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用重组自交系构建西瓜分子遗传图谱

作　者: 张仁兵
导　师: 寿森炎；许勇
学　校: 浙江大学
专　业: 蔬菜学
关键词: 西瓜(Citrullus lanatus) 分子遗传图谱 RAPD ISSR SCAR
分类号: S651
类　型: 硕士论文
年　份: 2003年
下　载: 261次
引　用: 5次
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内容摘要


用可溶性固形物含量高、皮薄、感枯萎病的栽培西瓜自交系（Citrullus lanatus var. lanatus）97103和可溶性固形物含量低、皮厚、抗病的野生西瓜种质（Citrullus lanatus var. citroides）PI296341杂交所得重组自交系F8的117个单株为作图群体，构建西瓜分子遗传图谱。该图谱包含87个RAPD标记、13个ISSR标记和4个SCAR标记，分为15个连锁群，包括1个最大的含31个标记的连锁群（277.5cM）、6个大的含4-12个标记的连锁群（51.7cM-172.2cM）和8个小的含2-5个标记的连锁群（7.9cM-46.4cM），覆盖基因组的1027.5cM。两个标记间的平均距离为11.54cM。该图谱为以后获得饱和的分子遗传图谱、重要农艺性状的QTL分析以及图谱克隆抗病基因奠定了坚实的基础。

全文目录


中文摘要  10-11
英文摘要  11-12
1 前言  12-14
2 文献综述  14-31
  2．1 构建分子遗传图谱的原理和方法  14-15
    2．1．1 构建分子遗传图谱的理论基础  14
    2．1．2 构建分子遗传图谱的基本方法  14-15
  2．2 构建分子遗传图谱的常用遗传标记  15-22
    2．2．1 形态学标记  15
    2．2．2 细胞学标记  15-16
    2．2．3 生化标记  16
    2．2．4 分子标记  16-22
      2．2．4．1 RFLP标记  18
      2．2．4．2 RAPD标记  18-19
      2．2．4．3 SCAR标记  19-20
      2．2．4．4 STS标记  20
      2．2．4．5 SSR标记  20-21
      2．2．4．6 AFLP标记  21
      2．2．4．7 几种常见DNA指纹图谱技术的比较  21-22
  2．3 构建分子遗传图谱的群体类型  22-25
    2．3．1 亲本的选配  22-23
    2．3．2 分离群体类型的选择  23-24
    2．3．3 作图群体的大小  24-25
  2．4 遗传作图的数据分析方法与统计学原理  25-26
    2．4．1 两点测验  25
    2．4．2 多点测验  25-26
    2．4．3 交换干扰与作图函数  26
    2．4．4 与遗传作图有关的计算机软件  26
  2．5 分子遗传图谱的应用和意义  26-28
    2．5．1 数量性状位点（QTL）定位研究  27
    2．5．2 标记辅助育种（MAS）研究  27
    2．5．3 基因克隆  27-28
  2．6 分子遗传图谱的展望  28-31
3 材料与方法  31-43
  3．1 试验材料  31-32
  3．2 研究方法  32-43
    3．2．1 材料的处理  32
    3．2．2 基因组DNA的提取  32-33
    3．2．3 DNA的检测及浓度处理  33
    3．2．4 RAPD-PCR扩增及其电泳检测  33-34
      3．2．4．1 反应体系  33-34
      3．2．4．2 反应程序  34
      3．2．4．3 电泳及其检测  34
    3．2．5 ISSR-PCR扩增与电泳检测  34-36
      3．2．5．1 ISSR引物序列  34
      3．2．5．2 反应程序  34-35
      3．2．5．3 聚丙烯酰胺凝胶电泳  35-36
      3．2．5．4 银染显色  36
    3．2．6 SCAR-PCR扩增及其检测  36-42
      3．2．6．1 RAPD-PCR扩增及其检测  36-37
      3．2．6．2 RAPD（PCR）产物与载体的连接  37
      3．2．6．3 感受态细胞的制备  37-38
      3．2．6．4 重组质粒的转化  38
      3．2．6．5 重组质粒的筛选  38-39
      3．2．6．6 重组质粒的提取与鉴定  39-41
      3．2．6．7 SCAR引物的设计  41
      3．2．6．8 SCAR-PCR扩增及检测  41-42
        3．2．6．8．1 SCAR特异引物  41
        3．2．6．8．2 SCAR反应程序  41
        3．2．6．8．3 SCAR标记的验证与扩增产物的快速检测  41-42
    3．2．7 数据记录与标记命名  42
    3．2．8 连锁分析  42-43
4 结果与分析  43-64
  4．1 基因组DNA检测与浓度处理标准  43-44
  4．2 RAPD标记分析  44-48
  4．3 ISSR标记分析  48-49
  4．4 SCAR标记分析  49-53
    4．4．1 特异片段的回收与克隆  49-50
    4．4．2 RAPD标记K14-1500、N-600、T19-1600的测序结果  50
    4．4．3 SCAR标记引物的设计与扩增  50-51
    4．4．4 SCAR标记在群体上的扩增  51-53
  4．5 连锁图谱的构建  53-63
  4．6 偏分离标记间的相互联系及其在连锁群中的定位  63-64
5 讨论  64-69
  5．1 作图群体（重组自交系）对图谱的影响  64
  5．2 标记种类（RAPD、ISSR、SCAR）对图谱的影响  64-65
  5．3 RAPD标记转化为SCAR标记  65-66
  5．4 遗传图谱覆盖的范围及影响  66-67
  5．5 偏分离标记对图谱的影响  67
  5．6 开展图谱合并的必要性和可行性  67-69
参考文献  69-73
附录  73-78
作者简介  78

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中图分类: > 农业科学 > 园艺 > 瓜果园艺 > 西瓜
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