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皖南花猪和皖南黑猪PRLR和BF基因多态性与产仔性状的关联分析

作　者: 王阳
导　师: 殷宗俊；周杰
学　校: 安徽农业大学
专　业: 动物遗传育种与繁殖
关键词: 猪多态性 PRLR基因 BF基因高繁殖力
分类号: S828
类　型: 硕士论文
年　份: 2010年
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内容摘要

本论文以PRLR(催乳素受体)基因和BF(备解素因子)基因为研究对象,旨在探索这两个基因的多态性与安徽两个地方猪种(皖南花猪、皖南黑猪)高繁殖力之间的关系。用于本研究的猪分别来自于黄山市黟县皖南花猪保种场和宁国市皖南黑猪保种场,其中皖南花猪30只,皖南黑猪85只。利用限制性内切酶酶切技术研究这些基因在遗传变异及其对猪繁殖性能的影响。结果表明:(1)对于PRLR基因,根据猪的PRLR基因设计1对引物覆盖该基因外显子10,检测PRLR基因在皖南花猪和皖南黑猪中的单核苷酸多态性,同时研究该基因对猪繁殖力的影响。检测结果显示,在皖南花猪和皖南黑猪中均检测到AA、AB和BB型;皖南花猪AA型、AB型、BB型的基因型频率分别为0.6667、0.2333和0.100;皖南黑猪AA型、AB型、BB型的基因型频率分别为0.5647、0.2824和0.1529。统计分析结果显示不论是皖南花猪还是皖南黑猪BB型与AA型的产仔数差异均显著(P<0.05)。(2)对于BF基因,针对该基因的内含子1设计了1对引物中,仅引物P8扩增片段存在多态性。皖南花猪共发现两种基因型:CC和CD型,基因型频率为0.5333和0.4667。皖南黑猪共发现三种基因型:CC、CD和DD型。基因频率为0.3295、0.5529和0.1176。BF基因在两个安徽地方猪种的群体遗传分析表明:C为优势基因,在两个种群中占有优势。统计分析结果显示不论是皖南花猪还是皖南黑猪CC型与DD型的产仔数差异均显著(P<0.05)。研究结果初步表明PRLR基因和BF基因皆是提高猪的一个潜在有效的DNA标记。

全文目录

摘要  5-6
ABSTRACT  6-7
缩略词(Abbreviation)  7-10
文献综述  10-18
  1 安徽地方猪种的种质特征  10-11
    1.1 皖南花猪的种质特征  10-11
    1.2 皖南黑猪的种质特性  11
  2 猪产仔数性状主效基因研究进展  11-14
    2.1 PRLR 基因的结构和功能  12-13
    2.2 BF 基因结构和研究进展  13-14
  3 多产性状的国内外研究现状  14-15
    3.1 多世代选择法  14
    3.2 超多产选择法  14
    3.3 家系指数选择法  14
    3.4 BLUP 法  14
    3.5 排卵数和出生前存活率的指数选择  14-15
  4 分子标记技术  15-18
    4.1 RAPD 技术  15
    4.2 AFLP：扩增片段长度多态性技术  15
    4.3 SSR：简单重复序列  15-16
    4.4 SNP 技术  16
    4.5 PCR-RFLP技术  16-18
引言  18-38
  1 材料与方法  19-28
    1.1 材料  19-21
      1.1.1 样本组成  19
      1.1.2 产仔性状的性能记录  19
      1.1.3 主要仪器设备  19
      1.1.4 主要试剂  19-20
      1.1.5 软件工具  20
      1.1.6 常规溶液及试剂配制  20-21
      1.1.7 琼脂糖凝胶的制备  21
    1.2 实验方法  21-28
      1.2.1 DNA 提取  21-22
      1.2.2 DNA 浓度和纯度的测定  22
      1.2.3 引物设计  22
      1.2.4 PCR 反应  22-24
      1.2.5 琼脂糖凝胶电泳检测  24
      1.2.6 PCR-RFLP 反应体系  24
      1.2.7 基因型分析  24
      1.2.8 统计分析方法  24-28
  2 试验结果与分析  28-35
    2.1 基因组提取结果检测  28
    2.2 PRLR 基因片段的琼脂糖凝胶电泳检测  28-29
      2.2.1 PRLR 基因的PCR 检测结果  28
      2.2.2 PRLR 基因PCR-RFLP 分析  28-29
    2.3 BF 基因的PCR 检测结果  29-30
      2.3.1 BF 基因PCR-RFLP 分析  29-30
    2.4 安徽两个地方猪种PRLR 基因的RFLP 研究结果  30-31
      2.4.1 基因频率及基因型频率  30
      2.4.2 两个猪种PRLR 基因遗传多态性  30-31
      2.4.3 PRLR 基因型与两个猪群繁殖性能的关联性分析  31
    2.5 安徽两个地方猪种BF 基因的RFLP 研究结果  31-33
      2.5.1 两个猪种BF 基因遗传多态性  32
      2.5.2 BF 基因型与两个猪群繁殖性能的关联性分析  32-33
    2.6 皖南黑猪PRLR、BF 基因合并基因型与繁殖性状的相关性分析表  33
    2.7 皖南花猪PRLR、BF 基因合并基因型与繁殖性状的相关性分析表  33-34
    2.8 两个地方猪种繁殖性状的比较  34-35
  3 讨论  35-37
    3.1 关于DNA 的提取及保存  35
    3.2 PCR 反应过程中的影响  35
    3.3 PRLR、BF 基因在皖南花猪、皖南黑猪多态性分布  35-36
    3.4 PRLR 基因对猪产仔性状的影响  36
    3.5 BF 基因对猪产仔性状的影响  36
    3.6 PRLR、BF 基因的聚合效应对猪产仔性状的影响  36
    3.7 皖南花猪、皖南黑猪繁殖性状的比较  36-37
  4 结论  37-38
参考文献  38-43
致谢  43-44
作者简介  44

皖南花猪和皖南黑猪PRLR和BF基因多态性与产仔性状的关联分析

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