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普鲁兰短梗霉HN2-3菌株碱性蛋白酶的纯化、基因克隆、表达、表面展示及生产活性肽的应用研究
作 者: 尼秀媚
导 师: 池振明
学 校: 中国海洋大学
专 业: 海洋生物学
关键词: 海洋酵母 普鲁兰短梗霉 碱性丝氨酸蛋白酶 基因克隆 表面展示 生物活性肽
分类号: Q93
类 型: 博士论文
年 份: 2008年
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内容摘要
从分离自海水、海泥及海洋生物内脏及海生植物表面的400余株酵母菌中分离到5株产蛋白酶的海洋酵母,能在酪蛋白双层平板上形成明显的透明圈,它们分别是HN2-3、N13d、N13C、Mb5和HN3-2。通过酵母鉴定的常规方法并结合分子生物学方法,鉴定出HN2-3、N13d、N13C与HN3-24株菌属于普鲁兰短梗霉(Aureobasidiumpullulans),Mb5菌株属于解脂亚罗酵母(Yarrowia lipolytica)。来自菌株HN2-3所产蛋白酶酶活性及酶解活性肽产物的ACE(AngiotensinI-converting enzyme)抑制活性最高。来自菌株HN2-3的蛋白酶命名为ALP2。利用层析柱Sephadex G-75与阴离子交换柱DEAE Sepharose Fast Flow纯化了菌株HN2-3的胞外碱性蛋白酶ALP2,纯化2.34倍。通过SDS-PAGE凝胶电泳,得到的ALP2蛋白条带分子量为33.0 kDa,最适作用温度为52℃。Mn2+、Mg2+和Na+离子浓度在5 mM时对纯化蛋白酶酶活有激活作用,Zn2+、Ca2+、K+和Li+对酶活的影响不大;而当存在Fe2+、Fe3+、Cu2+、Co2+、Ag+、和Hg2+离子时,蛋白酶活明显降低。苯甲基磺酰氟(PMSF)强烈抑制蛋白ALP2的活性,乙二胺四乙酸(EDTA)与碘乙酸微弱抑制蛋白酶的活性。利用纯化的酶酶解砺虾蛋白,螺旋藻蛋白(Arthospiraplatensis),酵母N3C(Yarrowia,lipolytica)和YA03a(Hansenia sporauvarum)蛋白,来自蛎虾蛋白的水解物ACE抑制活性与抗氧化活性最高,分别达到88.3%与47.3%。这说明纯化的ALP2蛋白酶在食品和医药方面具有良好的前景。利用简并PCR、反向PCR与RT-PCR获得了蛋白酶ALP2基因的DNA序列与cDNA序列。基因ALP2的DNA序列为1354 bp,在NCBI(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)的登陆号为EU331441。ALP2基因的开放阅读框(ORF)1248 bp,在NCBI上的登陆号为EU224431,编码415个氨基酸,推导分子量为42.9 kDa。基因ALP2具有两个内含子,分别为54bp和52 bp。通过分子生物学软件分析,基因ALP2前18个氨基酸为信号肽序列,此基因编码的蛋白具有丝氨酸活性位点与组氨酸活性位点,等电点为6.44。利用质粒pINA1317对基因进行表达验证,发现转化子能在牛奶-PPB双层平板上形成明显的透明圈。转化子的发酵上清液的蛋白酶活性也进行了检测,结果说明克隆到的基因ALP2确实为蛋白酶基因,而且能在Y.lipolytica中进行表达,并分泌到细胞外。利用本实验室构建的表面展示质粒pINA1317-YICPW110对蛋白酶基因ALP2进行了表面展示,转化子能在牛奶双层平板上形成明显的透明圈。表面展示的蛋白酶酶解不同的蛋白源能够产生活性肽,发现酶解金黄色隐球酵母G7a(Cryptococcus aureus)的细胞蛋白所产活性肽的ACE抑制活性最高,酶解螺旋藻蛋白所产活性肽的抗氧化活性最高。这是首次关于利用表面展示蛋白酶进行活性肽的生产的报道。将表面展示的蛋白酶进行了酶学特性研究,发现与菌株HN2-3所产的野生型蛋白酶相比,最适作用温度有所降低,温度稳定性增强;另外发现表面展示的蛋白酶对金属离子的亲和力降低。
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全文目录
