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湖桑种质资源遗传多样性分析及其核心种质初选

作　者: 吴项丹萍
导　师: 张林
学　校: 江苏科技大学
专　业: 生物化学与分子生物学
关键词: 湖桑 ISSR 遗传多样性 初选核心种质
分类号: S888.3
类　型: 硕士论文
年　份: 2011年
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内容摘要


太湖流域湖桑(Hu mulberry),是长江下游、太湖流域、苏浙两省的农家品种和地方品种的总称,也是我国桑树种质资源的重要组成部分,全国主要蚕区都有栽植。由于长期的自然选择和人工选择,已经形成了很多栽培品种,也形成了湖桑特有的植物学特征及生物学特性。湖桑所具有的共同特点为:树冠开展;枝条粗长,多直立,稍弯曲,侧枝少,皮色黄褐居多;叶基心形,全叶,叶形大,叶尖呈锐头;花果少。本文采用ISSR分子标记技术,开展了湖桑类型桑种质资源的遗传多样性分析及初选核心种质构建。这对于我国湖桑类型桑种质资源的DNA水平鉴定、遗传改良、分子辅助育种、重要农艺性状基因定位及保护都有重要的意义。本研究的主要内容如下:1、湖桑种质资源的遗传多样性分析应用ISSR分子标记技术对141份湖桑遗传多样性进行了分析。利用PopGene 32软件计算品种间的遗传相似系数,按UPGMA法对141份湖桑品种进行了聚类分析。12个引物共得到90条带,其中有57条具有多态性,占63.33%;遗传相似系数变异范围为0.6333～1.0000,平均观测等位基因数(NA)为1.6333,平均有效等位基因数(NE)为1.4163,Nei’s遗传多样性指数(H)为0.2360,Shannon’s信息指数(I)为0.3482。结果表明141份湖桑种质间的ISSR变异较大,多态性较高。聚类结果显示,湖桑品种可被明显的分为二大类4亚类。2、构建湖桑初选核心种质分别采用逐步聚类随机取样法和属性约简启发式算法对141份湖桑种质构建初选核心种质,获得了各46份和41份湖桑种质的初选核心种质,初选核心种质样本的比率分别为32.62%、29.08%。接着利用统计软件SPSS13.0,结合ISSR分子标记多态位点数、多态位点百分率、观测等位基因数、有效等位基因数、Nei’s遗传多样性指数和Shannon’s信息指数对两组初选核心种质群体进行分析和t检验。结果表明:所构建的46份和41份湖桑初选核心种质都能较好地代表初始群体的遗传多样性,但采用属性约简启发式算法所构建的41份的初选核心种质的代表性要高于采用逐步聚类随机取样法所构建的46份的初选核心种质;最终拟定41份的湖桑类型种质作为其初选核心种质。

全文目录


摘要  6-7
Abstract  7-13
第1章 绪论  13-27
  1.1 研究目的和意义  13-14
  1.2 研究方法  14-25
    1.2.1 分子标记  14-18
    1.2.2 分子标记在植物中的应用  18-21
    1.2.3 分子标记在桑树遗传多样性研究中的应用  21-22
    1.2.4 ISSR、SSR 分子标记的应用  22-23
    1.2.5 核心种质初选  23-25
  1.3 湖桑种质的研究现状  25-27
    1.3.1 湖桑概述  25
    1.3.2 湖桑代表品种性状  25-27
第2章 湖桑（Hu Mulberry）种质遗传多样性的ISSR 分析  27-49
  2.1 实验材料  27-34
  2.2 试剂和仪器  34-35
    2.2.1 试剂  34
    2.2.2 仪器  34
    2.2.3 溶液的配制  34-35
    2.2.4 植物基因组DNA 提取试剂盒  35
  2.3 桑树总DNA 的提取  35-36
    2.3.1 CTAB 法  35-36
    2.3.2 植物基因组DNA 提取试剂盒法（离心柱型）  36
  2.4 ISSR 标记  36-40
    2.4.1 引物设计  36-37
    2.4.2 ISSR 实验条件优化  37-38
    2.4.3 ISSR 最终优化扩增体系  38
    2.4.4 扩增程序  38-39
    2.4.5 引物筛选  39
    2.4.6 数据分析  39-40
  2.5 结果与分析  40-47
    2.5.1 ISSR 的多态性分析  40-44
    2.5.2 遗传多样性及聚类分析  44-47
  2.6 讨论与小结  47-49
第3章 湖桑（Hu Mulberry）初选核心种质的构建  49-57
  3.1 介绍  49
  3.2 材料与方法  49-51
    3.2.1 材料  49
    3.2.2 分析软件  49-50
    3.2.3 初选核心种质构建方法  50-51
    3.2.4 初选核心种质库数据分析  51
  3.3 结果与分析  51-55
    3.3.1 初选样本群的遗传多样性比较  51-52
    3.3.2 初选核心种质与初始种质的比较分析  52-54
    3.3.3 两组初选核心种质的比较分析  54-55
  3.4 讨论与小结  55-57
第4章 结论与展望  57-58
  4.1 结论  57
  4.2 展望  57-58
参考文献  58-63
攻读硕士期间论文发表情况  63-64
致谢  64-65
大摘要  65-69

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中图分类: > 农业科学 > 畜牧、动物医学、狩猎、蚕、蜂 > 蚕桑 > 桑 > 桑树品种及其繁育
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