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夏南牛和皮南牛微卫星标记研究及生长发育模型的建立

作 者: 刘博
导 师: 高腾云
学 校: 河南农业大学
专 业: 动物遗传育种与繁殖
关键词: 微卫星标记 夏南牛 皮南牛 遗传多样性 生长曲线
分类号: S823
类 型: 硕士论文
年 份: 2011年
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内容摘要


本试验利用24个微卫星座位多态性分析夏南牛和皮南牛的等位基因频率、基因杂合度、平均基因杂合度、多态信息含量、不同品种的优势等位基因和特有等位基因等。通过对皮南牛核心母牛群各年龄阶段体重、体尺指标测定,并对皮南牛体重、体尺性状建立回归模型,初步探讨皮南牛核心母牛群的生产性能。试验结果如下:1、根据体重(Y)与时间(t)的关系发现Bertalanffy方程拟合度最好,拟合的方程为:Y=505.644×(1-0.535×e-0.096t)32、根据体重(Y)与体高(X1)胸围(X2)体斜长(X3)坐骨宽(X4)管围(X5)的相关关系,利用SPSS多重线性回归分析得到回归方程为:Y=-857.846+0.201X1+6.317X2-2.307X3+0.054X4+29.936X53、采用24个微卫星标记在2个群体中进行遗传多样性分析,共检测到210个等位基因,平均每个位点检测到8.75个等位基因。表明2个群体的多态性丰富。4、计算了等位基因频率,并以等位基因频率为基础计算出平均杂合度、平均多态信息含量和平均有效等位基因数分别为0.8053、0.7780、5.82。结果显示2个群体的遗传变异大,遗传多样性丰富,所选位点均能提供较好的信息。5、找到2个群体的优势等位基因和特有等位基因,优势等位基因体现了群体的特种,而特有等位基因表明群体之间的差别。6、通过群体结构检测表明,所选用的24个位点在2个群体上大都处于哈代温伯格不平衡状态,经位点中性检后发现大多数位点不是中性位点。这可能与群体的数量、采样方式或选择、迁移、遗传漂零等有关。

全文目录


致谢  4-8中文摘要  8-9第一章 文献综述  9-16  1 夏南牛和皮南牛的概况  9    1.1 夏南牛  9    1.2 皮南牛  9  2 畜禽遗传多样性及其研究意义  9-10    2.1 家畜遗传多样性的含义  9-10    2.2 遗传多样性的研究方法  10    2.3 遗传多样性的研究意义  10  3 微卫星DNA 标记  10-14    3.1 微卫星DNA 的含义及其分布  10    3.2 微卫星位点的多态性及其遗传特点  10-11    3.3 微卫星标记的特性  11-12    3.4 微卫星标记在肉牛上的研究进展  12-14  4 动物生长模型的研究  14-16    4.1 生长模型的含义  14    4.2 动物生长曲线模型的种类及特点  14-15    4.3 生长曲线的作用  15-16第二章 引言  16-17第三章 皮南牛核心群母牛生长曲线的拟合  17-21  1 材料与方法  17-18    1.1 材料来源  17    1.2 拟合曲线方程  17-18    1.3 统计分析  18  2 结果与分析  18-19    2.1 Logistic、Gompertz、Von Bertalanfy 方程的参数估计  18-19    2.2 参数的标准误和置信区间估计  19  3 讨论和结论  19-21第四章 皮南牛核心母牛群体尺性状回归分析  21-26  1 材料与方法  21    1.1 材料  21    1.2 统计分析  21  2 结果与分析  21-24    2.1 各性状的表型统计量  21-22    2.2 表型相关分析  22    2.3 通径分析  22-23    2.4 表型相关系数的剖分  23-24    2.5 最优回归模型的建立  24  3 讨论与结论  24-26第五章 夏南牛、皮南牛群体遗传变异的微卫星DNA 标记研究  26-65  1 材料与方法  26-34    1.1 试验材料  26    1.2 主要仪器与设备  26    1.3 主要试剂与溶液的配制  26-28    1.4 基因组DNA 的提取  28-29    1.5 微卫星位点多态性检测  29-32    1.6 统计分析  32-34  2 结果与分析  34-60    2.1 牛基因组DNA 琼脂糖检测  34    2.2 PCR 扩增产物琼脂糖凝胶电泳  34-35    2.3 非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测  35-42    2.4 夏南牛和皮南牛微卫星位点等位基因及其基因频率  42-48    2.5 群体内遗传变异结果分析  48-60  3 讨论  60-65    3.1 关于取样及样本数量的问题  60    3.2 关于微卫星位点选取的问题  60-61    3.3 遗传多样性分析  61    3.4 关于DNA 提取过程中应该注意的问题  61    3.5 关于 PCR 扩增过程中的有关问题  61-62    3.6 对凝胶电泳的过程中的几个问题  62    3.7 关于凝胶电泳染色的几个问题  62-63    3.8 关于“影子带”问题  63    3.9 关于基因型判读的问题  63    3.10 关于群体内的遗传变异  63-65第六章 全文结论与展望  65-66  1 全文结论  65  2 展望  65-66参考文献  66-70ABSTRACT  70-71

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中图分类: > 农业科学 > 畜牧、动物医学、狩猎、蚕、蜂 > 家畜 >
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