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十株海洋亚历山大藻ITS区序列测定和对比分析

作　者: 张炎
导　师: 周名江；邹景忠
学　校: 中国科学院研究生院（海洋研究所）
专　业: 海洋环境生物学
关键词: 亚历山大藻 内转录间隔区 PCR 扩增
分类号: Q953
类　型: 硕士论文
年　份: 2005年
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内容摘要


本文使用分子生物学实验方法,对来自中国东海海域、南海大鹏湾、香港海域、台湾省海域等地的 10 株海洋亚历山大藻(Alexamdrium)进行特异性 PCR扩增,获得由核基因编码的核糖体基因内转录间隔区(Internal Transcribed Spacer, ITS)DNA 片段,经测序得到 10 个序列的信息。利用分子生物学软件,对这些序列及选自 GenBank 的 11 个代表性亚历山大藻株 ITS 序列进行比对分析,计算了序列间的距离值,绘制了分子系统树,对序列进行了相似性研究,并且推论出株藻间亲缘关系的远近;同时发现原先鉴定为 A.minutum AM 的藻株可能是一株A.tamarense。实验中,8 株藻采用了传统的 DNA 提取方法获得 PCR 扩增模板,2 株藻尝试藻液 10 分钟预处理后直接扩增的办法,成功建立了一种经济、快捷获得目标 PCR 产物的新方法。

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中图分类: > 生物科学 > 动物学 > 动物遗传学
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