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秀丽白虾五群体形态和遗传特征初步研究

作　者: 陈杰
导　师: 陈立侨
学　校: 华东师范大学
专　业: 动物学
关键词: 秀丽白虾群体形态学多元统计方法细胞色素c氧化酶亚基I基因序列分析简单重复序列间扩增多态性
分类号: S917.4
类　型: 硕士论文
年　份: 2006年
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内容摘要

运用多元统计方法、DNA序列分析及简单重复序列间扩增等技术，对我国的经济淡水虾类，秀丽白虾(Exopalaemon modestus)太湖、滇池、兴凯湖、巢湖、呼伦湖5群体进行系统比较研究，尝试从不同层面(形态学、分子遗传学)揭示群体间的差异和各自的特征，较全面和准确地反映秀丽白虾各群体的遗传背景及相互之间的关系，以期为秀丽白虾种质资源研究的开展和人工养殖的可持续发展提供理论基础和技术储备。研究结果如下： 1．秀丽白虾5群体形态变异判别分析分别测量了300尾采自中国五个淡水湖(太湖、滇池、呼伦湖、兴凯湖、巢湖)秀丽白虾的10项形态学指标，运用三种多元统计方法对不同群体间的形态差异进行了比较研究。聚类分析结果表明：太湖群体和滇池群体的形态最为接近，而与兴凯湖群体，呼伦湖群体和巢湖群体的趋异程度逐渐增加；判别分析按雌、雄个体分别建立了5个群体的判别函数，其中雌体的判别准确率为：80.0％—93.5％(P1)，87.5％—93.5％(P2)，综合判别率为90.8％；雄体的判别准确率为：80.0％—90.3％(P1)，77.1％—95.2％(P2)，综合判别率为87.8％，五个群体间的形态差异须有多项参数综合判别才能辨识；主成份分析构建的三个雌体主成份的累积贡献率为75.97％，而三个雄体主成份的累积贡献率为73.63％，五群体间的形态差异主要取决于全长、尾肢长、头胸甲长、头胸甲宽、腹部长和腹部宽等6项形态学特征，推测秀丽白虾的形态变异与其生活的水体理化因子和底质不同密切相关，环境因子对白虾形态特征的选择作用，使其群体表型具有可塑性。此外，不当的引种和人工养殖对滇池群体种质混杂的不良影响，需要进一步深入研究，并在选种过程中加以重视。 2．秀丽白虾5群体细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ(COI)基因序列分析利用无脊椎动物线粒体COI基因序列可变区通用引物扩增出随机取自上述5群体的25尾秀丽白虾的COI基因片段，并进行测序和序列的遗传多态性分析。通过对5群体COI基因序列的核苷酸组成，位点变异，基因型共享性及遗传距离的比较，及对以最大简约法(Maximum parsimony, MP)构建的群体间聚类图的分析，得到如下结果：秀丽白虾COI基因的序列组成AT含量均高于GC含量，这与许多研究者在果蝇、虾类、蟹类等的线粒体蛋白编码基因中观察到的结果相似；在测得的628bp COI基因片断中，太湖群体的变异位点数最多(13)，兴凯湖群体、巢湖群体和呼伦湖群体的变异位点数仅为2，与太湖群体相差悬殊，推

全文目录

Abstract in Chinese  8-10
Abstract in English  10-12
Chapter 1: The research development of Exopalaemon modestus Heller  12-16
Chapter 2: The morphological discrimination of five geographical populations  16-26
  1 Material and methods  16-17
    1.1 Shrimp  16
    1.2 Morphological parameters and measurement  16-17
    1.3 Statistical analysis  17
  2 Results  17-23
    2.1 Cluster analysis  17-19
    2.2 Discriminant analysis  19-21
    2.3 Principal component analysis  21-23
  3 Discussion  23-26
    3.1 The relation between geographic populations and morphological variance  23-24
    3.2 Evaluation on the multivariate statistical approaches  24-26
Chapter 3: The polymorphism of mitochondrial COI sequences of five geographical populations  26-38
  1 Material and methods  26-28
    1.1 Shrimp  26
    1.2 Instruments and reagents  26
    1.3 Genome DNA extraction  26-27
    1.4 PCR amplification and the yield of DNA  27-28
    1.5 Sequencing  28
    1.6 Data analysis  28
  2. Results  28-35
    2.1 DNA extraction  28-29
    2.2 PCR products  29
    2.3 Homologous comparison  29
    2.4 Sequences variation  29-35
  3 Discussion  35-38
    3.1 Base composition ofE. modestus  35
    3.2 Locus variation and genotype of five populations  35-36
    3.3 Pairwise nucleotide distances between and within five populations  36-38
Chapter 4: The polymorphism of Inter Simple Sequence Repeats (ISSRs) of five geographical populations  38-48
  1 Material and methods  38-40
    1.1 Shrimp  38
    1.2 Instruments and reagents  38
    1.3 Genome DNA extraction  38
    1.4 PCR amplification and data analysis  38-40
  2. Results  40-46
    2.1 Screening of ISSR primers  40-41
    2.2 ISSR polymorphism  41-45
    2.3 Genetic diversity and dendrogram  45-46
  3 Discussion  46-48
    3.1 Selection of ISSR primers  46-47
    3.2 Polymorphism among five populations  47
    3.3 Genetic diversity of five populations  47-48
Conclusion  48-49
References  49-53
Appendix: The application of molecular markers in defending bioinvasions  53-56
Acknowledgement  56

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