学位论文 > 优秀研究生学位论文题录展示

盐胁迫下大豆根和叶基因表达谱分析

作　者: 王佳琦
导　师: 李海燕
学　校: 吉林农业大学
专　业: 生物化学与分子生物学
关键词: 野生大豆盐胁迫高通量表达谱Solexa测序实时荧光定量PCR
分类号: Q943.2
类　型: 硕士论文
年　份: 2011年
下　载: 304次
引　用: 0次
阅　读: 论文下载

内容摘要

随着世界人口的急剧增长和全球盐渍化土地面积的逐年扩大,严重影响了粮食作物的种植产量。利用高通量mRNA表达谱测序技术对大豆整个转录组进行数字化分析,大量挖掘NaCl胁迫下重要代谢通路上的关键调控基因,进行大豆耐盐性研究,提高盐渍土地大豆产量具有重要意义。本研究以大豆为研究对象,研究了旱碱1号大豆幼苗期在NaCl胁迫下(含有120mM NaCl的Hoagland培养液)24小时根和叶的转录组表达谱,对转录谱数据进行生物信息学分析,从中挑选了10个基因对表达谱数据进行相对定量PCR验证分析,并且,对GO功能显著富集基因做了聚类分析和Pathway显著富集代谢途径的统计分析。主要研究结果如下：1.大豆盐胁迫下,根和叶组织中上调的差异表达基因分别为1822个和874个。其中,根叶组织特异上调的基因分别为1706个和758个,根和叶组织中共表达基因为116个。通过对根叶组织特异差异表达基因统计分析,根中基因上调趋势显著差异,而叶中基因下调趋势不明显。2.利用BGI weGO软件对GO功能进行分类。这些GO功能显著富集的基因主要涉及：光合作用、离子转运、转录调控、信号转导以及氧化还原酶类和蛋白基因等。3.参考KEGG数据库对ABC跨膜转运和谷胱甘肽生物合成过程进行Pathway分析,这些基因被盐诱导上调表达可能存在协同作用机制。4.以大豆TUB4作为内参基因,采用相对定量PCR方法验证了表达谱数据中10个基因的差异表达情况,其差异表达倍数关系与表达谱测序结果总体趋势相一致。

全文目录

摘要  4-5
Abstract  5-6
目录  6-7
第一章前言  7-15
  1.1 盐胁迫下植物体内耐盐相关基因研究进展  7-10
  1.2 高通量测序技术的研究进展  10-11
  1.3 实时荧光定量PCR技术的研究进展  11-14
  1.4 研究的目的和意义  14-15
第二章实验材料与方法  15-28
  2.1 实验材料  15-17
  2.2 实验方法  17-28
第三章结果与分析  28-42
  3.1 大豆NaCl胁迫处理条件的确定  28-29
  3.2 NaCl胁迫下对大豆基因表达谱数据的生物信息分析  29-39
  3.3 大豆根和叶组织Total RNA提取  39
  3.4 实时荧光定量PCR验证分析  39-42
第四章讨论  42-47
  4.1 表达谱中基因差异表达的分布  42
  4.2 差异表达基因的GO功能分析  42-46
  4.3 差异表达基因的Pathway分析  46-47
第五章结论  47-48
参考文献  48-54
附录  54-58
致谢  58-59
作者简介  59

盐胁迫下大豆根和叶基因表达谱分析

内容摘要

全文目录

相似论文