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大白菜UGMS遗传图谱的构建及重要农艺性状的QTL分析

作 者: 葛宇
导 师: 朴钟云
学 校: 沈阳农业大学
专 业: 蔬菜学
关键词: 大白菜 单一基因微卫星(UGMS)和微卫星(SSR)标记 遗传图谱 叶球相关性状 叶绿素含量相关性状
分类号: S634.1
类 型: 博士论文
年 份: 2011年
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内容摘要


本研究以结球小、叶色深的大白菜双单倍体(DH)系‘501’为母本,结球大、叶色浅的大白菜自交系‘601’为父本杂交、自交所构建的F2群体及F2自交获得F3家系为试材,构建遗传图谱并对7个叶球相关性状和2个叶绿素相关性状进行QTL分析。主要试验结果如下。1.在所开发的450对单一基因微卫星(UGMS)引物中,有428(95.1%)对引物在至少一个亲本中扩增出与预测长度一致的产物,70对UGMS标记在两亲本中共产生72个多态性位点。遗传图谱包含70对UGMS标记(72个多态性位点)、154个微卫星(SSR)标记和一个表型标记,共有10个连锁群,总长度为933.9 cM,标记间平均距离为4.11 cM。大部分标记都符合F2群体的1:2:1孟德尔分离比例,只有31个标记(13.7%)在99%水平上偏离该比例。大部分偏分离标记集中在A7和A9连锁群。利用70对UGMS标记对其它5个芸薹种进行通用性分析。实验结果表明:可扩增频率从黑芥的82.9%到芥菜和甘蓝性油菜的97.1%,其中有53对UGMS标记在5个芸薹种中均能扩增出产物。2.本图谱中共有147个标记(48 UGMS和100 SSR标记位点)与拟南芥基因组有同源性。拟南芥5条染色体的同源片段分布于整个大白菜的10条染色体上。大白菜与拟南芥之间84个染色体同源区域(含两个以上标记)全长627.7 cM(67.2%)。平均每个同源区域长为6.7 cM。3.7个叶球相关性状在亲本‘601’和‘501’间表现出较为明显的差异。这7个叶球相关性状分别为毛重(GW)、外叶数(NNWL)、球重(HW)、球长(HL)、球宽(HWI)、球长宽比(HLHWR)和球叶数(NHFL)。F3家系表现出明显的分离。相关性分析表明大多数性状之间呈显著相关。利用WinQTLCart (ver.2.5)的复合区间作图法分析7个叶球相关性状,在10个连锁群上共检测到27个QTL位点。对于分布于10个连锁群上的27个QTL位点,有一些QTL位点位于某些连锁群的相同或相近区域。在A2、A4、A6和A8连锁群上出现多处控制2-3个叶球相关性状的QTL簇集区域。对27个QTL位点的加显性效应分析,其中7个QTL位点的效应以加性为主。4.叶绿素a和叶绿素b2个性状在亲本‘601’和‘501’间表现出较为明显的差异。F3家系表现出明显的分离。相关性分析表明大多数性状之间呈显著相关。同一年内叶绿素a与叶绿素b含量之间呈极显著正相关,而不同年份叶绿素a与叶绿素b之间不相关。对2种生长环境中的叶绿素a和叶绿素b性状进行了QTL位点分析,检测到控制叶绿素a和叶绿素b性状的QTL位点共10个,这些QTL位点分布在7个连锁群上(A1-A10)。所检测到的5个与叶绿素a有关的QTL位点分布在3个连锁群上。在不同年份检测到的控制叶绿素a含量的qClaA9a和qClaA9b位于相同区域。所检测到的5个与叶绿素b有关的QTL位点分布在5个连锁群上。

全文目录


摘要  10-12
ABSTRACT  12-14
前言  14-15
第一章 文献综述  15-38
  1.1 遗传标记  15-17
  1.2 遗传连锁图谱的构建  17-21
  1.3 白菜类作物遗传连锁图谱进展  21-22
  1.4 SSR标记在物种间的通用性分析  22-24
  1.5 白菜类作物基因定位研究进展  24-31
  1.6 叶球相关性状研究进展  31-34
  1.7 叶绿素含量研究进展  34-37
  1.8 本研究的目的与意义  37-38
第二章 大白菜遗传图谱的构建与分析  38-54
  2.1 材料与方法  38-41
    2.1.1 试验材料  38
    2.1.2 DNA提取  38-39
    2.1.3 UGMS和SSR分析  39-40
    2.1.4 大白菜与拟南芥同线性分析  40-41
  2.2 结果与分析  41-45
    2.2.1 亲本间分子标记的多态性  41
    2.2.2 遗传连锁图谱的构建  41-43
    2.2.3 大白菜与拟南芥的同线性分析  43-44
    2.2.4 UGMS标记对芸薹属6个种的通用性  44-45
  2.3 讨论  45-53
    2.3.1 SSR和UGMS标记多态性分析  45-46
    2.3.2 遗传图谱主要特征  46-51
    2.3.3 大白菜与拟南芥的同线性  51-52
    2.3.4 大白菜EST标记的通用性  52-53
  2.4 小结  53-54
第三章 大白菜叶球相关性状的QTL定位  54-66
  3.1 材料与方法  54-55
    3.1.1 试验材料  54
    3.1.2 田间试验  54-55
    3.1.3 数据分析及QTL定位  55
  3.2 结果与分析  55-62
    3.2.1 大白菜叶球相关性状表型值及其变异  55-57
    3.2.2 叶球相关性状的相关性  57-58
    3.2.3 叶球相关性状的QTL定位  58-62
  3.3 讨论  62-65
  3.4 小结  65-66
第四章 大白菜叶绿素含量的QTL定位  66-75
  4.1 材料与方法  66-67
    4.1.1 试验材料  66
    4.1.2 田间试验  66
    4.1.3 QTL定位及分析  66-67
  4.2 结果与分析  67-72
    4.2.1 大白菜叶绿素含量表型值及其变异  67-68
    4.2.2 叶绿素含量的相关性  68-69
    4.2.3 叶绿素含量的QTL定位  69-72
  4.3 讨论  72-74
  4.4 小结  74-75
结论  75-76
参考文献  76-92
附录  92-102
致谢  102-103
攻读博士学位期间发表及待发表文章  103

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中图分类: > 农业科学 > 园艺 > 蔬菜园艺 > 白菜类 > 大白菜
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