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猪ADIPOR1、CTSF基因的多态性及其与部分经济性状相关性研究

作 者: 黄冬维
导 师: 张元跃
学 校: 湖南农业大学
专 业: 动物遗传育种与繁殖
关键词:  ADIPOR1基因 CTSF基因 生长性状 胴体性状 肉质性状
分类号: S828
类 型: 硕士论文
年 份: 2009年
下 载: 12次
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内容摘要


本研究利用12个品种/群体,包括外来品种杜洛克猪、大白猪、长白猪、杂种猪长大(LY)、大长(YL)、杜长大(DLY)和杜大长(DYL),中国地方品种宁乡猪、桃源猪、大围子猪、沙子岭猪、海南五指山猪共643头猪为研究对象,采用PCR-RFLP方法分析了ADIPOR1基因、CTSF基因的遗传多态性及基因频率和基因型频率,并对品种间基因型频率进行了卡方检验。同时,结合生长性能记录和屠宰性能记录,国内首次在猪上研究了ADIPOR1和CTSF因不同基因型对生长性状胴体性状肉质性状的遗传效应。主要结果如下:1 ADIPOR1基因1.1在湖南地方猪种大围子猪、沙子岭猪以及海南五指山猪中A等位基因为优势等位基因,而在宁乡猪、桃源猪中只发现一种基因型GG;在所有外来猪品种和杂交品种猪中G基因为优势等位基因,GG为优势基因型;除宁乡猪和桃源猪外其他品种/群体多态性均比较丰富。1.2在大白猪中,GG、AG基因型达100kg日龄分别比AA基因型低7.48%、7.46%且差异显著。在杜洛克猪中GG基因型达100kg日龄比AG基因型低5.99%,同时,GG、AG基因型能显著提高后腿比例,分别比AA基因型高8.98%、6.97%;选择GG基因型可能提高猪的生长性能。1.3在贮存损失性状上,GG基因型比AA基因型低25.2%;选择GG基因型可能减少贮存损失。2 CTSF基因2.1在中外品种中D基因为优势等位基因,在地方猪种、外来品种长白猪和杂交品种大长杂交猪中均未检测到CC基因型,宁乡猪中只发现了DD基因型。外来品种杜洛克和大白还有杂交猪中都检测到CC、CD、DD三种基因型,杜洛克和大白猪中的CD基因型为优势基因型。地方品种多态性不明显,而外来品种多态性较为丰富。2.2在大白猪中,CC基因型达100kg日龄比DD基因型低3.93%且差异显著(P<0.05),但在杜洛克猪中CC和DD基因型达100kg日龄差异不明显。在四月龄活体背膘厚性状上,CC基因型个体比DD基因型个体低9.49%(P<0.05);在杜洛克猪中,四月龄时100kg校正背膘厚指标上CC基因型比DD基因型高22.29%(P<0.05),但在六月龄脂率性状上CC基因型比DD和AD分别低30.145%(P<0.05)和35.656%(P<0.05);在瘦肉率性状上,CC基因型比DD高7.147%(P<0.05),表明CC基因型个体具有较薄的背膘厚和较高的瘦肉率,因而选CC基因型有提高瘦肉率的作用,等位基因C具有一定的正效应。本研究结果表明,ADIPOR1、CTSF基因有望作为生长、瘦肉率和肉质方面的一个主要候选基因或分子标记。

全文目录


摘要  4-6
Abstract  6-11
第一部分 文献综述  11-22
  1 前言  11
  2 ADIPOR1基因研究进展  11-18
    2.1 脂联素与脂联素受体(ADIPOR)  11-12
    2.2 ADIPOR1基因定位及结构  12
    2.3 ADIPOR1基因表达与调控  12-17
    2.4 ADIPOR1基因的遗传变异研究  17-18
  3 CTSF(Cathepsin F)基因研究进展  18-21
    3.1 Cathepsin(组织蛋白酶)家族组成及分类  18
    3.2 Cathepsin的结构和功能  18-20
    3.3 CTSF基因定位和结构  20
    3.4 CTSF基因表达及功能研究  20-21
  4 研究目的与意义  21-22
第二部分 材料与方法  22-29
  1 材料  22-23
    1.1 试验用与耳样  22
    1.2 主要仪器设备  22
    1.3 主要药品与试剂  22-23
    1.4 主要试剂配制  23
    1.5 主要分析及统计软件  23
  2 实验方法  23-29
    2.1 猪基因组DNA的提取  23-24
    2.2 基因组DNA的浓度测定和质量检测  24
    2.3 猪ADIPOR1、CTSF基因PCR扩增  24-26
    2.4 扩增产物的酶切  26
    2.5 琼脂糖凝胶电泳  26
    2.6 聚丙烯酰胺凝胶电泳  26-27
    2.7 基因型分析  27-28
    2.8 统计分析方法  28-29
第三部分 结果与分析  29-43
  1 基因遗传多态性及基因频率和基因型频率  29-35
    1.1 ADIPOR1基因的扩增和PCR-RFLP结果  29-30
    1.2 ADIPOR1基因(型)频率和群体分布  30-31
    1.3 ADIPOR1基因位点多态性分析  31-32
    1.4 CTSF基因的扩增和PCR-RFLP结果  32-33
    1.5 CTSF基因(型)频率和群体分布  33-34
    1.6 CTSF基因位点多态性分析  34-35
  2 ADIPOR1、CTSF基因对猪部分生长及活体胴体性状的影响  35-38
    2.1 ADIPOR1基因对猪部分生长性状的影响  35-36
    2.2 CTSF基因对猪部分生长性状的影响  36-37
    2.3 ADIPOR1、CTSF合并基因型对猪部分生长性状的影响  37-38
  3 ADIPOR1、CTSF基因对猪部分屠宰胴体性状的影响  38-40
    3.1 ADIPOR1基因对猪部分胴体性状的影响  38-39
    3.2 CTSF基因对猪部分胴体性状的影响  39
    3.3 ADIPOR1、CTSF合并基因型对猪部分胴体性状的影响  39-40
  4 ADIPOR1、CTSF基因对猪部分肉质性状的影响  40-43
    4.1 ADIPOR1基因对猪部分肉质性状的影响  40-41
    4.2 CTSF基因对猪部分肉质性状的影响  41-42
    4.3 ADIPOR1、CTSF合并基因型对猪部分胴体性状的影响  42-43
第四部分 讨论与结论  43-51
  1 实验样品和统计模型选择  43
  2 错配引物设计  43-44
  3 猪ADIPOR1、CTSF基因位点的遗传结构分析  44-46
    3.1 ADIPOR1基因多态位点的遗传结构分析  44-45
    3.2 CTSF基因多态位点的遗传结构分析  45-46
  4 ADIPOR1、CTSF基因与猪部分经济性状的相关性  46-49
    4.1 ADIPOR1基因与猪部分经济性状的相关性  46-47
    4.2 CTSF基因与猪部分经济性状的相关性  47-48
    4.3 ADIPOR1、CTSF合并基因型与猪部分经济性状的相关性  48-49
  5 标记辅助选择(MAS)  49-50
  6 结论  50-51
    6.1 ADIPOR1基因Hin6I酶切位点  50
    6.2 CTSF基因RsaI酶切位点  50
    6.3 ADIPOR1、CTSF基因合并基因型  50-51
参考文献  51-59
致谢  59-60
作者简历  60

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中图分类: > 农业科学 > 畜牧、动物医学、狩猎、蚕、蜂 > 家畜 >
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