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链霉菌FR-008与灰色链霉菌IMRU3570及其代谢产物的比较研究
作 者: 黄曦
导 师: 邓子新
学 校: 华中农业大学
专 业: 分子生物学
关键词: 七烯大环内酯 FR-008 结构分析 HPLC 氨基海藻糖 基因克隆
分类号: Q935
类 型: 博士论文
年 份: 1999年
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内容摘要
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很多迹象表明链霉菌FR-008与灰色链霉菌IMRU3570有着十分密切的关系,它们均能产生一种抗真菌的七烯大环内酯类抗生素。本文主要从化学和生物学两个角度分析和比较了这两个菌株的异同,并对抗生素的氨基海藻糖残基基因进行了克隆尝试。 首先从大量的发酵液中提取分离了链霉菌FR-008产生的抗生素FR-008,并通过大孔树脂吸附、柱层析等手段进行了初步提纯。HPLC分析研究表明,它与灰色链霉菌IMRU3570产生的杀假丝菌素是同一种物质,均含有相同的几种主要组分。利用HPLC进一步分离提纯,获得了FR-008的4个主要组分FR-008 a,b,c,d。对这4个组分进行生物活性测试分析后发现,它们对啤酒酵母的抑制活性无显著差异。在结构分析方面,通过核磁共振技术(500兆赫),1H-1H NMR,13C NMR,对FR-008 b组分进行了结构分析,结果表明它与杀假丝菌素D是同一种化合物;另外通过对FR-008 b和FR-008 a的1H NMR的比较,提出了FR-008 a的可能结构。 对链霉菌FR-008和灰色链霉菌IMRU3570的RFLP分析发现,它们的染色体具有很高同源性;PFGE的比较研究发现,这两个菌株的明显区别是链霉菌FR-008携带有两个线性质粒,而在灰色链霉菌IMRU3570中则没有这两个线性质粒。这两个菌株染色体的VspI酶切图谱无明显差异。因此可以推测,这两个菌株在表型上的差别有可能与链霉菌FR-008中的线性质粒有直接的关系,但也不能排除染色体基因之间的差异。 利用与糖基合成有关的基因str-DE作探针对这两个菌株的总DNA进行了Southern杂交,从两个菌株的总DNA中均检测到一段相同大小的阳性片断,约6.4kd(BamHI+BglII酶切)。用这个探针,对链霉菌FR-008的基因文库进行杂交筛选,获得了3个阳性克隆,经Southern杂交分析,发现它们均含有6.4kb共同的阳性片断。由于在杂交实验中使用的是异源探针,又未用克隆的片断进行基因中断或基因置换试验,因而目前尚不能确定所克隆的糖基基因与FR-008的氨基海藻糖残基的生物合成有关。
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全文目录
摘要 3-4 Abstract 4-7 缩写(Abbreviation) 7-11 第一章 分子生物学与现代分析技术(综述) 11-21 1-1 核磁共振 11-14 1-2 高效液相色谱 14-15 1-3 毛细管电泳 15-21 第二章 聚酮分子生物学进展(综述) 21-32 2-1 简介 21 2-2 携带PKS类型Ⅱ基因重组子的研究 21-26 1 适合在重组PKS中构件与表达的特殊寄主-载体系统 22-23 2 携带同源PKS基因的重组子 23-24 3 携带杂合PKS基因位点的重组子 24-26 2-3 模块结构的聚酮合酶 26-32 1 几个重要的聚酮化合物 27-28 2 程序化的模型和来自重组体的证据 28-32 第三章 链霉菌FR-008代谢产物的研究 32-63 3-1 链霉菌FR-008的分离与检测 33-44 1 紫外光谱与活性 33-38 1 ) 材料与方法 33-35 2 ) 结果与讨论 35-38 2 抗生素FR-008的提取分离 38-44 1 ) 材料与方法 39-40 2 ) 结果与讨论 40-44 3-2 抗生素FR-008的HPLC分析分离 44-52 1 材料与方法 45-46 2 结果与讨论 46-52 1 ) 离子强度对分离的影响 46-48 2 ) 流动相的选择 48-49 3 ) 抗生素FR-008与杀假丝菌素 49-50 4 ) 分离制备 50-51 5 ) 链霉菌FR-008及其衍生菌株代谢产物的研究 51-52 3-3 结构分析 52-63 1 简介 52-54 2 仪器与方法 54 3 结构分析 54-63 1 ) FR-008b的结构分析 54-59 2 ) FR-008a结构的比较分析 59-63 第四章 链霉菌FR-008与灰色链霉菌IMRU 3570的比较及糖基的克隆研究 63-82 1 材料与方法 64-70 2 结果分析 70-82 2.1 链霉菌FR-008和灰色链霉菌IMRU3570的比较研究 70-75 2.2 糖基的克隆研究 75-82 第五章 展望 82-88 1 链霉菌FR-008和灰色链霉菌IMRU3570的进一步比较 82 2 抗生素FR-008各主要组分的结构分析 82-83 3 新聚酮类抗生素的合成研究 83-88 1 ) FR-008聚酮合酶的模块结构 83-85 2 ) PKS重组工程中的表达系统 85 3 ) FR-008小PKSs的重组 85-88 后记 88 致谢 88
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中图分类: > 生物科学 > 微生物学 > 微生物生理学
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