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五倍子蚜DNA序列分子系统发育关系

作　者: 安淼
导　师: 任竹梅
学　校: 山西大学
专　业: 遗传学
关键词: 五倍子蚜 DNA序列 mtDNA基因 EF-1α基因 系统发育
分类号: S899.4
类　型: 硕士论文
年　份: 2011年
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内容摘要


五倍子蚜属于半翅目Hemiptera蚜总科Aphididae瘿绵蚜科Pemphiginae,是一类专性寄生在盐肤木属植物上的蚜虫。这类蚜虫在第一寄主上形成的虫瘿特称为五倍子,是主产于我国的名贵中药和工业原料。目前对五倍子蚜的分类主要是依据形态学特征、虫瘿形态以及第一寄主植物的不同来进行的研究,基于DNA序列的分子系统发育研究还比较少见。本研究测定了五倍子蚜6属12种(含4亚种)mtDNA COI、tRNA/COII和Cyt b基因以及核DNA EF-1α基因各1202bp、853bp和433bp以及1100bp,共计3298bp长的序列。用MP、ML和BI法分别构建倍蚜单一基因和联合基因分子系统发育关系,综合分析得到以下结果：1.本研究支持五倍子蚜为一单系群,倍蚜属Schlechtendalia为较原始的类群。五倍子蚜的六个属中各个种(亚种)基本上以很高的置信度分别单独聚在一起,形成了六个稳定的聚类簇,较好的支持了传统的分类结果。2.圆角倍蚜N. ibofushi以很高的置信度聚在了倍蚜属Schlechtendalia内,而没有与圆角倍蚜属的另两个种--倍花蚜N. shiraii和红倍花蚜N. yanoniella聚在一起；圆角倍蚜与倍花蚜和红倍花蚜的虫瘿形态特征彼此相差甚远,而与倍蚜属相似,结合形态学特征本研究认为圆角倍蚜应该划分至倍蚜属。3.北美属Melaphis聚在了五倍子蚜的类群之内,结合其分布特点认为五倍子蚜应起源于亚洲。4.在铁倍蚜属Kaburagia各亚种中,肚倍蚜和蛋铁亚种关系较近,然后依次与枣铁亚种和蛋肚亚种相聚,分支的置信度较高,聚类拓扑结构比较稳定,但与前人研究不完全一致,故铁倍蚜属各亚种的关系尚需深入研究。5.聚类树结果显示属间分支的置信度不高,彼此之间呈平行式分布,属间关系尚未得到解决。

全文目录


中文摘要  8-9ABSTRACT  9-11第一章 前言  11-17  1.1 五倍子蚜概述  11-13  1.2 分子系统学概述  13-15    1.2.1 分子系统学常用分析方法  13-14    1.2.2 分子系统树检验  14-15  1.3 五倍子蚜系统发育研究进展  15-16  1.4 本研究目的和意义  16-17第二章 材料与方法  17-23  2.1 实验材料  17-18    2.1.1 样本材料  17-18    2.1.2 实验仪器及试剂  18  2.2 实验方法  18-23    2.2.1 基因组DNA提取和检测  18-19    2.2.2 PCR扩增和检测  19-20    2.2.3 PCR产物纯化和测序  20    2.2.4 数据分析  20-23第三章 结果与分析  23-39  3.1 基因组DNA提取、PCR扩增和测序  23  3.2 序列编辑和分析  23-29    3.2.1 碱基组成  24-26    3.2.2 碱基替换  26-27    3.2.3 密码子使用偏好与氨基酸组成  27-29  3.3 五倍子蚜系统发育分析  29-39    3.3.1 单个基因序列系统发育分析  29-36    3.3.2 联合基因序列系统发育分析  36-39第四章 讨论  39-45  4.1 基因组DNA提取、PCR扩增和测序  39  4.2 序列碱基组成分析  39  4.3 五倍子蚜系统发育关系  39-45    4.3.1 属间关系  39-40    4.3.2 种(亚种)间系统发育关系  40-41    4.3.3 圆角倍蚜Nurudea ibofushi的系统发育位置  41-42    4.3.4 北美种Melaphis rhois的系统发育位置  42-45第五章 小结  45-47参考文献  47-52攻读学位期间取得的研究成果  52-53致谢  53-54个人简况及联系方式  54-56

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中图分类: > 农业科学 > 畜牧、动物医学、狩猎、蚕、蜂 > 养蜂、益虫饲养 > 益虫饲养 > 五倍子
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