学位论文 > 优秀研究生学位论文题录展示

山猪肉质性状主要相关基因的遗传特性及其对肉质的作用和影响

作　者: 王薇
导　师: 许晓风
学　校: 南京师范大学
专　业: 动物学
关键词: 猪 肉质性状 SSCP RFLP qRT-PCR
分类号: S828
类　型: 博士论文
年　份: 2012年
下　载: 327次
引　用: 0次
阅　读: 论文下载
 

内容摘要


中国是猪肉消费大国,随着人们生活水平的不断提高和养猪业的进一步发展,人们对猪肉品质的要求日益提高,因此,改善猪的肉质已成为目前生猪生产上的最大挑战。猪肉品质是一个复杂的经济性状,其表现会受到众多因素的影响,而微效多基因调控机制是决定猪胴体、肉质等数量性状的分子基础。本研究采用候选基因法对肉质相关候选基因进行分子遗传分析,并利用荧光定量PCR技术对候选基因在不同杂交猪品种中的表达差异进行研究,以期了解肉质相关候选基因的多态性及基因表达对胴体、肉质性状的影响。本研究对17个候选基因进行了SNPs的检测,结果在10个基因中检测到19个SNPs，对其中9个肉质相关基因进行多态性分析,研究这些基因的基因型频率和等位基因频率的分布规律。结果表明,在不同猪品种中,除了MYF5基因,其它基因的基因型频率的差异均达到显著(p<0.05)或极显著(p<0.01)水平,在不同性别的山猪杂交猪之间的基因型分布没有显著差异(p>0.05),在不同山猪血统含量的杂交猪(山猪二元猪和山猪三元猪)之间,MYOD1的基因型分布存在显著差异(p<0.05),LPL基因的基因型分布显示出极显著差异(p<0.01)。在山猪中,占优势的等位基因分别是MC4R的A等位基因,LEPR的A等位基因,HSL的A等位基因,MYF5的A等位基因,MYOD1的C等位基因,H-FABP的T等位基因以及ADRB3基因的A等位基因。在不同山猪杂交猪中研究了上述基因的多态性位点与猪胴体、肉质性状间的相关性,结果表明,除MYOD1基因外,其余分子标记均与猪中某些胴体、肉质性状存在显著或极显著相关。研究发现,MC4R的AA基因型更有利于体重以及脂肪沉积；LEPR的AA基因型系水能力更强,且更有利于优良肉色性状的表达;HSL的GG基因型有利于提高瘦肉率,而AA基因型有利于提高肌内脂肪含量；LPL的CC基因型具有较薄的背膘厚、较大的眼肌面积和较低的失水率,TT基因型则具有较高的肉色参数值和肌内脂肪含量,指示选择CC基因型猪将有利于地方猪品种的遗传改良；MYF5的AA基因型的肉嫩度更高,肉质系水力更强,具有更好的食用口感；ADRB3的G等位基因更有利于增加肌内脂肪含量,选择G等位基因的引入将有利于国内猪种的遗传改良；H-FABP的T等位基因有利于提高猪肉嫩度和脂肪含量；PPARγ的GG基因型系水能力更强。采用荧光定量PCR方法检测11个候选基因在山猪杂交猪背最长肌中的表达情况,结果表明,在二元杂交猪、三元杂交猪之间,LEPR、PPARα、ADRB3、 AdPLA、SCD基因的表达差异达到显著水平,LPL基因的表达差异达到极显著水平；在不同性别的杂交猪之间,PPARα、ADRB3基因的表达差异达到显著水平。而在各个基因的不同基因型之间,LEPR、LPL、MYF5、PPARγ、ADRB3基因的表达差异达到显著水平。LEPR的AT基因型、PPARγ的AG基因型更有利于基因表达；ADRB3的AG基因型则会减弱基因表达；而LPL的T等位基因、MYOD1的A等位基因更有利于基因表达。在不同山猪杂交猪中研究了候选基因的表达差异与猪胴体、肉质性状间的相关性,结果表明,除了PEPCK基因,其余基因的表达差异均与猪中某些胴体、肉质性状存在显著或极显著相关,其中,MC4R、LEPR、LPL、PPARα基因表达的增强有利于体脂含量、肌内脂肪含量的增加,而不利于胴体性状；MYF5基因表达的增强有利于增加脂肪沉积,但会使猪肉的瘦肉率和嫩度降低；MYOD1基因表达的增强有利于pH24值提高,影响猪肉的食用品质；ADRB3表达量的提高有利于胴体性状,而不利于脂肪性状;PPARγ表达量的提高也不利于胴体性状,但同时会使嫩度降低；AdPLA表达量的提高有助于脂肪的积累,但不利于蛋白质含量的增加；SCD基因表达量的提高有助于肌内脂肪的沉积,增强肉质食用口感。本研究鉴定出一批对猪胴体、肉质性状具有影响的等位基因或基因型,并建立这些等位基因或基因型的检测方法：另外分析各基因的遗传变异类型、表达水平等对肉质性状的作用和影响,为猪肉质性状的遗传控制理论研究和主效基因的评价与利用提供新的研究途径。

