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人神经母细胞瘤系SK-N-SH侧群细胞基因表达的研究

作　者: 朱琳琳
导　师: 董岿然
学　校: 复旦大学
专　业: 儿科学
关键词: 神经母细胞基因芯片干细胞肿瘤转移
分类号: R739.4
类　型: 硕士论文
年　份: 2011年
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内容摘要

研究背景：神经母细胞瘤(neuroblastoma, NB).是小儿最常见的恶性实体瘤之一,占小儿恶性肿瘤的10%。约65%的患儿在发病时就有肿瘤转移,是复发、死亡的主要原因。故深入研究NB的转移机制至关重要。我们课题组对NB侧群细胞(side population, SP)的研究发现,侧群细胞具有干细胞特性且较非SP细胞具有更强的迁移、侵袭能力。在此基础上,我们试图从基因层面上探寻SP细胞具备此能力的原因,故我们选择研究神经母细胞瘤SP细胞与非SP细胞在基因表达方面的差异,以明确SP细胞在肿瘤转移中的作用,为NB的治疗寻找新的靶点。研究目的：SP(side population, SP)分析法从神经母细胞瘤SK-N-SH细胞株中分离出侧群细胞即肿瘤干细胞(cancer stem cell, CSC),采用肿瘤基因组寡核苷酸微阵列芯片,检测SP细胞与非SP细胞基因表达的差异,明确SP细胞与NB转移的相关性。材料与方法：培养人神经母细胞瘤系SK-N-SH,检测条件稳定后以流式细胞仪行SP细胞分选,染色条件为Hoechst5 uM终浓度,维拉帕米100μmol/L的终浓度水浴90分钟。SP及非SP细胞分选后,采用RNA表达谱芯片分别检测其基因表达情况,筛选出差异表达基因,并加以分析,明确SP细胞与肿瘤转移间的相关性。结果：在人类全基因组中,共筛选出差异基因位点53544个,其中表达上调2倍以上的基因有3453个,表达下调2倍以上的基因有1256个。之后我们采用Signal interaction network分析方法对差异基因进行基因网络分析,基于文献报道的相互作用基因,共发现322个基因产物功能相关。对所有表达差异在2倍以上的基因进行互相作用网络分析得到MAPK3/ERK1是差异基因关系网最关键的基因,其他的还包括MAPK14/p38a等。结论：1. MAPK信号转导通路关键组分MAPK3/ERK1、MAPK14/p38a在SP细胞中高表达；2. MAPK信号通路中的ERK及p38MAPK通路可能是SP细胞与肿瘤转移高相关性的关键分子通路；3. MAPK信号通路可能是潜在的抗肿瘤治疗靶点。

人神经母细胞瘤系SK-N-SH侧群细胞基因表达的研究

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