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中国大头蛙群系统关系研究及大头蛙和脆皮大头蛙线粒体全基因组测序

作　者: 张际峰
导　师: 聂刘旺
学　校: 安徽师范大学
专　业: 生态学
关键词: 大头蛙 12S 和16S rRNA 基因系统进化线粒体基因组全序列
分类号: Q958.1
类　型: 硕士论文
年　份: 2005年
下　载: 175次
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内容摘要

本文由文献综述和研究报告两个部分组成一、文献综述对大头蛙属动物和大头蛙属分类地位的相关研究进行了概述,包括大头蛙属中国产大头蛙三个物种的形态、习性、分类及细胞生物学和核酸水平的研究。发现大头蛙属动物染色体数目出现多样性,及Emerson et al.(2000)和Evans et al. (2003)将采集的大头蛙属30 多个种暂分为四大群,其中,中国大头蛙群只列出了台湾产大头蛙一种。二、研究论文1、分别测定了福建大头蛙5 个居群、大头蛙2 个居群和脆皮大头蛙1 个居群的多个个体12S 和16S rRNA 部分基因,选取每个居群内序列差异大于0.5%的两条序列,采用NJ 法和MP 法,构建了大头蛙属中国大头蛙群各居群间的系统进化树;从Genbank 中下载了30 多个大头蛙属其他物种的相应序列,以近源种泽陆蛙、虎纹蛙、倭蛙、棘蛙为外群,采用MP 法和ML 法重建了大头蛙属分子系统树。结果表明:中国大头蛙群三个种均为有效种;支持费梁对大头蛙属中国大头蛙群的划分;推测中国大头蛙群为大头蛙属的“第五群”。2、将已测定的泽陆蛙、黑斑蛙、非洲爪蟾的mt DNA 全序列进行软件比较分析,设计了20 对引物,对大头蛙属大头蛙(产于云南)进行了全序列的扩增、测序和拼接,获得大头蛙线粒体基因组全序列并进行生物信息学分析。大头蛙线粒体基因组全序列全长为16 867bp,并登陆GenBank,登陆号为:AY899241。运用DNASTAR、Sequin3.0、tRNA Scan-SE1.21 等软件,对其进行了各基因定位,发现大头蛙线粒体基因组包括19 个tRNA 基因、2 个rRNA 基因、13 个蛋白质编码基因和1 个D-loop 区。在定位的19 个tRNA 基因中,有两个重复拷贝的tRNA-Met;与一般脊椎动物线粒体相比,有4 个tRNA 基因缺失,其中编码tRNA-Cys 和tRNA-Glu 基因的相应序列突变成了假基因,如此多的基因缺失在脊椎动物中还是首次报道;同时发现tRNA-Ser (AGY)、ND5 和ND6 三个基因间

全文目录

第一部分文献综述  9-19
  第一章大头蛙的研究进展  9-19
    1 大头蛙属动物的分类地位  9-17
    参考文献  17-19
第二部分研究报告  19-66
  第二章中国大头蛙群分子系统学研究  19-35
    1 材料和方法  20-23
    2 结果与分析  23-30
    3 讨论  30-33
    参考文献  33-35
  第三章大头蛙线粒体基因组全序列的测定与基因分析  35-51
    1 材料与方法  35-38
    2 结果与分析  38-46
    3 讨论  46-49
    参考文献  49-51
  第四章脆皮大头蛙线粒体基因组全序列的测定与基因分析  51-66
    1 材料与方法  51-52
    2 结果与分析  52-61
    3 讨论  61-64
    参考文献  64-66
附录:部分验证工作的引物图、电泳结果图和测序彩图  66-73
致谢  73-74
附:硕士期间已发表论文及获奖情况一览表  74

中国大头蛙群系统关系研究及大头蛙和脆皮大头蛙线粒体全基因组测序

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