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肝癌相关基因差异表达的初步研究

作　者: 阚学峰
导　师: 杜智
学　校: 天津医科大学
专　业: 普通外科
关键词: 肝癌生物信息学基因表达多重RT-PCR 分子切缘
分类号: R735.7
类　型: 硕士论文
年　份: 2004年
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内容摘要

肝癌的发生和发展是多基因参与、多阶段进行的复杂过程，要了解其发生、发展和浸润转移的分子机制，综合分析肿瘤发生过程中大量基因的表达变化是十分必要的。目的：对获得的肝癌相关差异表达基因进行生物信息学分析，利用RT-PCR技术研究AFP、COL1A2、UBD、FN、Genimin、GPC3、SPINT2、Stathmin、VEGFB和IGFBP3等10个基因在肝癌组织和癌旁组织间的差异表达情况，及与临床病理学特征的关系；依据10个基因差异表达情况对肝癌分子切缘进行初步研究；建立多重RT-PCR检测基因表达的方法。方法：收集肝癌手术标本并保存于-80℃；挑选125个差异表达基因阳性克隆进行测序和生物信息学分析；提取手术标本的mRNA后利用RT-PCR对10个肝癌相关基因的差异表达进行半定量分析，多重RT-PCR扩增实验。结果：(1)125个克隆测序后经生物信息学分析获得基因83个，其中细胞分裂相关基因5个，参与细胞信号转导或通讯的基因5个，参与细胞结构或运动的基因7个，细胞或器官防御相关基因11个，参与细胞内基因转录或蛋白表达的基因22个，代谢相关基因18个，另有15个未归类基因。(2)10个基因在50例患者癌内和癌旁组织中的表达结果表明它们在癌和癌旁组织之间存在差异表达，除去癌内低表达基因IGFBP3以外，其余9个基因在癌和癌旁组织间的差异表达具有显著性差异。(3)SPINT2在癌和癌旁组织间的差异表达和肿瘤大小有关，COL1A2的差异表达和血清AFP水平及肿瘤组织学分级有关，FN和AFP基因的差异表达都和血清AFP异常相关；10个基因的差异表达均和是否携带乙型肝炎表面抗原无关。(4)对25例患者距手术切缘2cm、1cm肝组织、癌旁组织和癌组织的检测表明，10个基因的表达呈现递减(癌高表达基因)或递增(癌低表达基因IGFBP3)的趋势。(5)建立了多重RT-PCR检测基因表达的方法。结论：(1)125个克隆测序后经分析获得83个肝癌相关高表达基因。(2)天津医科大学硕士学位论文中文摘要AFP等9个肝癌相关高表达基因在癌内和癌旁组织之间存在显著的差异性表达。(3)AFP等10个基因在癌周组织内的表达呈现递减(癌高表达基因)或递增(癌低表达基因IeFBP3)的趋势。(4)AFP、eoLzAZ、sPINTZ、FN等4个基因和肿瘤大小、组织学分级、血清AFP等因素有关。(5)10个基因差异表达提示肝癌组织周围存在分子切缘。(6)成功建立了多重RT一PCR检测基因表达的方法。

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中英文缩略语对照表  3-4
中文摘要  4-6
英文摘要  6-8
前言  8-10
论文一: 自制肝癌消减文库克隆的生物信息学分析  10-30
论文二: 10个肝癌相关基因差异表达的半定量分析研究  30-65
论文三: 多重RT-PCR技术检测基因表达方法的建立  65-88
文献综述: 肝癌相关差异表达基因研究进展  88-113
致谢  113

肝癌相关基因差异表达的初步研究

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