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陕西省汉族人群的亚群分析及藏族Y-STR多态性研究

作　者: 丁虹
导　师: 蒙世杰
学　校: 西北大学
专　业: 动物学
关键词: 短串联重复序列(STR) 群体遗传学 Hardy-Weinberg平衡 亚群 共祖系数FST Y染色体 单倍型 等位基因
分类号: Q987
类　型: 硕士论文
年　份: 2007年
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内容摘要


我国是多民族的大国，由于地域、历史文化背景和社会生活习俗等原因，往往存在着某种程度上隔离的亚群结构。由于在法医学上通常是用被检验者所在群体的等位基因频率计算个人识别率和亲权概率，所以在应用DNA进行个体识别和亲权鉴定时要充分考虑亚群等位基因频率的分布特点（亚群结构）。研究亚群结构的特点，是法庭DNA群体遗传学中研究的热点。本实验主要分为两部分，第一部分通过使用复合荧光扩增试剂盒、3100Avant遗传分析仪，对陕西省宝鸡、商洛、安康、渭南、成阳、西安、延安、榆林、铜川、汉中10个市的共662个随机样本进行D3S1358、vWA、FGA等位点的检测，得到各群体上9个位点的基因分型，计算出等位基因频率。除个别位点外，大部分群体均符合Hardy-Weinberg平衡，固定指数接近于0，也没有杂合子缺少现象；通过AMOVA分析得到遗传变异主要存在个群体内部，各群体之间等位基因的分布均没有显著性差异，遗传一致度比较高，遗传距离较小；共祖系数FST均较小，平均0.011；以上数据使用Popgen1.31、Alerque3.01、SPSS11.0软件计算得到。以上结果说明陕西地区汉族人群中没有明显的亚群结构的差异。本研究不仅分析了陕西省汉族人群是否存在明显亚群结构的差异；而且丰富了我国人类遗传学的研究资料。第二部分主要研究藏族DYS456、DYS391、DYS439、DYS635等9个位点的遗传多样性。藏族是我国重要的少数民族，主要分布于青藏高原，生存环境相对封闭及宗教文化的特殊使这个群体的遗传结构独特。通过使用复合扩增试剂盒、3100Avant遗传分析仪对DYS456、DYS391、DYS439、DYS635等9个Y-STR的基因位点进行了检测，9个基因座共检出44个等位基因，它们组成了95种单倍型；并通过统计学计算得出各位点的基因频率及基因型频率，各位点的基因多样性（Gene diversity，GD）值分布在0.452～0.803之间，表明藏族群体在这9个Y-STR基因座具有丰富的遗传多态性，且由其组成的单倍型系统具有较强的个体差异，这些结果对认识中国藏族的进化、群体的遗传结构及法医学鉴定均具有重要价值。

全文目录


缩略词表  3-4
中文摘要  4-6
Abstract  6-8
目录  8-10
第一部分 前言  10-17
  1 遗传多样性与微卫星标记  10-12
  2 STR在法医学上的应用  12-13
  3 亚群分析  13-14
  4 群体的Y-STR遗传多样性分析  14-15
  5 研究目的和意义  15-17
第二部分 研究内容  17-48
  第一章 陕西省汉族人群的亚群分析  17-40
    1 实验材料和方法  17-19
      1.1 实验材料  17
        1.1.1 主要试剂和仪器  17
        1.1.2 实验样本  17
      1.2 实验方法  17-19
        1.2.1 基因组DNA的提取  18
        1.2.2 PCR反应  18-19
        1.2.3 3100-Avan检测  19
        1.2.4 数据的统计学处理  19
    2 结果  19-36
      2.1 各基因座等位基因频率  20-25
      2.2 各群体的遗传多样性的度量  25-29
      2.3 各群体的遗传学结构的度量  29-31
        2.3.1 检验各群体是否符合Hardy—Weinberg平衡  29-30
        2.3.2 固定指数  30
        2.3.3 杂合性基因多样度的比率  30-31
      2.4 群体间遗传关系的度量  31-36
        2.4.1 遗传变异在群体中的分布  31-32
        2.4.2 各地区不同位点间等位基因频率分布的比较  32-35
        2.4.3 各个群体间的遗传一致度和遗传距离  35-36
    3 讨论  36-40
  第二章 藏族群体的Y-STR多态性分析  40-48
    1 实验材料和方法  40-41
      1.1 实验材料  40
        1.1.1 主要试剂和仪器  40
        1.1.2 实验样本  40
      1.2 实验方法  40-41
        1.2.1 基因组DNA的提取  41
        1.2.2 PCR反应  41
        1.2.3 3100-Avant检测  41
        1.2.4 数据的统计学处理  41
    2 结果  41-46
      2.1 各基因座等位基因及其频率分布  41-42
      2.2 单倍型及频率  42-46
    3 讨论  46-48
第三部分 全文总结  48-49
第四部分 工作不足与展望  49-50
参考文献  50-55
致谢  55

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中图分类: > 生物科学 > 人类学 > 人类遗传学
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