摘要 5-7 Abstract 7-14 第一章 绪论 14-45 前言 14-15 第一节 蛋白酶的研究进展 15-24 第二节 生物活性肽的研究进展 24-35 第三节 表面展示技术的研究进展 35-41 第四节 海洋酵母的研究进展及本研究的目的与意义 41-45 第二章 产蛋白酶海洋酵母的筛选 45-59 1 前言 45 2 材料和方法 45-52 2.1 材料 45-47 2.2 方法 47-52 3 结果与讨论 52-58 3.1 产蛋白酶海洋酵母的筛选 52-53 3.2 5株海洋酵母的鉴定 53-56 3.3 酶解蛎虾蛋白所产活性肽的ACE抑制活力测定 56-58 4 本章小结 58-59 第三章 A.pullulans HN2-3蛋白酶的分离纯化、特性研究及酶解不同蛋白源产活性肽的研究 59-79 1 前言 59-60 2 材料和方法 60-66 2.1 材料 60-61 2.2 方法 61-66 3 结果与讨论 66-77 3.1 蛋白酶发酵液浓缩及Sephadex~(TM) G-75凝胶层析部分纯化 66-67 3.2 DEAE-Sepharose Fast Flow阴离子交换层析柱纯化化 67-69 3.3 不连续SDS-PAGE凝胶电泳 69-70 3.4 纯化蛋白酶最适作用温度与温度稳定性 70-72 3.5 纯化蛋白酶最适作用pH与pH稳定性 72-73 3.6 金属离子对蛋白酶ALP2酶活的影响 73-74 3.7 蛋白抑制剂对纯化蛋白酶ALP2酶活的影响 74-75 3.8 蛋白水解产物ACE抑制活性和抗氧化活性 75-77 4 本章小结 77-79 第四章 A.pullulans HN2-3蛋白酶基因克隆与信息学分析 79-112 1 前言 79-81 2 材料和方法 81-93 2.1 材料 81-84 2.2 方法 84-93 3 结果和讨论 93-111 3.1 简并PCR引物的设计 93-97 3.2 简并PCR克隆碱性蛋白酶ALP2部分基因 97-98 3.2.1 A.pullulans HN2-3基因组DNA的提取及简并PCR 97-98 3.2.2 简并PCR结果 98 3.3 反向PCR获得碱性蛋白酶ALP2全部基因 98-100 3.3.1 反向PCR引物设计 99 3.3.2 限制性内切酶酶切基因组DNA及连接环化 99 3.3.3 反向PCR 99-100 3.4 碱性蛋白酶基因ALP2生物信息学分析 100-111 3.4.1 序列在NCBI的比对结果及碱性蛋白酶基因ORF框推测 100-101 3.4.2 反转录PCR 101-105 3.4.3 碱性蛋白酶ALP2氨基酸序列分析 105-111 4 本章小结 111-112 第五章 普鲁兰短梗霉HN2-3蛋白酶基因APL2的表达 112-124 1 前言 112-113 2 材料与方法 113-117 2.1 材料 113-114 2.2 方法 114-117 3 结果与讨论 117-123 3.1 受体菌的选择 117-119 3.2 PMD19-T simple-ALP2重组质粒构建 119-120 3.3 连接表达载体的阳性克隆的检测 120-121 3.4 含蛋白酶基因的质粒片断转化Y.lipolytica Polh 121 3.5 转化子蛋白酶活力的测定 121-123 4 本章小结 123-124 第六章 A.pullulans HN2-3蛋白酶ALP2的表面展示及表面展示蛋白酶的特性研究 124-143 1 前言 124-125 2 材料和方法 125-129 2.1 材料 125-126 2.2 方法 126-129 3 结果与讨论 129-141 3.1 蛋白酶ALP2表面展示质粒构建 129-130 3.2 PMD19-T Vector simple-ALP2重组质粒的构建 130-131 3.3 重组质粒pINA1317-YICPW110-ALP2的构建 131-133 3.4 含蛋白酶基因的质粒片断转化Y.lipolytica Polh 133 3.5 免疫荧光反应 133-134 3.6 转化子蛋白酶活力的测定 134-136 3.7 具6×His标签的表面展示蛋白的特性研究 136-141 3.7.1 表面展示蛋白酶最适作用pH与pH稳定性 136-138 3.7.2 表面展示蛋白酶最适作用温度和温度稳定性 138-139 3.7.3 金属离子对表面展示蛋白酶ALP2酶活的影响 139 3.7.4 蛋白抑制剂对表面展示蛋白酶ALP2酶活的影响 139-141 4 本章小结 141-143 第七章 表面展示蛋白酶ALP2酶解不同蛋白源产活性肽的研究初步 143-150 1 前言 143-144 2 材料和方法 144-146 2.1 材料 144-145 2.2 方法 145-146 3 结果与讨论 146-149 3.1 蛋白水解产物抑制ACE活性与抗氧化活性 146-148 3.2 表面展示蛋白酶使用周期的测定 148-149 4 本章小结 149-150 参考文献 150-162 总结与创新点 162-164 发表的学术论文 164-165 附录 165-167 致谢 167
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中图分类: > 生物科学 > 微生物学
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