全文目录


摘要  3-5
Abstract  5-11
第一章 文献综述  11-35
  1.1 中国主要地方猪品种资源及其遗传多样性  11-14
    1.1.1 中国主要猪品种资源  11-12
    1.1.2 中国地方猪品种遗传多样性  12-13
    1.1.3 山猪品种资源状况  13-14
  1.2 DNA分子标记在猪品种遗传育种中的应用  14-19
    1.2.1 猪品种育种研究  14-15
    1.2.2 DNA分子标记  15-17
    1.2.3 DNA分子标记在猪遗传育种中的应用  17-19
  1.3 猪肉质性状分子遗传学的研究  19-35
    1.3.1 猪肉质的评定及影响因素  19-21
    1.3.2 猪肉质性状的遗传基础  21-33
      1.3.2.1 Hal基因  23-24
      1.3.2.2 RN基因  24
      1.3.2.3 HSP 70.2基因  24
      1.3.2.4 ADD1基因  24-25
      1.3.2.5 DECR1基因  25
      1.3.2.6 FABP基因  25-26
      1.3.2.7 HSL基因  26-27
      1.3.2.8 LEPR基因  27
      1.3.2.9 OB基因  27
      1.3.2.10 MC4R、MC5R基因  27-28
      1.3.2.11 MYF5、MYOD1、MYOG基因  28-29
      1.3.2.12 PDHA1基因  29
      1.3.2.13 PPARα、PPARγ基因  29-30
      1.3.2.14 LPL基因  30
      1.3.2.15 UCP2、UCP3基因  30-31
      1.3.2.16 CAST基因  31
      1.3.2.17 ADRB3基因  31
      1.3.2.18 AdPLA基因  31-32
      1.3.2.19 PEPCK基因  32
      1.3.2.20 PRKAG3基因  32
      1.3.2.21 SCD基因  32-33
    1.3.3 猪肉质性状遗传改良  33-35
第二章 猪肉质性状相关基因的多态性及其对肉质的影响研究  35-96
  2.1 材料与方法  35-48
    2.1.1 试验材料的采集和保存  35-36
    2.1.2 试验仪器和试剂  36-38
      2.1.2.1 主要仪器  36-37
      2.1.2.2 主要试剂  37-38
      2.1.2.3 主要药品、酶和试剂盒  38
    2.1.3 猪血液和组织基因组DNA的提取  38-39
      2.1.3.1 猪血液基因组DNA的提取  38-39
      2.1.3.2 猪组织基因组DNA提取  39
      2.1.3.3 DNA浓度和质量的检测  39
    2.1.4 PCR-SSCP检测与测序  39-44
      2.1.4.1 PCR引物设计和反应条件  39-42
      2.1.4.2 PCR产物检测  42
      2.1.4.3 聚丙烯酰胺凝胶电泳  42-44
      2.1.4.4 测序  44
      2.1.4.5 不对称PCR-SSCP检测  44
    2.1.5 PCR-RFLP检测  44-47
      2.1.5.1 PCR引物设计和反应条件  44-45
      2.1.5.2 PCR产物检测  45
      2.1.5.3 PCR产物酶切  45-47
      2.1.5.4 酶切产物电泳检测  47
    2.1.6 胴体、肉质性状指标的测定  47-48
      2.1.6.1 胴体性状指标的测定  47
      2.1.6.2 肉质性状指标的测定  47-48
    2.1.7 数据处理和统计分析  48
  2.2 结果与分析  48-87
    2.2.1 猪血液和组织DNA浓度和质量的检测  48-49
    2.2.2 PCR-SSCP检测结果和序列比较分析  49-60
      2.2.2.1 HSL基因的SSCP检测  50-52
      2.2.2.2 LPL基因的SSCP检测  52-53
      2.2.2.3 MC4R基因的SSCP检测  53-54
      2.2.2.4 LEPR基因的SSCP检测  54-56
      2.2.2.5 MYF5基因的SSCP检测  56-57
      2.2.2.6 PPARγ基因的SSCP检测  57-59
      2.2.2.7 PPARα基因的SSCP检测  59-60
    2.2.3 PCR-RFLP检测结果和分析  60-69
      2.2.3.1 MC4R基因的RFLP检测  61-62
      2.2.3.2 LEPR基因的RFLP检测  62
      2.2.3.3 HSL基因的RFLP检测  62-63
      2.2.3.4 MYF5基因的RFLP检测  63-64
      2.2.3.5 MYOD1基因的RFLP检测  64-65
      2.2.3.6 ADRB3基因的RFLP检测  65-66
      2.2.3.7 H-FABP基因的RFLP检测  66-68
      2.2.3.8 ADD1基因的RFLP检测  68-69
    2.2.4 肉质性状相关候选基因的多态性分析  69-71
    2.2.5 不同山猪杂交猪肉质性状的比较  71-74
      2.2.5.1 山猪杂交猪胴体性状的比较  72
      2.2.5.2 山猪杂交猪肉质性状的感官评定  72
      2.2.5.3 猪杂交猪肉质性状的测定  72-73
      2.2.5.4 猪杂交猪肉质性状化学成分分析  73-74
    2.2.6 肉质性状相关基因的多态性对肉质的影响  74-87
      2.2.6.1 相关性分析  74-79
      2.2.6.2 基因多态性对肉质性状的影响  79-87
  2.3 讨论  87-96
    2.3.1 地方猪品种资源保护  87-88
    2.3.2 候选基因的筛选  88-89
    2.3.3 SNPs的研究  89-90
    2.3.4 不同猪品种中基因多态性的分析  90-91
    2.3.5 基因多态性与肉质性状的关联分析  91-96
第三章 猪肉质性状相关基因的表达分析及其对肉质的影响研究  96-119
  3.1 材料与方法  96-102
    3.1.1 试验材料的采集和保存  96-97
    3.1.2 试验仪器和试剂  97-98
      3.1.2.1 主要仪器  97
      3.1.2.2 主要试剂  97-98
      3.1.2.3 主要药品、酶和试剂盒  98
    3.1.3 猪组织RNA的提取  98-99
      3.1.3.1 RNA的提取  98-99
      3.1.3.2 RNA浓度和质量的检测  99
    3.1.4 RNA反转录成cDNA  99
    3.1.5 实时荧光定量PCR  99-102
      3.1.5.1 定量PCR引物设计  99-101
      3.1.5.2 定量PCR反应  101-102
    3.1.6 胴体、肉质性状指标的测定  102
      3.1.6.1 胴体性状指标的测定  102
      3.1.6.2 肉质性状指标的测定  102
    3.1.7 数据处理和统计分析  102
  3.2 结果与分析  102-113
    3.2.1 猪RNA浓度和质量的检测  102-103
    3.2.2 荧光定量PCR扩增产物特异性  103-104
    3.2.3 基因的荧光定量PCR分析  104-108
      3.2.3.1 基因在杂交猪中的表达情况  104-106
      3.2.3.2 基因多态性对基因表达的影响  106-108
    3.2.4 基因表达与肉质性状相关性分析  108-113
  3.3 讨论  113-119
    3.3.1 肉质相关基因表达情况  113
    3.3.2 基因表达与肉质性状的相关性分析  113-119
第四章 结论  119-121
参考文献  121-133
在读期间发表的学术论文  133-134
致谢  134-136

