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珊瑚共附生可培养真菌菌群多样性及其生物活性研究
作 者: 徐佳
导 师: 雷晓凌
学 校: 广东海洋大学
专 业: 水产品加工及贮藏工程
关键词: 珊瑚 共附生真菌 系统发育分析 抗菌活性 酶抑制活性 筛选
分类号: R284
类 型: 硕士论文
年 份: 2011年
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内容摘要
本文从广东徐闻珊瑚礁国家级自然保护区采集8种珊瑚,用培养法分离纯化真菌,应用形态学观察与分子鉴定相结合的方法,进行珊瑚共附生真菌菌群多样性研究,并对分离的真菌菌株进行生物活性筛选。运用稀释平板法和基于internal transcribed spacer-rDNA (ITS-rDNA)基因序列的系统发育分析对珊瑚共附生可培养真菌多样性进行研究,将所得到的基因序列与NCBI数据库GenBank的序列进行相似性比较并构建系统发育树。实验中从8种珊瑚表面和内部共分离得到97株菌落形态各异的真菌。ITS-rDNA序列分析及形态学鉴定表明,珊瑚共附生真菌主要包括曲霉菌Aspergillus sp.、枝孢霉菌Cladosporium sp.、炭角菌Xylariales sp.、青霉菌Penicillium sp.、葡萄穗霉菌Stachybotrys sp.、赤霉菌Gibberella moniliformis、镰刀霉菌Fusarium sp.等。分离得到的菌株中,4-13与GenBank中已报道的基因序列的相似性仅为89%,可能是潜在的新属种。选取04丛生盔形珊瑚(Galaxea fascicularis)共附生可培养真菌进行抑菌活性和酶抑制活性筛选。采用96孔板培养法结合酶标仪测定。以6种常见的致病菌或致食品腐败的细菌为指示菌,对其共附生真菌次级代谢产物进行抗菌活性筛选,对抗菌能力及抗菌谱进行研究。结果表明:19株真菌均具有不同程度的抗菌活性。高活性菌株占52.63%,其中4-4、4-5两菌株表现出良好的抗菌活性。在酶抑制性实验中,有10株真菌对一种或两种酶具有抑制活性,其中曲霉属真菌效果良好,散囊属真菌4-12、枝孢霉4-20对乙酰胆碱酯酶的抑制效果超过了阳性对照石杉碱甲。粗提物样品对α-葡萄糖苷酶、乙酰胆碱酯酶有较好的抑制活性,说明具有抗老年痴呆、抗高血压活性。这对新药的研究开发提供了一定的理论基础,具有进一步的研究价值。结果表明,珊瑚共附生可培养真菌多样性较为丰富,潜在新的微生物菌种资源,并具有较好的生物活性,因此珊瑚共附生真菌具有良好的应用潜力和综合开发前景。
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全文目录
摘要 6-7Abstract 7-101 绪论 10-18 1.1 海洋真菌研究概况 10-14 1.1.1 海洋真菌的定义及其多样性 10 1.1.2 微生物群落多样性的研究方法 10-12 1.1.3 海洋真菌活性物质 12-14 1.1.4 海洋微生物活性物质的筛选 14 1.2 珊瑚及珊瑚共附生真菌 14-16 1.2.1 珊瑚生物学特性 14-15 1.2.2 珊瑚共附生微生物 15-16 1.3 本课题主要研究内容 16-18 1.3.1 研究目的和意义 16-17 1.3.2 主要技术路线 17-182 珊瑚共附生真菌的分离及形态学观察 18-31 2.1 材料 18-19 2.1.1 样品来源 18-19 2.1.2 培养基 19 2.1.3 海水 19 2.2 主要实验仪器与设备 19-20 2.3 实验方法 20 2.3.1 样品处理方法 20 2.3.2 珊瑚共附生真菌分离 20 2.3.3 菌株保存 20 2.3.4 样品编号 20 2.3.5 珊瑚共附生真菌形态学观察 20 2.4 结果与分析 20-29 2.4.1 珊瑚共附生真菌的分离 20-21 2.4.2 不同培养基上珊瑚共附生真菌的分离 21 2.4.3 样品中珊瑚共附生真菌的分布及种属 21-22 2.4.4 形态学观察 22-29 2.5 小结与讨论 29-31 2.5.1 本章小结 29 2.5.2 讨论 29-313 04 丛生盔型珊瑚共附生真菌的ITS 序列分析 31-39 3.1 材料 31-32 3.1.1 菌株来源 31 3.1.2 主要试剂 31-32 3.2 主要仪器 32 3.3 实验方法 32-34 3.3.1 DNA 提取 32 3.3.2 扩增ITS-rDNA 的引物 32 3.3.3 ITS-rDNA 扩增 32-33 3.3.4 PCR 产物检测 33 3.3.5 ITS-rDNA 序列分析 33 3.3.6 种群多样性分析 33-34 3.4 结果与分析 34-37 3.4.1 ITS 扩增产物的电泳图谱 34 3.4.2 丛生盔型珊瑚共附生真菌的多样性分析 34 3.4.3 丛生盔型珊瑚共附生真菌的系统发育学分析 34-37 3.5 小结与讨论 37-39 3.5.1 本章小结 37 3.5.2 讨论 37-394 04 丛生盔型珊瑚共附生真菌发酵粗提物生物活性筛选 39-46 4.1 材料 39 4.1.1 菌株来源 39 4.1.2 培养基 39 4.1.3 指示菌 39 4.1.4 主要试剂 39 4.2 主要仪器 39-40 4.3 实验方法 40-43 4.3.1 珊瑚共附生真菌次级代谢产物粗提物制备 40-42 4.3.2 抑菌实验 42 4.3.3 酶抑制性实验 42-43 4.4 结果与分析 43-45 4.4.1 抗菌活性菌株初筛选 43 4.4.2 活性菌株的抗菌能力比较 43-44 4.4.3 粗提物的酶抑制活性 44-45 4.5 小结与讨论 45-46 4.5.1 本章小结 45 4.5.2 讨论 45-465 结论与展望 46-47 5.1 结论 46 5.2 展望 46-47参考文献 47-53附录:构建系统发育树的19 株菌株的ITS 测序序列 53-60致谢 60-61作者简历 61导师简介 61
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中图分类: > 医药、卫生 > 中国医学 > 中药学 > 中药化学
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