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链霉菌FR-008与灰色链霉菌IMRU3570及其代谢产物的比较研究

作 者: 黄曦
导 师: 邓子新
学 校: 华中农业大学
专 业: 分子生物学
关键词: 七烯大环内酯 FR-008 结构分析 HPLC 氨基海藻糖 基因克隆
分类号: Q935
类 型: 博士论文
年 份: 1999年
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内容摘要


很多迹象表明链霉菌FR-008与灰色链霉菌IMRU3570有着十分密切的关系,它们均能产生一种抗真菌的七烯大环内酯类抗生素。本文主要从化学和生物学两个角度分析和比较了这两个菌株的异同,并对抗生素的氨基海藻糖残基基因进行了克隆尝试。 首先从大量的发酵液中提取分离了链霉菌FR-008产生的抗生素FR-008,并通过大孔树脂吸附、柱层析等手段进行了初步提纯。HPLC分析研究表明,它与灰色链霉菌IMRU3570产生的杀假丝菌素是同一种物质,均含有相同的几种主要组分。利用HPLC进一步分离提纯,获得了FR-008的4个主要组分FR-008 a,b,c,d。对这4个组分进行生物活性测试分析后发现,它们对啤酒酵母的抑制活性无显著差异。在结构分析方面,通过核磁共振技术(500兆赫),1H-1H NMR,13C NMR,对FR-008 b组分进行了结构分析,结果表明它与杀假丝菌素D是同一种化合物;另外通过对FR-008 b和FR-008 a的1H NMR的比较,提出了FR-008 a的可能结构。 对链霉菌FR-008和灰色链霉菌IMRU3570的RFLP分析发现,它们的染色体具有很高同源性;PFGE的比较研究发现,这两个菌株的明显区别是链霉菌FR-008携带有两个线性质粒,而在灰色链霉菌IMRU3570中则没有这两个线性质粒。这两个菌株染色体的VspI酶切图谱无明显差异。因此可以推测,这两个菌株在表型上的差别有可能与链霉菌FR-008中的线性质粒有直接的关系,但也不能排除染色体基因之间的差异。 利用与糖基合成有关的基因str-DE作探针对这两个菌株的总DNA进行了Southern杂交,从两个菌株的总DNA中均检测到一段相同大小的阳性片断,约6.4kd(BamHI+BglII酶切)。用这个探针,对链霉菌FR-008的基因文库进行杂交筛选,获得了3个阳性克隆,经Southern杂交分析,发现它们均含有6.4kb共同的阳性片断。由于在杂交实验中使用的是异源探针,又未用克隆的片断进行基因中断或基因置换试验,因而目前尚不能确定所克隆的糖基基因与FR-008的氨基海藻糖残基的生物合成有关。

全文目录


摘要  3-4
Abstract  4-7
缩写(Abbreviation)  7-11
第一章 分子生物学与现代分析技术(综述)  11-21
  1-1 核磁共振  11-14
  1-2 高效液相色谱  14-15
  1-3 毛细管电泳  15-21
第二章 聚酮分子生物学进展(综述)  21-32
  2-1 简介  21
  2-2 携带PKS类型Ⅱ基因重组子的研究  21-26
    1 适合在重组PKS中构件与表达的特殊寄主-载体系统  22-23
    2 携带同源PKS基因的重组子  23-24
    3 携带杂合PKS基因位点的重组子  24-26
  2-3 模块结构的聚酮合酶  26-32
    1 几个重要的聚酮化合物  27-28
    2 程序化的模型和来自重组体的证据  28-32
第三章 链霉菌FR-008代谢产物的研究  32-63
  3-1 链霉菌FR-008的分离与检测  33-44
    1 紫外光谱与活性  33-38
      1 ) 材料与方法  33-35
      2 ) 结果与讨论  35-38
    2 抗生素FR-008的提取分离  38-44
      1 ) 材料与方法  39-40
      2 ) 结果与讨论  40-44
  3-2 抗生素FR-008的HPLC分析分离  44-52
    1 材料与方法  45-46
    2 结果与讨论  46-52
      1 ) 离子强度对分离的影响  46-48
      2 ) 流动相的选择  48-49
      3 ) 抗生素FR-008与杀假丝菌素  49-50
      4 ) 分离制备  50-51
      5 ) 链霉菌FR-008及其衍生菌株代谢产物的研究  51-52
  3-3 结构分析  52-63
    1 简介  52-54
    2 仪器与方法  54
    3 结构分析  54-63
      1 ) FR-008b的结构分析  54-59
      2 ) FR-008a结构的比较分析  59-63
第四章 链霉菌FR-008与灰色链霉菌IMRU 3570的比较及糖基的克隆研究  63-82
  1 材料与方法  64-70
  2 结果分析  70-82
    2.1 链霉菌FR-008和灰色链霉菌IMRU3570的比较研究  70-75
    2.2 糖基的克隆研究  75-82
第五章 展望  82-88
  1 链霉菌FR-008和灰色链霉菌IMRU3570的进一步比较  82
  2 抗生素FR-008各主要组分的结构分析  82-83
  3 新聚酮类抗生素的合成研究  83-88
    1 ) FR-008聚酮合酶的模块结构  83-85
    2 ) PKS重组工程中的表达系统  85
    3 ) FR-008小PKSs的重组  85-88
后记  88
致谢  88

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中图分类: > 生物科学 > 微生物学 > 微生物生理学
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