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舟山群岛四个养殖獐种群遗传多样性和遗传结构的ISSR分析
作 者: 林杰君
导 师: 鲍毅新
学 校: 浙江师范大学
专 业: 生态学
关键词: 舟山 獐 ISSR 遗传多样性 遗传结构
分类号: S865
类 型: 硕士论文
年 份: 2012年
下 载: 44次
引 用: 1次
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内容摘要
獐(Hydropotes inermis)是我国二级重点保护动物,由于其具有较高的食用和药用价值,致使种群受到了严重的威胁。养殖獐成为近年来的一个热点,对养殖条件下獐的遗传特征进行研究,不仅能了解在养殖条件下獐的遗传现状,也可为以后繁殖育种提供理论支持。本文便利用简单重复序列间区(inter-simple sequence repeat, ISSR)分子标记技术,对来自舟山群岛4个獐养殖种群的遗传多样性和遗传结构进行了分析。在对獐进行ISSR-PCR反应体系优化中,在原有的基础上,发现扩增的循环次数为35个时,得到的产物效果最好,并成功的选择出26条可用于獐遗传学研究的ISSR引物。26条ISSR引物共扩增出286个可分析位点,其中多态性位点为184个,多态位点百分比(PPL)为64.34%。獐物种水平上的Nei’s遗传多样性指数(H)为0.210,Shannon’s多态信息指数(Ⅰ)为0.318,各种群的H介于0.157-0.190之间,Ⅰ在0.228-0.278之间,其遗传多样性较为丰富,这可能与其种,源来自野外且养殖时间不久有关。Structure软件分析结果显示,所有个体根据遗传信息的不同可以被分为4个组群,每个养殖场内的个体基本上都在各自独立的组群中,这与地理区域的划分相似。种群间的遗传分化系数Gst (Gst=1-Hs/Ht)为0.163,AMOVA分析结果与此类似,说明各养殖场獐种群间在遗传上已表现出了一定的差异。同时,为了进一步了解各种群间的遗传关系,我们计算了各种群间的Nei’s遗传距离并对其进行UPGMA聚类,结果显示:秀山种群(XS)和舟山种群(ZS)先聚在了一起,其次与岱山种群(DS)相聚,最后和朱家尖种群(ZJJ)相聚。结合以往的研究结果及各养殖场的地理分布信息,我们认为,舟山獐种群的遗传多样性虽然较为丰富,但己出现较大程度的遗传分化现象。因此,我们建议各养殖场需加强不同岛屿种群间个体的交流,特别是朱家尖种群(ZJJ)与其它种群间的交流。同时,本研究也推广了ISSR分子标记在动物遗传研究中的应用。
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全文目录
摘要 3-4 Abstract 4-6 目录 6-8 第一章 绪论 8-24 1 獐的研究现状 8-10 2 獐的饲养繁殖 10-11 3 ISSR研究现状 11-24 3.1 ISSR标记的基本原理 14-16 3.2 ISSR技术要点 16-18 3.3 ISSR技术在动物遗传结构研究中的应用 18-22 3.4 ISSR分子标记应用展望 22-24 第二章 实验材料与方法 24-30 1 实验材料 24 2 舟山群岛概况 24-25 3 实验仪器、试剂及其来源 25-26 3.1 实验仪器 25-26 3.2 实验试剂 26 4 实验方法 26-30 4.1 溶液配制 26-27 4.2 肌肉组织DNA提取 27-28 4.3 ISSR-PCR反应及引物筛选 28-29 4.4 数据统计与分析 29-30 第三章 结果与分析 30-46 1 DNA提取 30 2 ISSR-PCR扩增循环次数 30-31 3 ISSR引物筛选 31-32 4 26条引物在4个种群中的扩增结果 32-36 5 4个獐种群的遗传多样性 36-37 6 4个獐种群遗传结构分析 37-44 7 獐种群间的遗传距离和遗传相似度 44-46 第四章 讨论 46-51 1 獐种群遗传多样性分析 46-47 2 獐种群遗传结构及遗传关系分析 47-49 3 獐保护建议 49-51 参考文献 51-65 致谢 65-66 硕士在读期间发表的文章 66-67 硕士期间参加的项目 67-68
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中图分类: > 农业科学 > 畜牧、动物医学、狩猎、蚕、蜂 > 狩猎、野生动物驯养 > 各种野生动物驯养
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