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抗生素iso-migrastatin发酵条件优化和高产机理研究
作 者: 吴雪云
导 师: 徐志南;张耀洲
学 校: 浙江理工大学
专 业: 生物化学与分子生物学
关键词: 异源生物合成 发酵条件优化 假想前体 荧光定量RT-PCR
分类号: Q78
类 型: 硕士论文
年 份: 2010年
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内容摘要
Iso-Migrastatin (iso-MGS)是从S. platensis NRRL18993发酵液中分离得到的12元环的大环内脂类抗生素,具有抑制肿瘤细胞转移的生物学活性。利用基因工程技术,将携带有完整iso-MGS基因簇的载体pBS11001整合到五种不同模式菌株的染色体上,成功构建五种生物合成iso-MGS的工程菌株。本论文开展了iso-MGS工程菌的发酵培养条件优化的工作,通过培养基优化,五种工程菌异源生物合成iso-MGS的能力均得到提高,iso-MGS的产量提高了3-18倍不等,通过对比可以看出工程菌SB11001合成iso-MGS的能力明显高于其余四种工程菌,最高产量为128.6 mg/L,该菌也成为进一步组合生物合成iso-MGS的首选的工程菌。通过组合不同培养基之间的成分摸索出更适宜iso-MGS合成的培养基,摸索出一种组合B2培养基,使iso-MGS的产量进一步提高到186.7 mg/L,同时为异源生物合成其他天然产物所需培养基提供了借鉴。根据文献中报道的iso-MGS的假想生物合成路径,本实验验证了添加假想前体碳酸氢钠对iso-MGS产量的影响,添加2 g/L碳酸氢钠使iso-MGS的产量继续提高到207.8 mg/L。利用实时荧光定量RT-PCR技术研究野生菌和工程菌的mgs基因簇中每个基因在不同时期的表达丰度,从而发现与iso-MGS产量密切相关的基因,为进一步组合生物合成iso-MGS选择靶基因提供了理论基础。
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全文目录
摘要 4-5 Abstract 5-8 第一章 文献综述 8-22 1.1 抗生素iso-migrastatin 的研究进展 8-10 1.1.1 iso-migrastatin 的分子结构 8-9 1.1.2 Migrastatin 的理化性质 9 1.1.3 iso-migrastatin 的分析方法 9 1.1.4 iso-migrastatin 的生物学活性 9 1.1.5 iso-migrastatin 的分离提取过程 9-10 1.2 iso-migrastatin 衍生物研究进展 10-12 1.2.1 iso-migrastatin 及其衍生物研究进展 10-11 1.2.2 iso-migrastatin 衍生物合成进展 11 1.2.3 iso-migrastatin 及其衍生物生物学活性 11-12 1.3 异源生物合成天然产物 12-18 1.3.1 异源生物合成聚酮化合物的研究进展 12 1.3.2 iso-migrastatin 生物合成基因簇的概述 12-15 1.3.3 构建生物合成iso-migrastatin 的工程菌 15-18 1.4 实时荧光定量RT-PCR 技术 18-21 1.4.1 实时荧光定量RT_PCR 技术的原理 18 1.4.2 实时荧光定量 RT_PCR 的实验步骤 18-21 1.5 本论文的研究目的 21-22 第二章 Iso-migrastatin 异源生物合成及发酵条件优化 22-40 2.1 材料与方法 22-25 2.1.1 实验材料 22-25 2.1.1.1 实验菌种 22 2.1.1.2 培养基 22-23 2.1.1.3 主要试剂 23-24 2.1.1.4 实验设备 24 2.1.1.5 iso-migrastatin 的生物合成和检测方法 24-25 2.2 结果与讨论 25-39 2.2.1 发酵条件的优化 25-30 2.2.1.1 生长曲线的测定 25-26 2.2.1.2 发酵时间对iso-migrastatin 合成的影响 26-27 2.2.1.3 树脂添加量对iso-migrastatin 产量的影响 27-28 2.2.1.4 初始pH 值对iso-migrastatin 产量的影响 28-29 2.2.1.5 接种量对iso-migrastatin 的合成产量的影响 29-30 2.2.2 iso-migrastatin 培养基成分的优化 30-39 2.2.2.1 培养基种类的选择 30-31 2.2.2.2 碳源的种类和浓度对iso-migrastatin 合成的影响 31-32 2.2.2.3 有机氮源种类和浓度对iso-migrastatin 合成的影响 32-34 2.2.2.4 无机氮源对iso-migrastatin 合成的影响 34-35 2.2.2.5 组合培养基对iso-migrastatin 合成的影响 35-37 2.2.2.6 假想前体对iso-migrastatin 合成的影响 37-39 2.3 本章小结 39-40 第三章 Real Time RT-PCR 技术 40-52 3.1 引言 40-41 3.2 材料与方法 41-48 3.2.1 实验菌株和培养方法 41 3.2.2 主要试剂 41-42 3.2.3 主要实验设备 42 3.2.4 iso-MGS 同源和异源菌株的培养 42 3.2.5 链霉菌总RNA 的提取 42-43 3.2.6 粗提RNA 样品的纯化 43-44 3.2.7 总RNA 浓度的检测 44-45 3.2.8 反转录反应 45-46 3.2.9 荧光定量PCR 46-48 3.3 结果与讨论 48-50 3.3.1 总RNA 粗提样品电泳分析 48 3.3.2 iso-migrastatin 结构基因转录水平分析 48-50 3.3 本章小结 50-52 第四章 结论与展望 52-54 参考文献 54-58 致谢 58-59 在学期间发表的文章 59
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中图分类: > 生物科学 > 分子生物学 > 基因工程(遗传工程)
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