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MCP-1基因多态性与海原回族结核病遗传易感性的关联性研究

作　者: 张淑雅
导　师: 裴秀英
学　校: 宁夏医科大学
专　业: 遗传学
关键词: MCP-1 rs1024611(G/A) rs1024610(A/T) 基因多态性 遗传易感性 结核病
分类号: R52
类　型: 硕士论文
年　份: 2009年
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内容摘要


目的结核病的发生与发展是结核分枝杆菌与宿主之间相互作用的结果,宿主免疫遗传因素在结核病发生发展过程中起着非常重要的作用。本研究选择结核病主要候选基因单核细胞趋化蛋白-1(MCP-1)基因的2个SNPs rs1024611(G/A)和rs1024610(A/T),探讨它们在海原人群结核病发生中的作用,并构建单倍体型,研究其在海原回族人群中与结核病的易感性是否有关联。方法采用以医院为基础的病例-对照研究设计,选择海原地区141例临床确诊的肺结核病患者,平均年龄为(34.95±18.78)岁,另选择与其年龄、性别相匹配的152例健康人群作为对照,平均年龄为(32.52±15.68 )岁。应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析(PCR-RFLP)法检测rs1024611(G/A)、rs1024610(A/T)多态性位点的基因型,用软件SPSS 11.5计算基因型频率、等位基因频率并进行卡方检验,用软件SHEsis进行2个SNP位点的连锁不平衡检验,并构建单倍体型。结果(1)对病例和对照人群中的2个基因多态性位点的基因频率进行检验,均符合Hardy-Weinberg平衡定律,表明各基因型频率在海原人群中已达遗传平衡,所选样本具有群体代表性。(2)rs1024611(G/A)的GG、GA和AA基因型在病例组中的分布频率分别为34.8%、53.9%和11.3%,在对照组中的分布频率分别为26.3%、50.7%和23%。以rs1024611 AA基因型为参照组,GA基因型、GG基因型在病例组中的分布频率均显著高于对照组,(P值分别为0.006和0.001;OR值分别为2.468和3.500),G和A等位基因在病例组中的分布频率分别为61. 7%和38. 3%,在对照组中的分布频率分别为48.4%和51.6%,卡方检验后,两组差异有统计学意义(P=0.001,OR=1.721)。(3)rs1024610( A/T)的AA和AT基因型在病例组中的分布频率分别为77.3%和22.7%,在对照组中的分布频率分别为86.2%和13.8%。尚未发现TT基因型,这与Hapmap计划公布的TT基因型在亚洲人群中极为罕见是一致的。以rs1024610 AA基因型为参照组,rs1024610 AT基因型在病例组与对照组中的分布有统计学差异(P=0.034;OR=1.906)。A和T等位基因在病例组中的分布频率分别为88.7%和11.3%,在对照组中的分布频率分别为93.1%和6.9%,卡方检验后,两组差异有统计学意义(P=0.045,OR=1.786)。(4)rs1024611(G/A)和rs1024610(A/T)处于非连锁不平衡关系(D’=0.327,r2= 0.013)。(5)使用软件SHEsis构建rs1024611(G/A)和rs1024610(A/T)的单倍型,共有4种单倍型。其中AA*单倍型在病例组和对照组中的频率分别为34.2%和46.1%,AT*单倍型在病例组和对照组中的频率分别为41%和55%,GA*单倍型在病例组和对照组中的频率分别为54.5%和47%,GT*单倍型在病例组和对照组中的频率分别为7.2%和1.4%;以A A*单倍型为参照组,进行卡方检验后,G A*型在病例组与对照组中的分布有统计学差异(P =0.01 ,OR=1.571),GT*型在病例组与对照组中的分布有显著性差异( P =0.000 ,OR=7. 292)。结论(1)SNP rs1024611(G/A)多态性与宁夏海原回族结核病的发病有一定的关联性,其GG、GA基因型可能是海原回族人群对结核病的易感因素。(2)SNP rs1024610 (A/T)多态性与海原回族结核病的发病有一定的关联性,其AT基因型可能是海原回族人群对肺结核的易感因素。(3)SNP rs1024611(G/A)与SNP rs1024610(A/T)处于非连锁不平衡关系。(4)SNP rs1024611(G/A)与SNP rs1024610(A/T)的单倍型与海原地区的结核病易感性有一定关联性,其中GA*、GT*单倍型很可能是海原人群对结核病一个易感因素。

全文目录


摘要  2-4
ABSTRACT  4-9
前言  9-14
材料与方法  14-28
结果  28-34
讨论  34-41
结论  41-42
参考文献  42-47
文献综述  47-62
  综述参考文献  58-62
致谢  62-63
攻读学位期间发表的学术论文  63-64
个人简历  64

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中图分类: > 医药、卫生 > 内科学 > 结核病
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