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一株黄土高原土壤放线菌新种的鉴定

作　者: 王婷婷
导　师: 韦革宏
学　校: 西北农林科技大学
专　业: 微生物学
关键词: 放线菌 多相分类 系统发育分析
分类号: S154.5
类　型: 硕士论文
年　份: 2011年
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内容摘要


本研究旨在对分离自陕西黄土高原地区富县的一株土壤放线菌潜在新种F22T进行鉴定。本研究使用多相分类的方法,对供试菌株进行了形态学特征、生理生化特性、化学分类、16S rDNA系统发育、DNA-DNA同源性等方面的研究,以确定供试菌株的分类地位。形态学特征研究结果表明:F22T的气生菌丝与基内菌丝发育良好,分支广泛,气生菌丝不断裂、无横隔,且可以发育为螺旋状的孢子链,孢子椭圆形,孢子表面光滑,这些形态学特征与典型的链霉菌属特征相符。根据F22T的培养特征,把它初步归属于链霉菌的粉红孢类群。化学分类研究结果表明:F22T细胞壁含L,L-DAP,甘氨酸,细胞壁类型(Icell-wall type I)。全细胞水解液主要糖为半乳糖、阿拉伯糖、核糖。磷酸类脂组分主要为磷脂酰乙醇胺、磷脂酰肌醇、磷脂酰甘油,即为PII型。甲基萘醌类型为[MK-9(H6, H8,H4)]。脂肪酸主要包括iso-C14:0 (11.45%),anteiso-C15:0 (20.09%), iso-C16:0 (35.55 %)。化学分类结果亦符合链霉菌属化学分类特征。16S rDNA系统发育分析表明:F22T属于Streptomyces属。它与Streptomyces resistomycificus,Streptomyces chartreusis,Streptomyces ciscaucasicus,Streptomyces canus关系十分密切,F22T与Streptomyces resistomycificus的16S rDNA基因相似度为98.28%,与其他三者16S rDNA基因的相似度均为98.13%。在系统分类树状图中,该菌株构成一个独立的分支,与参比菌株有着较大的遗传距离。初步判定它是不同于已知种的新种。DNA-DNA同源性分析实验结果表明:F22T DNA G+C含量是70.6mol%,与Streptomyces resistomycificus(98.28%) NRRL 2290、Streptomyces chartreusis (98.13%)NRRL 2287、Streptomyces ciscaucasicus(98.13%) NRRL B-51078和Streptomyces canus (98.13%)NRRL B-1989的DNA同源性分别为48.7%、45.2%、40.6%、39.2%,远远低于70%的链霉菌新种标准。生理生化特性研究结果表明:在所进行的59项生理生化指标测试中,F22T与参比模式菌株存在23项生理生化指标差异。生物活性研究表明:F22T对靶标细菌中的金黄色葡萄球菌(Staphyloccocus aureus Rosenbach)、枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis (Ehrenberg) Cohn)的抑制作用较强。在供试的靶标真菌中F22T对西洋参锈腐病菌(Cylindrocarpon destructans (Zinssn) Scholten)的抑制作用较强。综合以上研究结果,F22T应视为链霉菌属一个新发现种,暂命名为Streptomyces sp. nov.

全文目录


摘要  5-7
ABSTRACT  7-10
第一章 文献综述  10-17
  1.1 引言  10
  1.2 放线菌的分类学地位  10-11
  1.3 放线菌多相分类简介  11-16
    1.3.1 传统分类  11-12
    1.3.2 数值分类  12
    1.3.3 化学分类  12-14
    1.3.4 分子分类  14-16
  1.4 展望  16
  1.5 研究内容  16-17
第二章 形态学特征及生理生化特性研究  17-22
  2.1 形态学特征研究  17-19
    2.1.1 材料  17
    2.1.2 方法  17-18
    2.1.3 结果与讨论  18-19
  2.2 生理生化特性研究  19-22
    2.2.1 供试菌株  19
    2.2.2 方法  19
    2.2.3 结果与讨论  19-22
第三章 细胞化学组分分析  22-26
  3.1 全细胞壁氨基酸分析  22
  3.2 全细胞糖分析  22-23
  3.3 磷酸类脂分析  23-24
  3.4 醌组分分析  24
  3.5 脂肪酸分析  24-25
  3.6 结果与讨论  25-26
第四章 分子水平鉴定  26-32
  4.1.16S rDNA 系统发育分析  26-29
  4.2 DNA-DNA 同源性分析及G+C %测定  29-32
第五章 生物活性测定  32-35
  5.1 材料  32
  5.2 方法  32-33
    5.2.1 靶标细菌抑菌活性测定  32-33
    5.2.2 靶标真菌抑菌活性测定  33
  5.3 结果与讨论  33-35
第六章 结论  35-36
参考文献  36-38
附录  38-58
致谢  58-59
作者简介  59

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中图分类: > 农业科学 > 农业基础科学 > 土壤学 > 土壤生物学 > 土壤动物学
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