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大白菜UGMS遗传图谱的构建及重要农艺性状的QTL分析
作 者: 葛宇
导 师: 朴钟云
学 校: 沈阳农业大学
专 业: 蔬菜学
关键词: 大白菜 单一基因微卫星(UGMS)和微卫星(SSR)标记 遗传图谱 叶球相关性状 叶绿素含量相关性状
分类号: S634.1
类 型: 博士论文
年 份: 2011年
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内容摘要
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本研究以结球小、叶色深的大白菜双单倍体(DH)系‘501’为母本,结球大、叶色浅的大白菜自交系‘601’为父本杂交、自交所构建的F2群体及F2自交获得F3家系为试材,构建遗传图谱并对7个叶球相关性状和2个叶绿素相关性状进行QTL分析。主要试验结果如下。1.在所开发的450对单一基因微卫星(UGMS)引物中,有428(95.1%)对引物在至少一个亲本中扩增出与预测长度一致的产物,70对UGMS标记在两亲本中共产生72个多态性位点。遗传图谱包含70对UGMS标记(72个多态性位点)、154个微卫星(SSR)标记和一个表型标记,共有10个连锁群,总长度为933.9 cM,标记间平均距离为4.11 cM。大部分标记都符合F2群体的1:2:1孟德尔分离比例,只有31个标记(13.7%)在99%水平上偏离该比例。大部分偏分离标记集中在A7和A9连锁群。利用70对UGMS标记对其它5个芸薹种进行通用性分析。实验结果表明:可扩增频率从黑芥的82.9%到芥菜和甘蓝性油菜的97.1%,其中有53对UGMS标记在5个芸薹种中均能扩增出产物。2.本图谱中共有147个标记(48 UGMS和100 SSR标记位点)与拟南芥基因组有同源性。拟南芥5条染色体的同源片段分布于整个大白菜的10条染色体上。大白菜与拟南芥之间84个染色体同源区域(含两个以上标记)全长627.7 cM(67.2%)。平均每个同源区域长为6.7 cM。3.7个叶球相关性状在亲本‘601’和‘501’间表现出较为明显的差异。这7个叶球相关性状分别为毛重(GW)、外叶数(NNWL)、球重(HW)、球长(HL)、球宽(HWI)、球长宽比(HLHWR)和球叶数(NHFL)。F3家系表现出明显的分离。相关性分析表明大多数性状之间呈显著相关。利用WinQTLCart (ver.2.5)的复合区间作图法分析7个叶球相关性状,在10个连锁群上共检测到27个QTL位点。对于分布于10个连锁群上的27个QTL位点,有一些QTL位点位于某些连锁群的相同或相近区域。在A2、A4、A6和A8连锁群上出现多处控制2-3个叶球相关性状的QTL簇集区域。对27个QTL位点的加显性效应分析,其中7个QTL位点的效应以加性为主。4.叶绿素a和叶绿素b2个性状在亲本‘601’和‘501’间表现出较为明显的差异。F3家系表现出明显的分离。相关性分析表明大多数性状之间呈显著相关。同一年内叶绿素a与叶绿素b含量之间呈极显著正相关,而不同年份叶绿素a与叶绿素b之间不相关。对2种生长环境中的叶绿素a和叶绿素b性状进行了QTL位点分析,检测到控制叶绿素a和叶绿素b性状的QTL位点共10个,这些QTL位点分布在7个连锁群上(A1-A10)。所检测到的5个与叶绿素a有关的QTL位点分布在3个连锁群上。在不同年份检测到的控制叶绿素a含量的qClaA9a和qClaA9b位于相同区域。所检测到的5个与叶绿素b有关的QTL位点分布在5个连锁群上。
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全文目录
摘要 10-12 ABSTRACT 12-14 前言 14-15 第一章 文献综述 15-38 1.1 遗传标记 15-17 1.2 遗传连锁图谱的构建 17-21 1.3 白菜类作物遗传连锁图谱进展 21-22 1.4 SSR标记在物种间的通用性分析 22-24 1.5 白菜类作物基因定位研究进展 24-31 1.6 叶球相关性状研究进展 31-34 1.7 叶绿素含量研究进展 34-37 1.8 本研究的目的与意义 37-38 第二章 大白菜遗传图谱的构建与分析 38-54 2.1 材料与方法 38-41 2.1.1 试验材料 38 2.1.2 DNA提取 38-39 2.1.3 UGMS和SSR分析 39-40 2.1.4 大白菜与拟南芥同线性分析 40-41 2.2 结果与分析 41-45 2.2.1 亲本间分子标记的多态性 41 2.2.2 遗传连锁图谱的构建 41-43 2.2.3 大白菜与拟南芥的同线性分析 43-44 2.2.4 UGMS标记对芸薹属6个种的通用性 44-45 2.3 讨论 45-53 2.3.1 SSR和UGMS标记多态性分析 45-46 2.3.2 遗传图谱主要特征 46-51 2.3.3 大白菜与拟南芥的同线性 51-52 2.3.4 大白菜EST标记的通用性 52-53 2.4 小结 53-54 第三章 大白菜叶球相关性状的QTL定位 54-66 3.1 材料与方法 54-55 3.1.1 试验材料 54 3.1.2 田间试验 54-55 3.1.3 数据分析及QTL定位 55 3.2 结果与分析 55-62 3.2.1 大白菜叶球相关性状表型值及其变异 55-57 3.2.2 叶球相关性状的相关性 57-58 3.2.3 叶球相关性状的QTL定位 58-62 3.3 讨论 62-65 3.4 小结 65-66 第四章 大白菜叶绿素含量的QTL定位 66-75 4.1 材料与方法 66-67 4.1.1 试验材料 66 4.1.2 田间试验 66 4.1.3 QTL定位及分析 66-67 4.2 结果与分析 67-72 4.2.1 大白菜叶绿素含量表型值及其变异 67-68 4.2.2 叶绿素含量的相关性 68-69 4.2.3 叶绿素含量的QTL定位 69-72 4.3 讨论 72-74 4.4 小结 74-75 结论 75-76 参考文献 76-92 附录 92-102 致谢 102-103 攻读博士学位期间发表及待发表文章 103
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中图分类: > 农业科学 > 园艺 > 蔬菜园艺 > 白菜类 > 大白菜
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