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基于液泡膜Na+/H+逆转运基因家族基因位点对胡杨和灰杨的群体结构和物种分化研究
作 者: 郭秋红
导 师: 刘建全
学 校: 兰州大学
专 业: 生态学
关键词: 胡杨 灰杨 核苷酸多样性 群体结构 物种分化 基因流
分类号: S792.119
类 型: 硕士论文
年 份: 2011年
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内容摘要
胡杨(Populus euphratica)和灰叶胡杨(简称灰杨,P. pruinosa)是杨属胡杨组仅有的两个物种,因其主要分布于我国西北部的沙漠及河岸而具有很强的耐盐性。两个物种在我国新疆境内存在重叠的分布区,同时在叶片形态和花期物候上存在显著差异。本论文运用分子群体遗传学的方法来比较研究这两个生态物种的核苷酸多态性模式和群体遗传差异,并用隔离-迁移模型(IM)模拟了种间基因流及物种分化情况。对胡杨和灰杨在我国整个自然分布区内12个种群共48个个体的6个耐盐的液泡膜型Na+/H+逆转运基因(NHX1, NHX2, NHX3, NHX-like4, NHX5, NHX6)进行扩增、克隆和测序。在6个基因座上,灰杨(0.00757)的平均核苷酸多态性水平是胡杨(0.00379)的两倍。分子变异分析(AMOVA)表明两个物种的种内分化水平相近(胡杨:FST=0.343;灰杨:FST=0.327),而种间存在显著的遗传分化(FST=0.671)。STRUCTURE聚类分析表明两个物种单独成族,分化显著。基于单个基因座位的系统发育分析表明(NETWORK和NJ进化关系图)两个物种的单倍型谱系分支明显,但存在共享单倍型。另外,IM模拟显示从胡杨到灰杨存在不对称的基因流。胡杨和灰杨生态环境的差异可能导致耐盐抗旱等相关的性状在它们之间发生分化,而分化选择作用进一步加速两物种生殖隔离趋于完全。同时,基因渐渗对两物种的遗传多样性模式也产生了重大的影响。基因流和不完全的谱系筛选可能是导致种间共享多态性存在的主要原因。
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全文目录
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中图分类: > 农业科学 > 林业 > 森林树种 > 阔叶乔木 > 杨 > 其他
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