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FATP1基因多态性及其与鸡屠宰性状的相关性研究

作　者: 姚俊宏
导　师: 朱庆
学　校: 四川农业大学
专　业: 动物遗传育种与繁殖
关键词: 鸡 FATP1基因 PCR-SSCP 屠宰性状 相关分析
分类号: S831.2
类　型: 硕士论文
年　份: 2009年
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内容摘要


现代肉鸡育种的一个关键问题就是肉质问题。如何通过对肉质在分子水平上进行调控,如何在育种实践中对肉质进行有效的选择和调控,已成为近年来许多育种研究的着眼点。FATP基因家族脂肪酸转运蛋白Fatty Acid Transport Protein)最早发现的命名为FATP1,其余的分别为FATP2、FATP3、FATP4、FATP5、FATP6。FATP1主要参与长链脂肪酸的跨膜运输并且参与长链脂肪酸的转运,而且与骨骼肌三酰甘油含量的增加有关。本实验以四种广东地方鸡种(清源麻鸡、杏花鸡、胡须鸡、霞烟鸡)、以及四川山地乌骨鸡、和大恒优质肉鸡共285个个体为研究对象,采用PCR-SSCP的方法对FATP1基因进行研究。通过对PCR产物测序,结合生产性能测定资料,分析了FATP1基因不同多态位点产生的不同基因型之间在屠宰性状的差异,从而找出FATP1基因与鸡屠宰性状之间的相关性,为鸡的标记辅助育种工作提供参考依据。研究结果表明,FATP1两个内含子和一个外显子分别存在着多态位点。通过最小二乘分析和显著性检验发现,对A位点,AA基因型和AB基因型及BB基因型间的腿肌重、活重、屠体重差异极显著。其余性状间差异显著。A等位基因对屠宰性状有正向的加性效应。其加性效应值分别为2.20g、3.51%、1.1g、3.76%、265.4g、54.06g,263.46g。对胸肌率和全净膛率有负的加性效应,AA基因型对腹脂重、胸肌重和腿肌重而言为优势基因型。对B位点而言,TT和TG基因型间的胸肌重、活重、胸肌重差异极显著。其余性状差异显著。综合T等位基因在基因频率上的优势性,则TT基因型对腿肌重和胸肌重优势明显,为优势基因型。对C位点而言,CC和CT和TT基因型间的胸肌重、腿肌重、屠体重差异显著(P＜0.05),其余性状间差异不显著(P＞0.05)。T基因对腹脂重、胸肌重、全净膛率、活重、屠体重、腿肌重,皮下脂肪厚度均有正向的加性效应。其值分别为1.38g、12.5g、0.6%、44.19g、79.4g、18.6g、0.06mm。对胸肌率有反向的加性效应,加性效应值0.31%,则TT基因型对腿肌重与胸肌重为优势基因型。

全文目录


摘要  5-6
Abstract  6-10
1 文献综述  10-14
  1.1 选题背景  10-11
  1.2 Fatp1基因的研究现状  11-13
    1.2.1 肪酸转运蛋白基因家族  11
    1.2.2 脂肪酸转运蛋白基因的结构  11-12
    1.2.3 脂肪酸转运蛋白基因的功能和表达  12
    1.2.4 脂肪酸转运蛋白基因的调控  12-13
  1.3 脂肪酸转运蛋白基因的研究现状  13
  1.4 本试验的目的和意义  13-14
2 材料与方法  14-23
  2.1 试验材料  14-17
    2.1.1 供试样本  14-15
    2.1.2 主要仪器设备  15
    2.1.3 试验试剂及其配制  15-17
  2.2 试验方法  17-21
    2.2.1 技术路线  17
    2.2.2 血样采集  17
    2.2.3 引物的设计  17-18
    2.2.4 基因组DNA的提取  18-19
    2.2.5 DNA浓度和纯度的检测  19
    2.2.6 PCR反应体系和条件  19-20
    2.2.7 PCR产物的检测  20
    2.2.8 PCR-SSCP分析及基因型判定  20-21
  2.3 数据统计分析  21-23
    2.3.1 遗传多态性分析  22
    2.3.2 统计分析  22
    2.3.3 各基因位点的遗传效应分析  22-23
3 结果与分析  23-33
  3.1 基因组DNA抽取结果  23
  3.2 鸡FATP1基因PCR扩增结果  23-24
    3.2.1 鸡FATP1基因片段Intron5A调控区PCR扩增结果  23
    3.2.2 鸡FATP1基因片段Intron6B调控区PCR扩增结果  23-24
    3.2.3 鸡FATP1基因片段Exon7C调控区PCR扩增结果  24
  3.3 PCR-SSCP多态性检测及其测序结果  24-26
    3.3.1 PCR-SSCP多态性检测结果  24-25
    3.3.2 基因型个体测序结果  25-26
  3.4 鸡FATP1基因遗传多态性分析  26-29
    3.4.1 鸡FATP1基因A位点遗传多态性分析  26-27
    3.4.2 鸡FATP1基因B位点遗传多态性分析  27-28
    3.4.3 鸡FATP1基因C位点遗传多态性分析  28-29
  3.5 鸡FATP1基因多态性与屠宰性状相关分析  29-33
    3.5.1 各品系鸡屠宰性状方差分析和多重比较结果  29-30
    3.5.2 鸡FATP1基因调控区SSCP多态性与屠宰性状的相关性分析  30-33
4 讨论  33-37
  4.1 试验素材的选择及实验条件的摸索  33-35
  4.2 候选基因的确定  35
  4.3 FATP1基因的遗传效应分析  35-36
  4.4 FATP1基因与性状的相关分析  36-37
5 结论  37-38
参考文献  38-43
致谢  43

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中图分类: > 农业科学 > 畜牧、动物医学、狩猎、蚕、蜂 > 家禽 > 鸡 > 遗传、育种
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