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扬子鳄保护遗传学及线粒体基因组全序列研究

作　者: 吴孝兵
导　师: 王义权；周开亚
学　校: 南京师范大学
专　业: 动物学
关键词: 扬子鳄 保护遗传学 RAPD 线粒体基因组 全序列
分类号: Q953
类　型: 博士论文
年　份: 2001年
下　载: 234次
引　用: 2次
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内容摘要


本文主要从保护遗传学和线粒体DNA全序列等2个方面对扬子鳄进行了研究。 扬子鳄是中国特有的珍稀爬行动物，野生鳄的数量稀少。为了保护这一物种，1979年建立了安徽省扬子鳄繁殖研究中心，这是目前世界上最大的扬子鳄饲养种群；此外，浙江长兴的村民也创建了一个扬子鳄养殖场。这2个饲养种群代表了中国扬子鳄种群遗传背景， 对1993～1998年安徽省扬子鳄繁殖研究中心内的亲代与子代鳄的繁殖情况进行的统计分析，表明：扬子鳄亲代卵的平均受精率为(75.66±2.29)％，子一代为(69.24±5.12)％；亲代产卵孵化幼鳄的平均畸形率为(0.30±0.20)％，而子一代产卵幼鳄平均畸形率为(1.85±0.95)％；经统计检验，卵的受精率和幼鳄的畸形率在亲代与子代间差异显著，但受精卵幼鳄孵化率在两代间差异不显著。通过饲养种群的家系和有效群体大小分析，作者认为造成子代鳄的繁殖率下降和畸形率上升的原因与扬子鳄低的遗传变异性有关。 目前对中国扬子鳄的遗传结构尚无人研究。本文通过RAPD方法研究了这2个主要饲养种群的遗传结构。从199个随机引物中筛选出35个引物，对43个个体(浙江长兴种群10个，安徽宣州种群33个)进行RAPD-PCR，其中有4个引物未能在所有43个个体中全部产生清晰的条带，31个引物的扩增产物用于分析。共获得193个清晰的可重复的扩增带，仅有21个条带为多态片段，占10.88％。43个个体的遗传距离的变动范围为0～0.0376，平均遗传距离为0.0104±0.0055SE。浙江饲养种群的平均遗传相似性为0.9948±0.0029 SE，高于安徽宣州饲养种群(0.9894+0.0055 SE)，浙江饲养种群中较低的遗传变异可能与奠基者效应有关。RAPD分析同时也表明，多态片段的平均显型频率为0.6656±0.3730SE。在多态片段中，有4条显型频率仅为0.0233的低频片段。2个饲养种群间的遗传距离仅为0.0009，结合多态片段的分布情况及43个个体的聚类分析表明，浙江长兴种群在遗传起源于安徽宣州种群。本研究还就扬子鳄的繁殖力降低与遗传变异间的关系及扬子鳄种群的遗传保护问题进行了讨论。 线粒体DNA基因组全序列作为研究动物系统发生的模型系统，虽然仍有一定的缺陷，但仍是生物学家研究系统进化最有力的工具，它是目前唯一可以提供基因组水

全文目录


中文摘要  5-7
英文摘要(ABSTRACT)  7-10
第一章 扬子鳄生物学研究概况  10-20
  引言  10
  1.扬子鳄地理分布的历史变迁及种群现状  10-12
  2.扬子鳄的资源价值  12-14
  3.扬子鳄生物学研究概况  14-15
  4.钝吻鳄属的起源及扬子鳄系统学位置的研究  15-16
  5.扬子鳄的饲养繁殖与保护  16-18
  6.扬子鳄的遗传学及分子生物学研究  18-20
第二章 安徽宣城扬子鳄饲养种群繁殖现状分析  20-26
  引言  20
  1.材料与方法  20
  2.结果与讨论  20-26
    2.1 扬子鳄繁殖情况统计  20-22
    2.2 扬子鳄繁殖力下降的原因分析  22-24
    2.3 扬子鳄的物种保护  24-26
第三章 扬子鳄种群遗传变异性的RAPD分析  26-37
  引言  26-27
  1.实验材料和研究方法  27-28
  2.实验结果  28-34
    2.1 RAPD图谱分析  28-29
    2.2 各多态RAPD片段的显型频率  29-30
    2.3 个体间的遗传距离及聚类分析  30-34
    2.4 种群间遗传距离分析  34
  3.讨论  34-37
    3.1 扬子鳄种群间的遗传变异  34-35
    3.2 扬子鳄个体间的遗传变异  35-36
    3.3 扬子鳄物种遗传保护  36-37
第四章 脊椎动物线粒体基因组全序列及其分子系统发生研究  37-54
  1.线粒体的起源及其在动物进化中的意义  37-38
  2.已报道的脊索动物线粒体DNA全序列  38
  3.线粒体基因组结构  38-42
  4.碱基组成  42-48
  5.线粒体DNA的进化速率  48-51
  6.系统发生重建  51-54
第五章 扬子鳄线粒体基因组全序列及其与近缘物种的比较  54-92
  引言  54
  1.材料与方法  54-56
  2.结果与讨论  56-92
    2.1 扬子鳄线粒体DNA基因组的结构特点  56-79
    2.2 三个近缘物种mtDNA基因组结构的比较  79-87
    2.3 tRNA基因  87-90
    2.4 鳄类线粒体DNA基因组的特点  90-92
第六章 从线粒体基因组探讨爬行动物的系统发生与钝吻鳄属的起源  92-101
  引言  92-93
  1.材料与方法  93
  2.结果  93-97
    2.1 从12S rRNA和16S rRNA基因全序列合并数据重建爬行动物系统发生  93-96
    2.2 基于13种蛋白质编码基因序列的爬行动物系统发生分析  96-97
  3.讨论  97-101
    3.1 爬行动物的分子系统发生  97
    3.2 扬子鳄系统学位置的讨论  97-99
    3.3 钝吻鳄属的起源  99-101
参考文献  101-114
后记  114-115
在读期间发表的有关学术论文  115

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中图分类: > 生物科学 > 动物学 > 动物遗传学
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