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杨属AFLP遗传多样性研究和杨树品种分子指纹图谱构建

作 者: 宋红竹
导 师: 张绮纹
学 校: 中国林业科学研究院
专 业: 林木遗传育种
关键词: 杨属(Populus) 五大派 AFLP标记 SCAR标记 遗传多样性 指纹图谱 品种鉴定
分类号: Q943
类 型: 博士论文
年 份: 2006年
下 载: 608次
引 用: 3次
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内容摘要


本研究从我国北京、山东、内蒙古、新疆、河南和黑龙江省等地收集了杨属的黑杨派、白杨派、青杨派、大叶杨派和胡杨派五大派的18个种共44份材料,其中黑杨派28份、青杨派和白杨派各5份、胡杨派和大叶杨派各1份、派间杂种4份,利用AFLP分析方法,开展了以下几个部分的研究内容并取得了初步结果: 1.首次将AFLP分析用于杨属五大派遗传分化研究 本研究建立了杨属五大派AFLP标记分析系统,首次对包含黑杨派、青杨派、白杨派、胡杨派和大叶杨派等五大派18个种的全部44份杨树材料进行分析,杨属44份材料的AFLP分析结果与其形态学数据、地理分布及来源基本一致。 聚类分析结果表明,44份杨树材料可以分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ四个组,Ⅰ组只包括大叶杨派的大叶杨,Ⅱ组只有胡杨派的胡杨,Ⅲ组为同属于白杨派的银白杨、山杨、新疆杨、毛白杨、河北杨等5份材料,Ⅳ组包括黑杨派、青杨派及派内、派间杂种等37份材料。结果表明,白杨派、胡杨派、大叶杨派被聚类在不同组,说明它们的亲缘关系较远,这符合传统的表型形态的分类结果,而青杨派、黑杨派和黑杨派内的杂交种以及派间杂种聚在了一组,说明青杨派和黑杨派的亲缘关系较近。 在相似系数为“0.85”的水平上,Ⅳ组又分为A、B、C、D等4个小组,黑杨派美洲黑杨4个无性系与欧洲黑杨4个无性系分别聚在了D小组和B小组,欧美杨20个无性系被聚在了A小组和C小组内,其中C小组由107杨、108杨等10个欧美杨无性系组成,而Ⅰ-214杨和沙兰杨等10个欧美杨无性系聚在了A组,A小组由19份材料组成,其中有青杨派5个种、欧美杨10个无性系、黑杨派与青杨派派间杂种3个、黑杨派与白杨派派间杂种1个。青杨派滇杨在相似系数为0.856时与大青杨、青杨、甜杨、小叶杨等其它4个种分开,白杨派新疆杨在相似系数为0.848时与银白杨、山杨、毛白杨、河北杨等其它4个种分开。 2 首次在杨树上将AFLP标记成功地转换为SCAR标记 利用AFLP标记M-CTC/E-AG374特异条带,根据欧美杨108杨特异片段的碱基序列,设计了一对特异性引物,对杨属44份材料重新进行PCR扩增,获得了大小正确的特异性片段。结果表明,将杨属AFLP标记成功地转换为SCAR标记,可用于108杨品种鉴定和以其作亲本的常规杂交育种工作。

全文目录


摘要  4-6
ABSTRACT  6-8
ABBREVIATIONS  8-9
目录  9-12
1 引言  12-44
  1.1 杨属传统分类和遗传分化  13-16
    1.1.1 杨属传统分类各派地理分布  13-15
    1.1.2 杨属遗传多样性和传统遗传分化  15-16
  1.2 分子标记技术的发展概况  16-30
    1.2.1 分子标记的种类和方法  18-28
    1.2.2 分子标记的比较  28-30
  1.3 分子标记在杨树遗传育种中的应用研究  30-40
    1.3.1 遗传图谱的构建和数量性状位点定位(QTL)研究  30-33
    1.3.2 分子标记辅助选择育种(MAS)  33-34
    1.3.3 群体遗传学研究  34-36
    1.3.4 系统发育研究  36-37
    1.3.5 种间亲缘关系及分类研究  37-38
    1.3.6 无性系指纹图谱的绘制  38-40
  1.4 本研究的目的和意义  40-42
  1.5 研究内容和技术路线  42-44
    1.5.1 研究内容  42-43
    1.5.2 技术路线  43-44
2 杨属五大派的AFLP分析  44-66
  2.1 前言  44-46
  2.2 材料和方法  46-53
    2.2.1 材料  46
    2.2.2 实验设备及试剂  46
    2.2.3 DNA的提取、纯化和定量  46-48
    2.2.4 AFLP分析  48-53
    2.2.5 数据处理和统计分析  53
  2.3 结果与分析  53-62
    2.3.1 杨树基因组 DNA模板的制备  53-54
    2.3.2 AFLP分析体系的建立  54-57
    2.3.3 遗传相似系数  57-61
    2.3.4 聚类分析  61
    2.3.5 指纹图谱  61-62
  2.4 讨论与小结  62-66
    2.4.1 将 AFLP分析首次用于杨属五大派遗传分化研究  62-63
    2.4.2 黑杨派、青杨派、白杨派间的遗传分化  63-64
    2.4.3 派内种间和种内无性系间的遗传分化  64-66
3 AFLP标记SCAR标记的转换  66-75
  3.1 前言  66-67
  3.2 材料和方法  67-70
    3.2.1 材料  67
    3.2.2 AFLP标记片段的回收与克隆  67-69
    3.2.3 AFLP标记向SCAR标记的转换  69-70
  3.3 结果与分析  70-73
    3.3.1 AFLP标记片段的克隆  70-72
    3.3.2 SCAR引物的设计及 PCR特异扩增  72-73
  3.4 讨论与小结  73-75
4 品种指纹图谱的构建和 DNA分子鉴定  75-85
  4.1 前言  75-76
  4.2 材料与方法  76-78
    4.2.1 材料  76-77
    4.2.2 主要试剂  77
    4.2.3 苗期表型形态的调查  77
    4.2.4 AFLP分析和数据的转化  77-78
    4.2.5 行业标准的制订  78
  4.3 结果与分析  78-83
    4.3.1 品种苗期表型形态的鉴别  78-81
    4.3.2 指纹图谱的构建  81-82
    4.3.3 特征带与品种分子鉴定  82
    4.3.4 行业标准的起草  82-83
  4.4 讨论与小结  83-85
5 结论  85-88
  5.1 首次将 AFLP分析用于杨属五大派遗传分化研究  85-86
    5.1.1 黑杨派、青杨派、白杨派间的遗传分化  85
    5.1.2 派内种间和种内无性系间的遗传分化  85-86
  5.2 首次在杨树上将 AFLP标记成功地转换为 SCAR标记  86
  5.3 首次开展我国杨树品种分子指纹图谱鉴定研究  86
  5.4 首次在林业上制订品种分子指纹图谱鉴定的行业标准  86-88
参考文献  88-104
附录一 杨树品种表型形态图片  104-114
附录二 行业标准《杨树叶片品种鉴定实验方法 DNA扩增片段长度多态性法》  114-124
致谢  124-126
博士在读期间发表论文  126

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中图分类: > 生物科学 > 植物学 > 植物细胞遗传学
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