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基于粒重差异品系的甘蓝型油菜遗传图谱的初步构建

作　者: 郑云峰
导　师: 黄进勇
学　校: 郑州大学
专　业: 生态学
关键词: 微卫星标记甘蓝型油菜遗传图谱粒重基因 F2群体
分类号: S565.4
类　型: 硕士论文
年　份: 2011年
下　载: 20次
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内容摘要

基因作图(gene mapping)是指确定某一染色体上特定基因的位置排布和基因之间的相对距离,根据基因定位数据,把每一条染色体上已发现的基因位点绘制成基因图。遗传图谱的建立需要有足够数量的多态性标记,而传统的遗传标记难以达到理想的效果,大大限制了遗传图谱的建立。本研究采用SSR标记作为遗传连锁图谱构建的分子标记,微卫星DNA标记在染色体上分布广泛,有丰富的多态性,并且分析成本比较低。本研究使用的材料由中国农业科学院油料作物生物学重点开放实验室提供,该材料经过连续的自交及性状选择,已经获得了粒重基因较纯的大粒品系和小粒品系。在该材料的基础上,作者使用两个粒重差异悬殊的株系进行杂交,并进行真杂交种的鉴定,再用鉴定出的真杂交种自交产生F2群体,该F2群体就是本研究的对象。首先找到亲本之间具有多态性的SSR标记,利用这些标记对F2群体进行标记基因型检测并分析数据。从已发表的甘蓝型油菜SSR引物中挑选出能够覆盖油菜整个基因组的551对,检测这些引物在亲本之间的多态性,共有107对引物检测出多态性,特异性比例为19.4%,共检测到144条特异性条带。从这107对SSR引物中挑选出扩增效果较好的48对,对容量为190个单株的F2群体进行标记基因型分析。用Joinmap3.0对获得的数据进行分析,其中25%的标记表现出显著偏分离,偏向小粒亲本的有5个,占41.7%,偏向大粒亲本的有7个,占58.3%。并得到了5个连锁群,整合了16个SSR标记,总覆盖长度295cM,标记间平均距离为26.8cM。得到的连锁图谱及建立的SSR分子标记体系为后续实验奠定了一定的基础。

全文目录

摘要  4-5
Abstract  5-7
目录  7-9
缩略词表  9-10
第一章文献综述  10-26
  1.1 遗传连锁图谱的构建  10-21
    1.1.1 遗传图谱定义、原理及步骤  10
    1.1.2 图谱构建的理论基础  10-11
    1.1.3 构建图谱常用的分子标记  11-16
    1.1.4 作图群体的建立  16-21
    1.1.5 图谱制作的数据分析方法与统计学原理  21
  1.2 芸薹属植物遗传图谱构建的研究进展  21-25
  1.3 本研究的目的意义  25-26
第二章材料与方法  26-31
  2.1 材料  26
    2.1.1 植物材料  26
    2.1.2 甘蓝型油菜微卫星引物  26
  2.2 实验方法  26-31
    2.2.1 DNA提取  26-27
    2.2.2 DNA浓度及质量检测  27
    2.2.3 SSR扩增  27-28
    2.2.4 电泳  28-30
    2.2.5 银染  30
    2.2.6 数据处理  30-31
第三章结果分析  31-40
  3.1 杂交种的纯度鉴定  31-32
  3.2 DNA浓度及质量检测  32-33
  3.3 亲本间多态性标记的筛选  33-35
  3.4 SSR标记在F2群体中的扩增  35-37
  3.5 F2群体遗传连锁图谱的构建  37-40
第四章结论与讨论  40-43
  4.1 分子遗传图谱的构建  40
  4.2 SSR分子标记作图效率评价  40-41
  4.3 研究中出现的偏分离现象  41-43
参考文献  43-48
致谢  48

基于粒重差异品系的甘蓝型油菜遗传图谱的初步构建

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