学位论文 > 优秀研究生学位论文题录展示

水稻培矮64S（PA64S）基因组BAC文库的构建与分析

作　者: 毛丹青
导　师: 罗美中
学　校: 华中农业大学
专　业: 生物化学与分子生物学
关键词: 水稻 PA64S 细菌人工染色体基因组文库
分类号: Q943.2
类　型: 硕士论文
年　份: 2010年
下　载: 97次
引　用: 0次
阅　读: 论文下载

内容摘要

基因组DNA文库是将某种生物的基因组全部DNA打断成随机片段,然后进行重组而形成的克隆群体。细菌人工染色体文库由于其能够克隆的大片段DNA、稳定性好及操作方便等优点而被广泛运用于物理图谱构建、基因的图位克隆、比较基因组学分析、同源基因克隆、基因表达和调控等方面的研究。培矮64S(PA64S)作为我国超级杂交稻两优培9(LYP9)的母本,对它的基因组的研究有助于对9311和PA64S这对亲本基因组的比较研究和其上优良基因的克隆,为LYP9的基因组研究提供帮助。本课题以水稻PA64S的幼嫩叶片作为材料,构建了该品种的BAC文库。文库一共有37632个克隆,检测平均插入片段达138kb,覆盖水稻全基因组12倍左右。空载率仅为1.5%,线粒体和叶绿体污染率分别为0.35%和1.85%。

全文目录

摘要  5-6
Abstract  6-7
缩略词表(Abbreviation)  7-8
1 前言  8-14
  1.1 课题的提出  8
  1.2 研究现状  8-13
    1.2.1 文库的发展  8-11
    1.2.2 BAC文库的应用  11-13
  1.3 水稻基因组研究  13-14
2 材料  14-24
  2.1 样品  14
  2.2 试剂与设备  14-15
    2.2.1 试剂  14
    2.2.2 主要仪器设备  14-15
  2.3 方法  15-24
    2.3.1 BAC载体的制备  15-17
    2.3.2 大片段基因组DNA的制备  17-20
    2.3.3 文库构建  20-21
    2.3.4 文库质量检测  21-24
3 结果与分析  24-35
  3.1 载体的制备  24-27
    3.1.1 载体酶切  24-25
    3.1.2 回收载体  25-27
    3.1.3 载体质量检测  27
  3.2 水稻PA64S高分子量DNA的制备  27-31
    3.2.1 水稻PA64S基因组DNA的预先部分酶切  27-29
    3.2.2 水稻PA64S基因组DNA的两次筛选与回收  29-31
  3.3 文库构建与质量检测  31-35
    3.3.1 BAC文库构建  31
    3.3.2 平均插入片段的检测  31-33
    3.3.3 细胞器DNA污染的检测  33
    3.3.4 阳性克隆的筛选  33-35
4 讨论  35-38
  4.1 文库构建中的两个关键问题  35-36
    4.1.1 载体的制备  35-36
    4.1.2 高分子量DNA的制备  36
  4.2 杂交中的问题  36
  4.3 文库的应用  36-38
参考文献  38-45
致谢  45

水稻培矮64S（PA64S）基因组BAC文库的构建与分析

内容摘要

全文目录

相似论文