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河西绒山羊GOLA-DRB1基因第2外显子变异特征分析

作　者: 王佳泰
导　师: 罗玉柱
学　校: 甘肃农业大学
专　业: 动物遗传育种与繁殖
关键词: GOLA-DRB1基因多态性 PCR-SSCP 流产河西绒山羊
分类号: S827
类　型: 硕士论文
年　份: 2011年
下　载: 24次
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内容摘要

山羊GOLA-DRB1基因第2外显子的遗传特征、SNPs变异类型,同时分析该基因与山羊流产的关联性。结果表明,河西绒山羊GOLA-DRB1基因第2外显子上存在26个等位基因,序列比对后发现这26个等位基因中存在71个核苷酸变异位点,占分析位点总数的30%。其中转换位点25个,占核苷酸多态位点的35.21%;颠换位点35个,占多态位点的49.3%;转换和颠换共存位点9个,占12.68%。流产关联性分析表明,在河西绒山羊病例组中,DRB1*EX2-18、DRB1*EX2-23、DRB1*EX2-26等位基因频率高于正常组(P<0.05),DRB1*EX2-8等位基因频率高于正常组(P<0.01);病例组中DRB1*EX2-14等位基因频率低于正常对照组(P<0.05),DRB1*EX2-1和DRB1*EX2-11低于正常对照组(P<0.01)。初步推断GOLA-DRB1*EX2-8可能是河西绒山羊流产的遗传易感基因,GOLA-DRB1*EX2-1和GOLA-DRB1*EX2-11可能为其遗传保护基因。

全文目录

摘要  3-4
Summary  4-7
第一部分文献综述  7-19
  1. 河西绒山羊及其山羊流产病  7-8
    1.1 河西绒山羊概况  7
    1.2 山羊流产病  7-8
  2.MHC 概述  8-17
    2.1 MHC 抗原结构  9-10
      2.1.1 MHCⅠ类分子  9-10
      2.1.2 MHCⅡ类分子  10
    2.2 MHC 的组织分布  10-11
    2.3 MHC 抗原表达的调控  11-12
    2.4 MHC 基因的结构  12-14
      2.4.1 人类的 MHC 基因  12-13
      2.4.2 牛的MHC 基因  13
      2.4.3 山羊的 MHC 基因  13-14
    2.5 MHC 特征  14
      2.5.1 单倍型遗传方式  14
      2.5.2 多态性现象  14
      2.5.3 连锁不平衡  14
    2.6 MHC 多态性产生的机制  14-15
    2.7 MHC 与疾病相关的机制  15-16
    2.8 MHC 分型方法  16-17
  3.MHC-DRB1 多态性及其与抗病性研究  17-18
  4.HLA-DRB1 基因与人类流产的相关性研究  18-19
  5. 本研究的目的和意义  19
第二部分材料与方法  19-27
  1. 材料和方法  19-22
    1.1 试验材料  19-20
    1.2 主要试剂  20
    1.3 主要仪器设备  20
    1.4 溶液试剂配制  20-22
  2. 试验方法  22-27
    2.1 基因组 DNA 的提取和检测  22-23
    2.2 GOLA-DRB1 基因的PCR 扩增  23-24
    2.3 GOLA- DRB1 基因的第二外显子SSCP 分析  24-25
    2.4 DRB1 基因的克隆测序  25-27
    2.5 序列分析  27
    2.6 统计分析  27
第三部分结果与分析  27-34
  1.GOLA-DRB1 基因第2 外显子的PCR-SSCP 检测结果  27-28
    1.1 PCR 的扩增结果  27-28
    1.2 PCR-SSCP 检测结果  28
  2. PCR-SSCP检测结果的统计分析  28-34
第四部分讨论  34-38
  1.SSCP 分析方法可靠性讨论  34
  2. 巢氏PCR 的优缺点  34
  3. 模板DNA 的质量对PCR 扩增的影响  34-35
  4.MHC-DRB1 基因第2 外显子等位基因的检测和辨型  35
  5. 河西绒山羊GOLA-DRB1 基因外显子2 多态性的产生  35-36
  6.GOLA-DRB1 基因与免疫性状的相关性分析  36-37
  7.GOLA-DRB1 基因聚类分析的进化意义  37-38
第五章结论  38-39
致谢  39-40
参考文献  40-43

河西绒山羊GOLA-DRB1基因第2外显子变异特征分析

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