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猪CNN3和HMGCS1基因的克隆测序及其表达规律的研究

作　者: 谭林
导　师: 姜海龙
学　校: 吉林农业大学
专　业: 动物营养与饲料科学
关键词: 猪肌肉发育肉质品质 CNN3基因 HMGCS1基因基因表达
分类号: S828
类　型: 硕士论文
年　份: 2011年
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内容摘要

本实验通过对调宁蛋白3(calponin 3, acidic, CNN3)和3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A合成酶1(3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase 1,HMGCS1)这两个基因的研究揭示其与肉质性状的关系以及对肌肉的发育的影响。以通城猪、长白猪、大白猪、贵州猪等猪种DNA为模板对CNN3和HMGCS1基因进行PCR扩增并测序,筛选出CNN3基因和HMGCS1基因序列在不同品种间的差异位点。成功克隆得到CNN3和HMGCS1基因的部分片段序列,并通过不同品种间序列的比对,确定CNN3基因11个多态性位点,HMGCS1基因有5个多态性位点。本实验采用实时荧光定量PCR法,检测了通城猪和长白猪不同组织中CNN3和HMGCS1基因的表达情况,通城猪骨骼肌不同发育时期CNN3和HMGCS1基因的表达情况,五指山猪、长白猪和通城猪骨骼肌不同发育时期(胚胎期第33天、65天和90天)CNN3和HMGCS1基因的表达情况。结果如下：1.CNN3基因在通城猪和长白猪的心、肝、脾、肺、胃、小肠、卵巢、背肌等组织中都有表达,且在心脏、肺和卵巢中都有较高的表达,肝中表达量都是中等,但是在胃、脾和小肠这3个组织中表达有差异。HMGCS1基因在通城猪和长白猪的心、肝、脾、肺、肾、胃、背肌、皮脂、小肠等各组织中均有表达,对不同品种来说,在肝、脾、肺、小肠、背肌和心脏这6个组织中表达趋势是一致的,而在胃和小肠中表达是有差异的。2.检测了CNN3基因在通城猪胚胎期的第33天、第40天、第50天、第60天、第65天、第70天、第80天、第90天、第100天、第105天和出生后的第0天、第9天、第20天、第30天、第40天、第60天、第80天、第140天的背最长肌的表达情况,除了在胚胎期的第100天、出生后第0天和出生后第9天有所增加外,CNN3基因表达的趋势是随着时间而不断降低的。检测了HMGCS1基因在胚胎期的第33天、第40天、第50天、第60天、第65天、第70天、第75天、第80天、第90天、第100天和出生后的第0天、第9天、第20天、第30天、第40天、第60天的表达情况,随着时间增加HMGCS1基因在通城猪骨骼肌的表达量先是下降,到出生时表达量又有所增加,然后又下降。3.检测CNN3基因在五指山猪、长白猪和通城猪骨骼肌胚胎期第33天、第65天和第90天的表达情况,CNN3基因在这3个品种的表达模式并不完全一致,其中长白猪和通城猪的CNN3基因的表达模式一致,而与之五指山猪中的表达模式有差异。检测HMGCS1基因在五指山猪、长白猪和通城猪骨骼肌胚胎期第33天、第65天和第90天的表达情况,HMGCS1基因在通城猪、长白猪和五指山猪的表达模式都有差异。

全文目录

摘要  4-5
ABSTRACT  5-7
第一章文献综述  7-18
  1.1 肌肉的组织学特性及其影响因素  7-10
  1.2 肉质常规评定指标及其影响因素  10-11
  1.3 调控猪肉质性状的基因  11-14
  1.4 CNN3和HMGCS1基因  14-15
  1.5 基因多核苷酸多态性(SNP)  15-16
  1.6 定量PCR技术  16-18
第二章 CNN3和HMGCS1基因的多态性研究  18-34
  2.1 材料与方法  18-24
  2.2 结果与分析  24-32
  2.3 讨论  32-34
第三章 CNN3和HMGCS1基因的表达谱分析  34-46
  3.1 材料与方法  34-36
  3.2 结果与分析  36-43
  3.3 讨论  43-46
第四章结论  46-47
参考文献  47-52
附录1 通城猪CNN3基因第2、3、4、6内含子序列  52-54
附录2 通城猪HMGCS1基因第2、3、5、6、7、8内含子序列  54-56
致谢  56-57
个人简介  57

猪CNN3和HMGCS1基因的克隆测序及其表达规律的研究

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