相似论文

  1. 猪前脂肪细胞分化过程中抵抗素基因表达水平及其影响因素,R587.1
  2. 猪粪堆肥的理化特征及腐熟度评价研究,S141.4
  3. 猪BMP7基因启动子多态性及其与繁殖性状关联性分析,S828
  4. 猪BMP7基因外显子和内含子多态性检测及其与繁殖性状关系的研究,S828
  5. 猪链球菌2型与猪胸膜肺炎放线杆菌基因工程亚单位疫苗的研究,S858.28
  6. 营养调控对猪生产性能及氮磷排放影响的研究,S828.5
  7. PRRSV的感染差异性和抗体依赖性增强作用研究,S858.28
  8. 连作花生红壤微生物多样性的研究及微生物制剂对连作花生的影响,S565.2
  9. 江苏省小麦孢囊线虫的发生调查及其核糖体DNA-ITS序列分析,S435.121
  10. 黄淮麦区禾谷孢囊线虫ITS分子特征及遗传多样性分析,S435.121
  11. 苏钟猪TLR4基因多态性及编码区C1027A功能分析,S828
  12. β-catenin在猪卵巢组织中的表达以及对猪卵巢颗粒细胞凋亡及类固醇生成酶的影响,S828
  13. 畜禽屠宰血液混合菌种液态发酵的研究,S816.4
  14. 湖羊多羔性状的分子标记研究,S826
  15. 规模化猪场猪繁殖与呼吸综合征血清学监测与防控方法研究,S858.28
  16. 重组毕赤酵母遗传稳定性的研究及其表达产物猪α干扰素的分离与纯化,S828
  17. 猪穿支皮瓣同一旋转蒂内一个与二个穿动脉供血范围的研究,R622
  18. 灰飞虱功能基因的克隆及其RNAi致死效应,S435.112.3
  19. 南方红黄壤地区土壤微生物碳素循环相关基因多样性研究,S154.3
  20. 猪繁殖与呼吸综合征病毒细胞受体CD163、Sn的克隆及功能鉴定,S858.28
  21. SST、SSTR2、RETN基因多态性与中国黄牛生长及肉质性状关联分析,S823

中图分类: > 农业科学 > 畜牧、动物医学、狩猎、蚕、蜂 > 家畜 > 猪
© 2012 www.xueweilunwen.com