7-NS1重组质粒的构建 36 3.1.1 PCR扩增禽流感病毒NS1基因 36 3.1.2 pGBKT7-NS1酵母表达载体的构建 36 3.2 酵母双杂交系统筛选与NS1相互作用的宿主蛋白 36-40 3.2.1 pGBKT7-NS1在酵母AH109中蛋白表达的检测 36-37 3.2.2 pGBKT7-NS1自激活活性的检测 37 3.2.3 cDNA文库转化酵母AH109 37-38 3.2.4 阳性克隆的筛选 38 3.2.5 提取酵母质粒进行PCR扩增并转化大肠杆菌 38 3.2.6 测序结果与分析 38 3.2.7 回交验证 38-40 3.3 GST Pull-down验证NS1蛋白与文库蛋白的相互作用 40-42 3.3.1 PCR扩增文库蛋白基因 40 3.3.2 pGEX4T1-U原核表达载体的构建 40 3.3.3 U蛋白在原核细胞中的表达 40 3.3.4 GST Pull-down实验 40-42 第四章 讨论 42-44 4.1 酵母双杂交系统 42-43 4.2 蛋白相互作用的鉴定 43 4.3 NS1蛋白功能提示 43-44 参考文献 44-47 硕士期间发表文章 47-48 致谢 48-49 附录 49
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中图分类: > 农业科学 > 畜牧、动物医学、狩猎、蚕、蜂 > 动物医学(兽医学) > 兽医基础科学 > 家畜微生物学(兽医病原微生物学) > 家畜病毒学
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