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人工诱导雌核发育草鱼与普通草鱼基因组的微卫星分析

作　者: 林凯东
导　师: 罗琛
学　校: 湖南师范大学
专　业: 动物学
关键词: 草鱼 微卫星DNA 雌核发育 遗传多样性 遗传纯合度
分类号: Q953
类　型: 硕士论文
年　份: 2003年
下　载: 184次
引　用: 3次
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内容摘要


本研究运用微卫星DNA-聚合酶链反应-聚丙烯酰胺凝胶电泳基因分型技术，从28对已发表的普通鲤鱼的微卫星引物中，筛选出能用于草鱼基因组分析的微卫星引物，然后用这些引物对湘江野生草鱼群体和通过抑制第一次卵裂获得的雌核发育草鱼群体的遗传多样性及雌核发育草鱼个体的基因纯合度进行分析。所得结果与结论如下： (1)在所选28对鲤鱼的微卫星引物中，经过反应条件的优化，筛选到了7对(25％)引物能在草鱼基因组中扩增出重复性好而且清晰的特异性条带，其中的4对(占14.3％)引物扩增的特异条带在群体中具有多态性。说明部分鲤鱼的微卫星引物对草鱼基因组分析具有适用性。 (2)7个微卫星位点上湘江野生草鱼群体的平均等位基因数Na、平均观测杂合度H_o、平均期望杂合度H_e、有效等位基因数N_e分别为2、0.3571、0.2992、1.6791，遗传相似性为0.8043。提示湘江野生草鱼群体的遗传多样性比较匮乏。 (3)两个雌核发育群体的13尾草鱼个体，在5个微卫星位点上的等位基因均达到纯合，占全部位点的71.4％；在1个位点上，部分个体基因纯合，部分个体基因杂合，占全部位点的14.3％。表明实验获得的雌核发育草鱼个体等位基因已有较高纯合程度。令人惊异的是在1个微卫星位点上，13尾草鱼个体均扩增出两个产物。推测这个位点在草鱼基因组中可能存在多拷贝。是否如此，尚有待进一步研究。 (4)雌核发育草鱼A群体在五个微卫星位点上达到完全的遗传同质性，群体内个体的基因型完全一致。雌核发育草鱼B群体在四个位点上达到完全的遗传同质性。雌核发育草鱼A、B两群体内的相似性系数分别为0.9091、0.8699。表明通过抑制第一次卵裂获得的两个雌核发育草鱼群体具有高遗传纯合度。 (5)两个雌核发育草鱼A、B群体与普通草鱼之间的遗传距离分别约是0.1620、0.1621，三个群体在7个微卫星位点上等位基因频率的分布无明显差异，提示两个雌核发育草鱼群体与野生群体之间无显著的遗传分化。

全文目录


中文摘要  5-7
英文摘要  7-9
绪论  9-24
  1 人工诱导鱼类雌核发育  9-13
    1.1 人工诱导鱼类雌核发育的原理  9-10
    1.2 鱼类人工雌核发育的诱导和鉴定  10-13
    1.3 人工诱导鱼类雌核发育的意义  13
  2 微卫星分子遗传标记及其在鱼类研究中的应用  13-22
    2.1 遗传标记概述  13-15
    2.2 当前鱼类育种中最常用的几种分子遗传标记  15-17
    2.3 微卫星标记技术及其在鱼类研究中的应用  17-22
  3 草鱼的人工雌核发育和分子遗传标记的研究现状与进展  22-24
材料与方法  24-28
  1 实验材料  24-25
  2 实验方法  25-28
    2.1 基因组DNA的制备及检测  25-26
    2.2 微卫星PCR反应  26
    2.3 PCR扩增产物的分离与检测  26
    2.4 结果判读  26
    2.5 数据统计方法  26-27
    2.6 聚类分析  27-28
实验结果  28-45
  1 微卫星PCR反应的条件  28
  2 草鱼微卫星基因座的筛选  28-29
  3 普通草鱼群体的微卫星等位基因分型及遗传多样性  29-32
    3.1 普通草鱼群体的微卫星等位基因分型结果  29-31
    3.2 普通草鱼群体的遗传多样性  31-32
  4 雌核发育草鱼群体的微卫星分析  32-34
    4.1 两个雌核发育草鱼群体微卫星等位基因的分型结果  32-33
    4.2 雌核发育草鱼个体的基因纯合性  33
    4.3 雌核发育草鱼群体的遗传纯合性  33-34
  5 普通草鱼与雌核发育草鱼群体间的遗传分化  34-45
分析与讨论  45-53
  1 PCR反应条件的优化与微卫星扩增特异条带的确认  45-46
  2 鲤鱼微卫星引物对草鱼基因组分析的适用性  46-48
  3 湘江野生草鱼群体的多样性分析  48-49
  4 雌核发育草鱼个体的基因纯合性  49-50
  5 雌核发育草鱼群体的遗传纯合性  50-51
  6 普通草鱼与雌核发育草鱼群体间的遗传分化  51-53
结语  53-55
参考文献  55-68
附录  68-69
致谢  69-70
原创性声明  70

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中图分类: > 生物科学 > 动物学 > 动物遗传学
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