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东乡野生稻恢复基因QTL定位
作 者: 张金伟
导 师: 谢建坤
学 校: 江西师范大学
专 业: 生态学
关键词: 东乡野生稻 恢复基因 定位
分类号: S511.9
类 型: 硕士论文
年 份: 2011年
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内容摘要
开展野生稻恢复基因的研究有助于探索恢复基因的起源、细胞质与核间的相互作用,培育优良恢复系。本文选用栽培稻保持系协青早B为母本,东乡野生稻为父本,建立由239个株系组成的协青早B//协青早B/东乡野生稻BC1F10回交重组自交系群体。应用130对SSR标记构建遗传图谱,并利用协青早A/(协青早B//协青早B/东乡野生稻)BC1F10和中9A/(协青早B//协青早B/东乡野生稻)BC1F10两套测交群体对东乡恢复基因进行了QTL定位,主要结果如下:(1)应用协青早A/(协青早B//协青早B/东乡野生稻)BC1F10和中9A/(协青早B//协青早B/东乡野生稻)BC1F10两套测交群体对东乡野生稻恢复基因进行经典遗传学研究,结果表明:东乡野生稻对矮败型(CMS-DA)和印尼水田谷型(CMS-IA)不育系的育性恢复受主效恢复基因控制,同时还受微效恢复基因影响。(2)应用协青早B//协青早B/东乡野生稻BC1F10回交重组自交系群体,构建了由130个SSR标记组成的连锁遗传图谱。该图谱覆盖了水稻12条染色体,总图距为1530.8cM,标记间的平均距离为11.8cM。(3)利用WinQTLCart2.5软件对东乡野生稻恢复基因进行QTL分析,以LOD大于2.5为阈值,采用复合区间作图(CIM)法检测QTL。结果表明:1.在协青早A/(协青早B//协青早B/东乡野生稻)BC1F10群体中,仅在第10染色体RM304-RM171区间检测到一个QTL,其贡献率为10.0%。2.在中9A/ (协青早B//协青早B/东乡野生稻)BC1F10群体中在第1染色体RM10116-RM10176区间检测到一个QTL,其贡献率为8.2%;在第5染色体RM289-RM249区间和RM3870-RM274区间各检测到一个QTL,贡献分别为12.5%和6.5%;在第10染色体上RM1375-RM5620和RM304-RM171区间各检测到一个QTL,贡献率分别为4.8%和5.5%。(4)对东乡野生稻中控制协青早A和中9A的育性恢复QTL进行比较分析,结果表明:在第10染色体RM304-RM171区间都检测到一个QTL,位置基本一致;不同的是协青早A/(协青早B//协青早B/东乡野生稻)BC1F10群体中未检测到中9A/ (协青早B//协青早B/东乡野生稻)BC1F10群体中所存在的其它QTL。说明东乡野生稻具有对协青早A、中9A不育系育性恢复QTL,其育性恢复QTL数目、效应因不同群体、遗传背景而异。
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全文目录
摘要 4-6 ABSTRACT 6-8 插图和附表清单 8-9 缩略词 9-12 1 文献综述 12-22 1.1 水稻恢复基因研究进展 12-17 1.1.1 水稻细胞质雄性不育性的类型 12-13 1.1.2 水稻恢复基因的来源 13 1.1.3 恢复基因的经典遗传学研究 13-14 1.1.4 恢复基因的定位 14-16 1.1.5 恢复基因的应用 16-17 1.2 东乡野生稻有利基因研究概况 17-19 1.2.1 东乡野生稻有利基因的研究现状 17-18 1.2.2 东乡野生稻恢复性研究 18-19 1.3 水稻分子标记概述 19-21 1.3.1 基于DNA 分子杂交为核心的分子标记 19-20 1.3.2 基于PCR 为核心的分子标记 20 1.3.3 基于PCR 与酶切相结合为核心的分子标记 20-21 1.3.4 基于单核苷酸多态性的DNA 标记 21 1.4 本论文研究内容的提出 21-22 2 材料与方法 22-27 2.1 材料 22 2.2 技术路线 22-23 2.3 表型鉴定 23 2.4 分子标记分析 23-26 2.4.1 DNA 提取 23-24 2.4.2 SSR 标记检测 24-26 2.5 数据分析 26-27 2.5.1 连锁图谱构建 26 2.5.2 QTL 检测 26-27 3 结果与分析 27-35 3.1 东乡野生稻经典遗传学研究 27-30 3.1.1 “协青早A/XD-BIL”测交群体育性遗传分析 27 3.1.2 “中9A/XD-BIL”测交群体育性遗传分析 27-28 3.1.3 “东野”一对或二对恢复基因的遗传模式 28-30 3.2 连锁图谱构建 30-32 3.2.1 多态性检测 30-31 3.2.2 连锁遗传图谱 31-32 3.3 恢复基因QTL 定位 32-35 3.3.1 协青早A/XD-BIL 测交群体中育性恢复QTL 检测 32-33 3.3.2 中9A/XD-BIL 测交群体中育性恢复QTL 检测 33-35 4 讨论 35-37 5 本论文主要结论 37-38 6 下一步工作设想 38-40 6.1 构建近等基因系 38 6.2 “东野”恢复基因QTL 精细定位与克隆 38 6.3 利用“东野”恢复基因改良恢复系前景 38-40 参考文献 40-46 附录 46-50 致谢 50-51 作者简历 51 在读期间公开发表论文(著)及科研情况 51
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中图分类: > 农业科学 > 农作物 > 禾谷类作物 > 稻 > 野生稻
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