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大肠癌肝转移的分子生物学和生物信息学研究

作　者: 葛维挺
导　师: 郑树
学　校: 浙江大学
专　业: 生物信息学
关键词: 大肠癌肝转移 ST14 染色体信号通路基因表达谱整合分析
分类号: R735.34
类　型: 博士论文
年　份: 2006年
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内容摘要

第一部分:转移相关基因ST14互作蛋白和相关基因的分子生物学研究大肠癌(Colorectal Cancer,CRC)是一常见的恶性肿瘤,我国大肠癌的发病率日渐增高,已跃居第3～5位。而在大肠癌远处转移中,肝脏是最主要的转移部位。15%～25%的大肠癌患者在确诊原发灶时发现肝转移,20%左右的患者原发灶治疗后出现肝转移。在大肠癌死亡病人的尸检中可以发现36%～81%的肝转移。大肠癌的肝转移涉及了从侵袭细胞外基质(Extra Cellular Matrix,ECM)到最后癌细胞在肝脏中增殖的多个过程,一系列的基因和蛋白参与其中。ST14基因自发现起就因其具备降解细胞外基质的能力而被认为与肿瘤的转移相关,一方面不同的肿瘤组织中该基因的表达情况高低不一,在大肠癌组织中ST14基因不表达或低表达,而在其他一些肿瘤组织中,如乳腺癌、卵巢癌和宫颈癌中高表达。另一方面该基因的蛋白自身具有多种存在形式,并已发现了多个与其作用的蛋白,抑制该蛋白的酶活性,如Hepatocyte growth factor Activator Inhibitor-1(HAI-1)和Aprotinin蛋白,或者被该蛋白酶激活,如蛋白酶活化受体-2(Proteinase-Activated Receptor 2,PAR2)以及肝细胞生长因子/扩散因子(Hepatocyte Growth Factor/Scatter Factor,HGF/SF)的前体和尿激酶型纤溶酶原激活因子(urokinase-type Plasminogen Activator,uPA)的前体。 ST14蛋白包括了一个N端的穿膜区(transmembrane region,TM),C端的丝氨酸蛋白酶(serine protease,SP)结构域,一个SEA结构域,两个CUB(complement sub-component Clr/s)结构域,四个LDLR(low density lipoprotein receptor)结构域。该蛋白中包含的多个结构域在ST14蛋白的激活与抑制过程中起到了重要作用,但具体机制尚不清楚。因此无论在基因水平寻找受ST14基因表达影响的基因,或是在蛋白质水平寻找与ST14蛋白结构域相互作用的蛋白,都对理解ST14基因在肿瘤转

全文目录

一、本文常用英文缩略词  6-8
二、中英文摘要  8-16
三、论文部分  16-75
  1.前言  16-19
  第一部分：转移相关基因ST14互作蛋白和相关基因的分子生物学研究  19-41
    2.第一章 ST14基因的表达对肠癌细胞系RKO基因表达谱的影响  19-25
    3.第二章 ST14蛋白各结构域相互作用蛋白的寻找  25-41
  第二部分：染色体、信号通路和基因表达谱数据的生物信息学整合分析  41-75
    4.第三章整合染色体信息与基因表达谱数据研究大肠癌的发生与肝转移  41-63
    5.第四章整合信息通路与基因表达谱数据研究大肠癌的发生和肝转移  63-73
    6.结论  73-75
四、综述大肠癌肝转移的机制研究及早期诊断  75-84
五、参考文献  84-91
六、附录  91-94
七、在读期间发表文章  94-95
致谢  95

大肠癌肝转移的分子生物学和生物信息学研究

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