液质联用蛋白质组学鉴定方法的建立及其在正常人尿蛋白质组鉴定中的应用

作　者: 孙伟
导　师: 高友鹤
学　校: 中国协和医科大学
专　业: 病理生理学
关键词: 蛋白质鉴定反相液相色谱电喷雾质谱丰度抑制电喷雾离子阱质谱 SEQUEST算法 Xcorr筛选方法 Unified score筛选方法两个或多个多肽筛选方法 AMASS(Advanced MAss Spectrum Screener) SEUQEST 手工验证人尿蛋白质组液相色谱电泳重复率
分类号: R341
类　型: 博士论文
年　份: 2005年
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内容摘要

本文对应用液质联用方法分离鉴定蛋白质组的多肽洗脱条件及鉴定的多肽性质进行了系统的分析研究。利用牛血清白蛋白酶切后产生的多肽混合物，应用液相色谱的学位论文">反相液相色谱和电喷雾离子阱质谱联用的方法进行鉴定，确定多肽适宜的色谱洗脱条件，用马细胞色素C的酶切肽段对洗脱条件进行进一步验证，并确定液质联用方法的灵敏度。同时，本文对被鉴定的多肽性质进行了系统的分析。本实验表明胰酶酶切多肽的适宜乙腈洗脱梯度为5—30％，应用液质联用方法其鉴定灵敏度可以达到50fmol。对相应多肽性质分析表明，较长(长度在10个氨基酸以上)及带两个正电荷的多肽更易于被鉴定。本研究中所鉴定的多肽呈现出三种类型的重复鉴定即冗余性，(1)鉴定冗余：一种电荷状态的一个多肽被重复鉴定；(2)电荷冗余：几种电荷状态的同一多肽被重复鉴定；(3)序列冗余：由同一多肽产生序列上差一个或几个氨基酸的多个多肽重复鉴定。

全文目录

序言  4-5
第一部分液质联用蛋白质组学鉴定方法的建立  5-31
  第一章应用液质联用方法鉴定蛋白质  6-21
    前言  8-9
    材料与方法  9-10
    结果与讨论  10-19
    结论  19-20
    参考文献  20-21
  第二章蛋白质组鉴定中蛋白质丰度抑制的研究  21-31
    前言  23-24
    材料与方法  24-26
    结果  26-28
    讨论  28-29
    结论  29-30
    参考文献  30-31
第二部分蛋白质组数据库检索结果分析方法的评价及其改进  31-64
  第三章评价SEQUEST检索结果筛选参数—Xcorr和Unified Score  32-49
    前言  34-36
    材料与方法  36-38
    结果  38-40
    讨论  40-42
    结论  42-43
    参考文献  43-49
  第四章应用手工验证规则自动验证SEQUEST检索结果质量  49-64
    前言  51-52
    材料与方法  52-57
    结果  57-60
    讨论  60-61
    结论  61-62
    参考文献  62-64
第三部分蛋白质组学技术的应用  64-86
  第五章应用三种分离方法对尿蛋白质组进行分析  65-86
    前言  67-68
    材料与方法  68-70
    结果和讨论  70-76
    结论  76-77
    参考文献  77-86
文献综述蛋白质组学研究进展  86-94
在读期间发表文章  94
在读期间参加会议  94-95
致谢  95-96
附录  96-106

液质联用蛋白质组学鉴定方法的建立及其在正常人尿蛋白质组鉴定中的应用

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