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金樱子（Rosa laevigata Michx）遗传多样性分析及其指纹图谱构建

作　者: 杨晨希
导　师: 王国良
学　校: 南京农业大学
专　业: 园林植物与观赏园艺
关键词: 金樱子表型 SRAP 遗传多样性指纹图谱
分类号: S567.19
类　型: 硕士论文
年　份: 2012年
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内容摘要

遗传多样性是生命进化和适应的基础,种内遗传多样性越丰富,物种对环境变化的适应能力也越大。自然界中物种的多样性和进化潜力是其自身生存和发展的基础,保护物种及其所蕴藏的遗传多样性就是保护生物多样性。本文旨在利用观赏植形态标记和SRAP分子标记来对不同种源金樱子(Rosa laevigata Michx)的遗传多样性进行分析,同时建立金樱子的指纹图谱,为我国金樱子育种材料的创新和资源的有效开发利用奠定坚实的理论基础。结果如下：通过对金樱子26个形态指标的研究表明：(1)不同种源金樱子的各性状存在很大差异。其中,刺毛着生情况、花瓣先端缺裂程度等性状的变异范围大；而其中又以四川被试金樱子材料的果梗长、花瓣长、果形,云南的刺毛着生情况、花瓣宽等的变异系数较高,变异范围大,类型多。(2)SPSS-将供试金樱子划分为3大组群。各组群间存在明显的地域性差异。(3)我国南宋时期的泉州金樱子、宜州金樱子、舒州金樱子性状差异小,遗传相似度较高,亲缘关系较近。以广西南宁产的金樱子叶片为材料,采用L16(45)正交试验设计,对SRAP-PCR反应体系中的Mg2+、dNTPs、TaqDNA聚合酶、引物和模板DNA用量5因素进行了优化。试验结果显示：适用于金樱子SRAP-PCR的最佳反应体系为：反应总体积10μL,包含2.0mmol·L-1Mg2+、0.4mmol·L-1dNTPs、0.5U TaqDNA聚合酶、3μmol·L-1上下游引物、25ng DNA及10×PCR Buffer;同时用7份不同来源的金樱子材料对优化的SRAP-PCR反应体系进行验证,均获得了条带清晰、多态性丰富的扩增图谱,证实了该体系的稳定可靠。利用SRAP分子标记对14份不同种源金樱子进行遗传多样性分析与指纹图谱构建。结果发现：(1)20对SRAP引物组合共扩增到379条扩增带,其中有335条呈多态性,多态性比率平均为88.39%；被检测金樱子的Nei’s遗传相似系数范围为0.3481-0.9586,平均Nei’s遗传相似系数为0.6029；平均Nei’s遗传多样性指数(h)为0.3895,平均Shannon信息指数(Ⅰ)0.5701,这表明金樱子不同种源之间存在很大变异,其遗传多样性极为丰富。(2)用SRAP标记金樱子,用2对引物组合即可区分所有试验材料,获得金樱子DNA指纹图谱,可从分子水平上鉴别其不同种源,为金樱子的进一步分类、鉴定和多样性育种实践等提供理论依据。

全文目录

摘要  6-7
ABSTRACT  7-9
英文缩略词表  9-10
前言  10-11
第一章文献综述  11-23
  1 金樱子研究概况  11-12
  2 蔷薇属植物的概况及研究进展  12-15
    2.1 蔷薇属植物的形态及分布  12
    2.2 蔷薇属植物的研究进展  12-15
  3 遗传多样性的概念和研究方法  15-23
    3.1 遗传多样性的概念和意义  15
    3.2 遗传多样性的研究方法  15-23
第二章金樱子遗传多样性的表型分析  23-31
  摘要  23-24
  1 材料和方法  24-26
    1.1 材料  24
    1.2 方法  24-26
  2 结果和分析  26-29
    2.1 形态性状间遗传多样性差异  26-27
    2.2 国内各金樱子种源间形态多样性差异  27-28
    2.3 金樱子种质资源聚类分析  28-29
  3 讨论  29-31
第三章金樱子SRAP-PCR反应体系的建立与优化  31-41
  摘要  31-32
  1 材料和方法  32-36
    1.1 材料  32
    1.2 主要试剂和仪器  32-33
    1.3 方法  33-36
  2 结果与分析  36-39
    2.1 SRAP-PCR反应体系的优化  36-38
    2.2 反应体系稳定性检测  38-39
  3 讨论  39-41
第四章金樱子的SRAP遗传多样性分析与指纹图谱构建  41-53
  摘要  41-42
  1 材料和方法  42-44
    1.1 材料  42
    1.2 主要试剂和仪器  42-43
    1.3 方法  43-44
  2 结果和分析  44-50
    2.1 供试材料基因组DNA的检测  44-45
    2.2 SRAP-PCR引物的筛选与扩增结果  45-46
    2.3 金樱子间遗传多样性分析  46-49
    2.4 基于SRAP标记的聚类分析  49
    2.5 分子标记指纹图谱的构建  49-50
  3 讨论  50-53
    3.1 SRAP标记金樱子的遗传多样性  50-51
    3.2 不同种源野生金樱子的聚类  51-52
    3.3 基于SRAP分子标记的指纹图谱构建  52-53
第五章全文结论  53-55
参考文献  55-67
硕士期间发表文章情况  67-69
致谢  69

金樱子（Rosa laevigata Michx）遗传多样性分析及其指纹图谱构建

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