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胡萝卜抗冻蛋白AFP基因的克隆及对葡萄的遗传转化
作 者: 褚明宇
导 师: 陈佰鸿
学 校: 甘肃农业大学
专 业: 果树学
关键词: 胡萝卜AFP 葡萄 再生 转化
分类号: S663.1
类 型: 硕士论文
年 份: 2012年
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内容摘要
我国葡萄(Vitis vinifera)主栽品种抗冻性弱,根系的抗寒能力差,冬季需要埋土越冬;因此通过遗传转化将植物抗冻基因导入葡萄中,培育转基因葡萄新品系,对改良葡萄抗寒能力具有重要意义。本研究通过PCR方法成功克隆了胡萝卜抗冻蛋白AFP基因并对其进行序列分析,构建了胡萝卜AFP基因的植物表达载体pBI-AFP,以宝石无核(Ruby Seedless)为受体材料进行了遗传转化。主要结果如下:1以胡萝卜植物组织基因组DNA为模板,通过PCR方法,获得了胡萝卜抗冻蛋白AFP基因,并连接到pGEM-T easy载体中。2通过ProtParam软件和蛋白分析软件Predictprotein对AFP抗冻基因生物信息学的分析,预测该蛋白的分子式为C1709H2680N448O502S16,相对分子质量为38.048kDa,等电点为5.43,该蛋白为亲水性分泌型蛋白,有信号肽存在;其蛋白质二级结构以α-螺旋、β-折叠和无规卷曲为主。3pGEM-AFP和pBI-121经Sac I和Xba I双酶切后连接,转化到大肠杆菌E.coilDH5α感受态细胞,成功构建了植物表达载体pBI-AFP。4通过液氮冻融法将植物表达载体pBI-AFP导入根癌农杆菌EHA105菌株中,经抗生素抗性筛选和PCR鉴定重组质粒成功导入农杆菌,构建了工程菌pBI-AFP/At.EHA105。5获得了适宜宝石无核葡萄叶片诱导不定芽的适宜培养基: CH+2-iP4mg/L+6-BA2mg/L+TDZ4mg/L,不定芽的诱导率为53.3%;获得了适宜超级无核葡萄叶片不定芽分化的培养基:CH+2-iP1mg/L+6-BA1mg/L+TDZ0.5mg/L+CPPU0.5mg/L+ZT1mg/L,不定芽诱导率为46.7%。6采用根癌农杆菌介导的叶盘转化法转化宝石无核葡萄,通过抗性筛选获得了转化葡萄植株,经PCR检测,初步证明目的基因AFP已导入葡萄植株中。
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全文目录
摘要 2-3 Abstract 3-5 英文缩写符号及中英文对照表 5-6 目录 6-9 第一章 文献综述 9-22 1 植物的冻害及冻害机理 9-11 1.1 冻害 9-10 1.2 冻害机理 10-11 2 抗冻基因 11-14 2.1 抗冻蛋白的来源及鱼类抗冻蛋白(AFP) 11-12 2.2 鱼类 AFP 及在农业中的应用 12 2.3 植物抗冻蛋白 12-13 2.3.1 植物 AFPs 基因的发现 12-13 2.3.2 植物 AFP 基因在提高植物抗冻性方面的应用 13 2.4 抗冻相关基因 13-14 2.4.1 抗冻转录因子 CBF 家族的发现 13-14 2.4.2 CBFs 与抗冻基因 14 3 葡萄遗传转化的研究 14-20 3.1 葡萄再生体系的研究 14-17 3.1.1 葡萄器官发生途径 15-16 3.1.2 胚状体发生途径 16-17 3.2 葡萄遗传转化途径的研究 17-20 3.2.1 根癌农杆菌介导 Ti 质粒介导基因转化葡萄 17-18 3.2.2 发根农杆菌转化葡萄 18-19 3.2.3 基因枪法转化葡萄 19 3.2.4 基因枪法和根癌农杆菌介导法相结合转化葡萄 19-20 4 本项目的研究目的和意义 20-21 5 技术路线 21-22 第二章 材料与方法 22-34 1 材料 22-24 1.1. 