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死亡结构域家族蛋白质的研究

作　者: 符晓磊
导　师: 肖奕
学　校: 华中科技大学
专　业: 理论物理
关键词: 蛋白质复合体死亡结构域蛋白关键氨基酸对称
分类号: Q51
类　型: 硕士论文
年　份: 2007年
下　载: 41次
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内容摘要

蛋白质的研究是生命科学领域重要的前沿课题之一。蛋白质是生物体的一种重要的高分子聚合体,是维持生命过程的重要物质,执行着各种各样的生物学功能,如生化反应的催化、营养物质的输运、信号的识别与传递等。众所周知,细胞凋亡是多细胞有机体调节发育的一个重要特征,是细胞在内、外因子的严格控制下一种有步骤有活性的生理性自行消亡的过程,在许多疾病的发生过程中起着重要的作用。参与细胞凋亡最重要的蛋白质是死亡结构域家族蛋白,本文把该家族蛋白质作为研究对象。本论文针对死亡结构域蛋白质家族主要做了两方面的工作:第一,蛋白质-蛋白质相互作用是生命活动的基础,也是产生某些疾病原因,因此蛋白质-蛋白质相互作用的研究能给人类某些疾病的预防、诊断提供帮助,对药物研制或找到靶点药物具有重要的参考价值。蛋白质复合体是蛋白质-蛋白质相互作用的特例,死亡结构域家族中就存在蛋白质复合体。一般认为关键氨基酸是决定蛋白质稳定性和功能的关键因素,也是蛋白质-蛋白质相互作用的关键因素。本文由全原子相互作用定义残基之间的接触能,用得到的接触能确定蛋白质-蛋白质相互作用的关键氨基酸。我们找到的关键氨基酸与实验结果相符,并且我们的计算结果还和许多已经证实了的结论一致。我们的方法对于关键氨基酸预测有一定的可行性,同时也有助于蛋白质相互作用的研究。第二,自从安芬森的蛋白质变性-复性实验以后,人们广泛接受了蛋白质三级结构是由其一级序列决定的。基于这一点,我们在对称的死亡结构域蛋白质家族的序列中寻找决定结构的隐含信息。我们用相似性方法对研究对象做了一系列的分析,为了滤掉随机噪声的影响,考虑了统计显著性,置信概率设为95%。研究结果表明序列内部确实存在相似度很高的一些子片段,证实了结构对称的蛋白质序列也是对称的。我们用不同的物理化学性质对氨基酸进行分类后得到了不同的结果,我们把它与稳定蛋白质的物理化学作用联系起来得到了亲疏水作用对于该家族的结构对称性更为重要。

全文目录

摘要  4-5
ABSTRACT  5-9
1 绪论  9-21
  1.1 前言  9-12
  1.2 蛋白质简介  12-17
  1.3 研究对象介绍  17-20
  1.4 本文的主要结构  20-21
2 蛋白质复合物的关键氨基酸（热点）分析  21-40
  2.1 前言  21-26
  2.2 蛋白质复合体中关键氨基酸分析  26-37
  2.3 讨论  37-39
  2.4 方法的意义  39-40
3 结构对称蛋白的序列研究  40-51
  3.1 前言  40-41
  3.2 研究基础-ANFINSEN 试验  41-42
  3.3 研究对象介绍  42-43
  3.4 采用的方法  43-45
  3.5 结果与讨论  45-50
  3.6 方法的意义  50-51
4 总结与展望  51-53
  4.1 工作总结  51-52
  4.2 展望  52-53
致谢  53-54
参考文献  54-60

死亡结构域家族蛋白质的研究

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