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夏南牛和皮南牛微卫星标记研究及生长发育模型的建立
作 者: 刘博
导 师: 高腾云
学 校: 河南农业大学
专 业: 动物遗传育种与繁殖
关键词: 微卫星标记 夏南牛 皮南牛 遗传多样性 生长曲线
分类号: S823
类 型: 硕士论文
年 份: 2011年
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内容摘要
本试验利用24个微卫星座位多态性分析夏南牛和皮南牛的等位基因频率、基因杂合度、平均基因杂合度、多态信息含量、不同品种的优势等位基因和特有等位基因等。通过对皮南牛核心母牛群各年龄阶段体重、体尺指标测定,并对皮南牛体重、体尺性状建立回归模型,初步探讨皮南牛核心母牛群的生产性能。试验结果如下:1、根据体重(Y)与时间(t)的关系发现Bertalanffy方程拟合度最好,拟合的方程为:Y=505.644×(1-0.535×e-0.096t)32、根据体重(Y)与体高(X1)胸围(X2)体斜长(X3)坐骨宽(X4)管围(X5)的相关关系,利用SPSS多重线性回归分析得到回归方程为:Y=-857.846+0.201X1+6.317X2-2.307X3+0.054X4+29.936X53、采用24个微卫星标记在2个群体中进行遗传多样性分析,共检测到210个等位基因,平均每个位点检测到8.75个等位基因。表明2个群体的多态性丰富。4、计算了等位基因频率,并以等位基因频率为基础计算出平均杂合度、平均多态信息含量和平均有效等位基因数分别为0.8053、0.7780、5.82。结果显示2个群体的遗传变异大,遗传多样性丰富,所选位点均能提供较好的信息。5、找到2个群体的优势等位基因和特有等位基因,优势等位基因体现了群体的特种,而特有等位基因表明群体之间的差别。6、通过群体结构检测表明,所选用的24个位点在2个群体上大都处于哈代温伯格不平衡状态,经位点中性检后发现大多数位点不是中性位点。这可能与群体的数量、采样方式或选择、迁移、遗传漂零等有关。
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全文目录
致谢 4-8中文摘要 8-9第一章 文献综述 9-16 1 夏南牛和皮南牛的概况 9 1.1 夏南牛 9 1.2 皮南牛 9 2 畜禽遗传多样性及其研究意义 9-10 2.1 家畜遗传多样性的含义 9-10 2.2 遗传多样性的研究方法 10 2.3 遗传多样性的研究意义 10 3 微卫星DNA 标记 10-14 3.1 微卫星DNA 的含义及其分布 10 3.2 微卫星位点的多态性及其遗传特点 10-11 3.3 微卫星标记的特性 11-12 3.4 微卫星标记在肉牛上的研究进展 12-14 4 动物生长模型的研究 14-16 4.1 生长模型的含义 14 4.2 动物生长曲线模型的种类及特点 14-15 4.3 生长曲线的作用 15-16第二章 引言 16-17第三章 皮南牛核心群母牛生长曲线的拟合 17-21 1 材料与方法 17-18 1.1 材料来源 17 1.2 拟合曲线方程 17-18 1.3 统计分析 18 2 结果与分析 18-19 2.1 Logistic、Gompertz、Von Bertalanfy 方程的参数估计 18-19 2.2 参数的标准误和置信区间估计 19 3 讨论和结论 19-21第四章 皮南牛核心母牛群体尺性状回归分析 21-26 1 材料与方法 21 1.1 材料 21 1.2 统计分析 21 2 结果与分析 21-24 2.1 各性状的表型统计量 21-22 2.2 表型相关分析 22 2.3 通径分析 22-23 2.4 表型相关系数的剖分 23-24 2.5 最优回归模型的建立 24 3 讨论与结论 24-26第五章 夏南牛、皮南牛群体遗传变异的微卫星DNA 标记研究 26-65 1 材料与方法 26-34 1.1 试验材料 26 1.2 主要仪器与设备 26 1.3 主要试剂与溶液的配制 26-28 1.4 基因组DNA 的提取 28-29 1.5 微卫星位点多态性检测 29-32 1.6 统计分析 32-34 2 结果与分析 34-60 2.1 牛基因组DNA 琼脂糖检测 34 2.2 PCR 扩增产物琼脂糖凝胶电泳 34-35 2.3 非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测 35-42 2.4 夏南牛和皮南牛微卫星位点等位基因及其基因频率 42-48 2.5 群体内遗传变异结果分析 48-60 3 讨论 60-65 3.1 关于取样及样本数量的问题 60 3.2 关于微卫星位点选取的问题 60-61 3.3 遗传多样性分析 61 3.4 关于DNA 提取过程中应该注意的问题 61 3.5 关于 PCR 扩增过程中的有关问题 61-62 3.6 对凝胶电泳的过程中的几个问题 62 3.7 关于凝胶电泳染色的几个问题 62-63 3.8 关于“影子带”问题 63 3.9 关于基因型判读的问题 63 3.10 关于群体内的遗传变异 63-65第六章 全文结论与展望 65-66 1 全文结论 65 2 展望 65-66参考文献 66-70ABSTRACT 70-71
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中图分类: > 农业科学 > 畜牧、动物医学、狩猎、蚕、蜂 > 家畜 > 牛
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