植物材料 22 1.2 菌种与质粒 22 1.3 酶与试剂 22 1.4 PCR 引物的设计 22 1.5 培养基 22-23 1.5.1 细菌培养基 22-23 1.6 缓冲液 23-24 2 方法 24-28 2.1 抗冻基因 AFP 的克隆 24-25 2.1.1 胡萝卜基因组总 DNA 的提取方法(CTAB 法) 24-25 2.1.2 抗冻蛋白 AFP 基因的扩增 25 2.2 目的基因片段的回收 25 2.3 目的片段与 pGEm-T easy Vector 载体的连接 25-26 2.4 大肠杆菌感受态细胞的制备及转化 26-27 2.4.1 大肠杆菌感受态细胞的制备 26 2.4.2 大肠杆菌感受态细胞的转化 26-27 2.5 质粒 DNA 的提取 27 2.6 重组质粒的滞后鉴定 27 2.7 重组质粒的 PCR 鉴定 27-28 2.8 重组质粒的酶切鉴定体系 28 2.9 重组质粒的序列测序 28 2.10 AFP 基因序列的生物信息学分析 28 3 抗冻基因 AFP 植物表达载体的构建 28-31 3.1 质粒的酶切 28-29 3.2 连接 AFP 和 pBI121 酶切产物 29 3.3 转化大肠杆菌 DH5α感受态细胞 29-30 3.4 农杆菌感受态细胞的制备 30 3.5 中间载体直接导入农杆菌 30 3.6 PCR 扩增 30-31 4 葡萄遗传转化 31-34 4.1 葡萄遗传转化再生体系的诱导 31-32 4.1.1 不同生长调节剂种类及浓度对葡萄遗传转化再生体系的影响 31 4.1.2 不同糖分处理的试管苗对葡萄遗传转化再生体系的影响 31 4.1.3 不同基因型对葡萄遗传转化再生体系的影响 31-32 4.2 不定芽增殖 32 4.3 根癌农杆菌介导胡萝卜 AFP 转化葡萄 32-34 4.3.1 卡那霉素筛选浓度确定 32 4.3.2 农杆菌浓度和时间对葡萄遗传转化的影响 32 4.3.3 羧苄青霉素敏感性试验 32 4.3.4 农杆菌叶盘法转化 32-33 4.3.5 转基因植株的 PCR 鉴定 33-34 第三章 结果与分析 34-46 1 胡萝卜抗冻蛋白 AFP 基因克隆 34-39 1.1 胡萝卜总 DNA 的提取与目的片段的 PCR 扩增及回收 34-36 1.1.1 重组体的筛选 34 1.1.2 重组质粒的滞后鉴定 34-35 1.1.3 目的片段在重组质粒中的 PCR 鉴定 35 1.1.4 目的片段的酶切鉴定 35-36 1.2 AFP 基因测序结果及核苷酸序列分析 36-37 1.3 AFP 基因氨基酸序列同源性分析及分子进化分析 37-38 1.4 蛋白一级结构特征及理化性质分析 38-39 1.5 蛋白质二级结构预测 39 2. AFP 抗冻基因载体构建 39-41 2.1 pGEM-AFP 和 pBI121 酶切 40 2.2 植物表达载体的鉴定 40-41 2.3 中间载体导入农杆菌的鉴定 41 2.3.1 农杆菌的转化 41 2.3.2 农杆菌转化的鉴定 41 3 葡萄遗传转化 41-46 3.1 不同激素组合对葡萄再生体系的影响 41-44 3.1.1 不同糖分处理的葡萄试管苗对不定芽分化的影响 41-42 3.1.2 不同激素组合对葡萄再生体系的影响 42-43 3.1.3 不同基因型对葡萄再生体系的影响 43-44 3.2 葡萄转化 44-46 3.2.1 卡那霉素筛选浓度确定 44 3.2.2 菌液浓度和时间的选择 44 3.2.3 羧苄青霉素敏感性筛选 44-45 3.2.4 转化再生植株的 PCR 鉴定 45-46 第四章 讨论 46-51 1 胡萝卜 AFP 基因的进化关系 46-47 2 中间表达载体构建策略 47 3 影响葡萄遗传转化的因素 47-51 3.1 外植体对再生体系的影响 47-48 3.2 激素的种类和浓度 48-49 3.3 影响葡萄转化的因素——菌液浓度和浸染时间 49 3.4 抗性标记基因的影响 49-51 结论 51-52 参考文献 52-59 图版说明 59-60 致谢 60-61 个人简历 61-62 导师简介 62-63
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中图分类: > 农业科学 > 园艺 > 果树园艺 > 浆果类 > 葡萄
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