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Ⅳ型HEV real-time RT-PCR方法的建立及重组病毒样颗粒抗原的真核表达
作 者: 贾鹏
导 师: 金宁一
学 校: 吉林大学
专 业: 预防兽医学
关键词: ORF2基因 TaqMan real-time RT-PCR方法 抗原表位 病毒样颗粒 毕赤酵母
分类号: S852.65
类 型: 硕士论文
年 份: 2009年
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内容摘要
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本研究针对基因Ⅳ型HEV基因组ORF3设计特异性的引物和探针,建立了从猪粪便中定量检测基因Ⅳ型HEV的real-time RT-PCR方法。该方法标准曲线的相关系数和斜率分别为0.994和-3.312,并且具有较好的重复性、特异性和灵敏性。所建立的real-time RT-PCR方法能够准确的从阳性基因Ⅳ型HEV毒株中检测到病毒核酸。为基因Ⅳ型戊型肝炎病毒的分子生物学检测奠定基础。在参考相关文献的基础上,通过生物信息学软件分析了基因Ⅳ型HEV CH-S-1毒株基因序列和氨基酸序列,结果表明基因Ⅳ型HEV CH-S-1毒株与CH-87毒株核苷酸和氨基酸同源性最高,分别为92.5%和100%。基因进化树分析结果发现CH-S-1毒株与CH-87毒株在同一分支上,属于基因Ⅳ型Ⅳa亚型。HEV优势抗原表位的预测结果表明HEV ORF2 424~563aa和613~674aa区段绝大部分位于该蛋白表面,而235~372aa区段有部分包裹在所分析蛋白内部。因此本研究初步将ORF2蛋白382~674aa区域(p293)作为HEV优势抗原表位相对集中的区域做进一步研究。通过设计特异性的引物,扩增了ORF2基因截短体293(6286bp~7167bp)并且成功构建了毕赤酵母分泌表达重组质粒pPIC9K-293。重组菌经Muts表型筛选和PCR鉴定后,成功筛选到了阳性重组酵母菌GS115/pPIC9k-293。目的蛋白SDS-PAGE的检测结果可见与预期大小一致的目的带,目的蛋白p293占培养物上清中可溶蛋白的15.7%。Western Blot结果表明目的蛋白具有较好的抗原性。在对诱导表达条件优化后发现,目的蛋白的表达量显著提高。硫酸铵沉淀、透析纯化浓缩目的蛋白,SDS-PAGE分析表明,纯化浓缩后的目的蛋白占总蛋白的85%,约为80mg/L。在透射电镜下观察目的蛋白p293,可见大小为30nm左右的病毒样颗粒。研究结果为HEV血清学诊断方法以及疫苗的相关研究奠定了基础。
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全文目录
内容提要 4-8 绪论 8-10 第一篇 文献综述 10-42 1.1 HEV 生物学特性 10-19 1.1.1 HEV 研究史 10-12 1.1.2 HEV 理化特性 12-13 1.1.3 HEV 分类 13 1.1.4 HEV 基因结构 13-16 1.1.5 HEV 基因型 16-18 1.1.6 HEV 遗传与变异 18-19 1.2 戊型肝炎流行病学 19-22 1.2.1 传染源 19-22 1.2.2 传播途径 22 1.2.3 易感人群 22 1.3 戊型肝炎流行状况及其影响因素 22-24 1.4 临床症状及病理变化 24-27 1.4.1 影响HEV 致病力的因素 24-25 1.4.2 戊型肝炎临床症状及病理变化 25-27 1.5 戊型肝炎免疫学反应 27-28 1.6 戊型肝炎人兽共患性质 28-32 1.6.1 HEV 在人和家猪间的传播 28-30 1.6.2 HEV 在人和野生动物间的传播 30-31 1.6.3 HEV 在人和猫间的传播 31 1.6.4 HEV 在人和其他动物间的传播 31-32 1.6.5 HEV 在人和动物跨种间实验性感染 32 1.7 戊型肝炎的诊断方法 32-39 1.7.1 HEV 抗原表位分析 33-35 1.7.2 戊型肝炎的诊断 35-39 1.8 HEV 的培养、复制和表达 39-40 1.8.1 细胞培养体系 39 1.8.2 HEV 体外拯救 39-40 1.8.3 复制与表达 40 1.9 HEV 的预防 40-42 第二篇 研究内容 42-100 第1章 基因Ⅳ型HEV real-time RT-PCR方法的建立 42-60 1.1 材料与方法 42-50 1.2 结果 50-56 1.3 讨论 56-58 1.4 小结 58-60 第2 章 HEV CH-S-1 株抗原表位基因的筛选及其克隆与鉴定 60-79 2.1 材料与方法 60-67 2.2 结果 67-75 2.3 讨论 75-78 2.4 小结 78-79 第3章 HEV抗原表位基因在毕赤酵母中的分泌表达及鉴定 79-100 3.1 材料与方法 79-88 3.2 结果 88-94 3.3 讨论 94-98 3.4 小结 98-100 结论 100-101 参考文献 101-118 攻读学位期间发表的学术论文 118-119 致谢 119-120 中文摘要 120-123 英文摘要 123-125
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中图分类: > 农业科学 > 畜牧、动物医学、狩猎、蚕、蜂 > 动物医学(兽医学) > 兽医基础科学 > 家畜微生物学(兽医病原微生物学) > 家畜病毒学
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