学位论文 > 优秀研究生学位论文题录展示

东北地区家鸭地方品种和野鸭遗传多样性及系统发育研究

作　者: 赵天婵
导　师: 王海涛
学　校: 东北师范大学
专　业: 生命科学
关键词: 家鸭线粒体DNA D-loop区单倍型系统发育
分类号: Q951
类　型: 硕士论文
年　份: 2010年
下　载: 56次
引　用: 0次
阅　读: 论文下载

内容摘要

本实验采集东北地区5个家鸭品种,73个个体;6个地区的家鸭地方品种(采集地点包括黑龙江双鸭山、黑龙江哈尔滨、吉林洮南、吉林白山、辽宁铁岭和辽宁本溪)113个个体;8种野鸭(包括斑嘴鸭、绿头鸭、针尾鸭、赤颈鸭、赤膀鸭、凤头潜鸭、红头潜鸭和鹊鸭)53个个体;总计239个个体的组织或血液样本。通过采集鸭的组织和血液样本提取基因组DNA,测定鸭线粒体DNA D-loop区部分序列来研究东北地区家鸭和野鸭的遗传多样性与系统进化关系。本实验采用鸭线粒体DNA D-loop区约610bp片段进行分析。家鸭的分析结果表明,A、C、G、T这4种核苷酸的平均比例分别为24.6%、16.3%、34.2%和24.9%。共发现40个变异位点(包括绿头鸭和斑嘴鸭),约占分析位点总数的6.6%,插入/缺失位点3个;共确定29种单倍型,11种为共享单倍型;4个家鸭养殖品种和6个地区家鸭单倍型多样度从0.284至0.784,单倍型变异度总体为0.571±0.097,整体的平均核苷酸差异数为1.1561,核苷酸多样度为0.1898%。家鸭群体间核苷酸分析度(Dxy)在0.041%～0.508%之间变化,核苷酸净遗传距离(Da)为0～0.163%之间。结果显示,4个家鸭养殖品种和6个地区家鸭表现出较低水平的遗传多样性,遗传分化不显著。遗传多样性和亲缘关系分析表明,绿头鸭和斑嘴鸭在东北地区家鸭起源进化过程中均有贡献。8种野鸭的分析结果表明,A、C、G、T这4种核苷酸的平均比例分别为25.1%、16.8%、33.4%、24.7%。共发现144个变异多态位点,约占分析位点总数的23.6%;53个个体确定43个单倍型,单倍型多样度总体为0.9503±0.1105;整体的平均核苷酸差异数为4.465,平均核苷酸多样度为0.739%,范围在0.233%～1.533%。遗传多样性分析表明,东北地区8种野鸭的遗传多样性高,遗传资源丰富。

全文目录

摘要  5-6
英文摘要  6-9
1. 前言  9-15
  1.1 鸭的分类学及分子生物学研究进展  9-10
    1.1.1 家鸭的分类地位、起源与驯化  9
    1.1.2 鸭遗传多样性及系统发育研究进展  9-10
  1.2 动物遗传标记概述  10-11
    1.2.1 遗传多样性及其研究意义  10
    1.2.2 分子水平遗传多样性的研究方法  10-11
  1.3 线粒体DNA  11-14
    1.3.1 动物mtDNA 的结构  11-12
    1.3.2 鸟类mtDNA 的结构与一般脊椎动物mtDNA 结构的差别  12
    1.3.3 动物mtDNA 的遗传特征  12
    1.3.4 线粒体DNA 的遗传多样性  12-13
    1.3.5 目前对鸭mtDNA 遗传多样性的研究现状  13-14
  1.4 本研究的目的及意义  14-15
2. 东北地区家鸭MTDNA D-LOOP 部分序列遗传多样性研究  15-27
  2.1 材料和方法  15-18
    2.1.1 实验材料  15-16
      2.1.1.1 鸭品种采样和来源  15-16
      2.1.1.2 主要仪器设备  16
      2.1.1.3 药品和试剂  16
    2.1.2 实验方法  16-17
      2.1.2.1 样品采集  16
      2.1.2.2 DNA 的提取  16-17
      2.1.2.3 DNA 目的片段扩增  17
      2.1.2.4 DNA 扩增产物的电泳检测  17
      2.1.2.5 序列的测定  17
    2.1.3 数据处理  17-18
  2.2 结果与分析  18-25
    2.2.1 4个家鸭品种和东北本地鸭的mtDNA D-loop 区部分序列的遗传多样性  18-22
      2.2.1.1 mtDNA D-loop 区部分序列的长度与碱基组成  18
      2.2.1.2 mtDNA D-loop 区部分序列的核苷酸多态位点  18-20
      2.2.1.3 mtDNA D-loop 区部分序列的核苷酸多态位点的变异类型统计  20
      2.2.1.4 mtDNA D-loop 区部分序列的单倍型情况  20-22
    2.2.2 4个家鸭品种和东北本地鸭mtDNA D-loop 区部分序列的遗传结构  22-25
      2.2.2.1 单倍型多样度和核苷酸多态性  22-23
      2.2.2.2 mtDNA D-loop 区部分序列的核苷酸分歧度  23
      2.2.2.3 系统发育关系  23-25
  2.3 讨论  25-26
    2.3.1 mtDNA D-loop 区部分序列的变异与核苷酸多样度  25
    2.3.2 遗传距离  25-26
    2.3.3 系统发育关系探讨  26
  2.4 结论  26-27
3 8种野鸭MTDNA D-LOOP 部分序列遗传多样性研究  27-37
  3.1 材料和方法  27
    3.1.1 样品采集和来源  27
    3.1.2 实验方法  27
    3.1.3 数据处理  27
  3.2 结果与分析  27-36
    3.2.1 mtDNA D-loop 区部分序列的遗传多样性  27-32
      3.2.1.1 mtDNA D-loop 区部分序列长度与碱基组成  27-28
      3.2.1.2 mtDNA D-loop 区部分序列的核苷酸位点变异  28-32
    3.2.2 mtDNA D-loop 区部分序列的遗传结构  32-36
      3.2.2.1 单倍型多样度和核苷酸多态性  32-33
      3.2.2.2 mtDNA D-loop 区部分序列的核苷酸分歧度  33-34
      3.2.2.3 系统发育关系  34-36
  3.3 讨论  36
    3.3.1 遗传多样性  36
    3.3.2 系统发育关系探讨  36
  3.4 结论  36-37
参考文献  37-42
致谢  42

东北地区家鸭地方品种和野鸭遗传多样性及系统发育研究

内容摘要

全文目录

相似论文