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应用单细胞PCR方法研究青岛近海一株鳍藻的遗传特征

作　者: 李萍
导　师: 于仁成；周名江
学　校: 中国科学院研究生院（海洋研究所）
专　业: 海洋生物
关键词: 有害赤潮单细胞PCR 鳍藻 LC-MS 亚历山大藻
分类号: X173
类　型: 硕士论文
年　份: 2007年
下　载: 184次
引　用: 2次
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内容摘要

近年来,分子生物学技术与方法被越来越多地应用于有害赤潮研究。其中,单细胞PCR方法是对难以室内培养的有害赤潮藻种进行遗传特征研究的一项重要技术。本实验尝试建立微藻的单细胞PCR方法,并将其应用于鳍藻研究。应用室内培养的亚历山大藻,研究了微藻的单细胞PCR方法,并对藻细胞的固定和保存方法进行了比较。结果表明,浮游植物研究中常用的甲醛固定方法只能用于短期保存样品(少于5天),而乙醇固定、鲁格氏液固定、或者在-20℃下冷冻保存的样品,在较长的时间后(60天)仍可以得到比较理想的PCR扩增结果。应用单细胞PCR方法,对青岛近海采集的鳍藻进行了研究,扩增并测定了包括核糖体大亚基(LSU)rDNA的5’端D1-D2区序列,以及5.8S rDNA和ITS区的部分序列信息。通过分析软件对所得到的鳍藻序列信息与基因库中已知的鳍藻序列信息进行了分析与对比。根据ITS和LSU序列信息构建的系统进化树都显示,本文采集的鳍藻藻种与国外报道的圆形鳍藻聚为一支,初步确定采集的鳍藻应为圆形鳍藻,对该藻种形态学特征的观察也支持这一结果。该藻种部分LSU rDNA序列与欧洲同种鳍藻相似度达到99%,与其它等鳍藻遗传距离在18%-20%之间。测定的ITS区序列与同种圆形鳍藻有62个碱基的差异,与LSU rDNA序列相比,ITS序列变异更大。应用LC-MS方法对该鳍藻的进行了DSP毒素分析,结果未检测到OA或DTX1毒素。这是我国首次应用单细胞PCR方法对鳍藻开展的研究工作,首次报道了我国鳍藻的核糖体部分序列信息。圆形鳍藻在青岛近海海域是初次报道,显示了单细胞PCR方法在鳍藻研究中的重要意义。

全文目录

摘要  8-9
Abstract  9-11
第一章引言  11-14
第二章文献综述  14-28
  2.1 分子生物学在藻类中的应用  14-15
  2.2 单细胞PCR 方法概述  15-20
  2.3 鳍藻研究概述  20-28
第三章单个甲藻细胞 PCR 方法的研究  28-37
  3.1 实验材料与方法  28-30
  3.2 结果  30-32
  3.3 讨论  32-36
  3.4 小结  36-37
第四章青岛近海采集鳍藻样品的分子生物学研究与毒性分析  37-51
  4.1 青岛近海采集鳍藻样品的分子生物学研究  37-48
  4.2 青岛近海采集鳍藻样品的毒性分析  48-51
结论  51-52
参考文献  52-63
完成与发表文章目录  63-64
致谢  64-65
附录  65-67

应用单细胞PCR方法研究青岛近海一株鳍藻的遗传特征

内容摘要

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