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梅花草属DNA条形码研究及其系统发育分析

作　者: 王义平
导　师: 吴丁; 卢金梅
学　校: 江西农业大学
专　业: 植物学
关键词: DNA条形码梅花草属物种鉴定系统发育
分类号: Q943
类　型: 硕士论文
年　份: 2012年
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内容摘要

DNA barcoding是利用标准的DNA序列来达到鉴定物种的目的技术。本研究选取了43个种共133份样品,对通用标记(rbcL、matK、trnH-psbA和ITS)进行序列检测和分析。主要结果如下：1)四个条码片段都有100%的引物通用性和90%以上的测序成功率2)在单片段条码中,trnH-psbA具有高的物种分辨率(29/36),其次为ITS(28/36),matK(23/38)和rbcL(14、37)。3)国际生物条形码联盟推荐rbcL+matK的物种分辨率较低(26/37),而ITS+trnH-psbA具有高的物种分辨率(31/34),高于任何其他组合,可作为梅花草属植物鉴定的条码。梅花草属是一个多年生的小草本属,由于本属植物经历的进化机制复杂,形态性状不稳定,种间地理分化不明显,属分类学研究的疑难类群之一。基于DNA条形码分子数据构建系统树,可重建梅花草属不同物种间系统发育关系。DNA条形码和形态分类数据综合分析表明：1)梅花草属的单系性得到进一步确定。2)退化雄蕊的特征可能是多次发生的结果,不同的类群间存在平行演化。3)根据退化雄蕊特征作为属下分组的主要依据值得进一步研究,茎生叶及其形态对组的划分具有重要的分类价值。

全文目录

摘要  5-6
ABSTRACT  6-7
引言  7-8
第一章研究综述  8-14
  1.1 DNA条形码研究现状  8-11
    1.1.1 DNA条形码技术的研究进展  8-9
    1.1.2 DNA条形码技术的原理与应用  9
    1.1.3 DNA条形码技术的工作流程与分析方法  9-11
  1.2 梅花草属的研究现状  11-12
    1.2.1 国内外研究简史  11
    1.2.2 研究现状与分析  11-12
  1.3 研究的目的及意义  12-14
    1.3.1 研究目的  12-13
    1.3.2 研究意义  13-14
第二章材料与方法  14-20
  2.1 样品采集  14-17
  2.2 总DNA提取  17-18
  2.3 基因片段选用和PCR扩增  18
  2.4 基因测序  18-19
  2.5 数据分析  19-20
第三章结果与分析  20-29
  3.1 PCR扩增与测序  20
  3.2 基因变异性分析  20-21
  3.3 种内种间遗传距离分析  21-23
  3.4 正确鉴定率  23-29
第四章讨论  29-36
  4.1 DNA条码技术的应用与展望  29-30
  4.2 梅花草属的单系性及种间关系  30-31
  4.3 梅花草属的系统发育重建  31-36
第五章结论  36-37
参考文献  37-41
攻读学位期间发表的学术论文  41-42
致谢  42

梅花草属DNA条形码研究及其系统发育分析

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