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甲型H1N1流感病毒Real-Time RT-PCR检测内参照品的研究
作 者: 张永辉
导 师: 周红宁;王岳
学 校: 大理学院
专 业: 病原生物学
关键词: 流感病毒 Real-Time RT-PCR 内参照品 假病毒颗粒 H1N1
分类号: R440
类 型: 硕士论文
年 份: 2010年
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内容摘要
目的:制备甲型HIN1流感病毒Real-Time RT-PCR检测的内参照品。方法:首先合成得到甲型H1N1流感病毒膜蛋白HA和NA的基因,并将其重组到质粒pCMV中得到pCMV-HA和pCMV-NA;在甲型H1N1流感病毒的M基因、HA基因、NA基因、NP基因分别设计一套引物和探针,并以其为模板设计合成一段内参基因IC,将IC插入报告质粒EGFP中得到质粒EGFP-IC;将膜蛋白质粒、报告质粒和包装质粒共同转染293T细胞得到带有IC的假病毒颗粒。结果:通过Real-Time RT-PCR使用四套引物和探针对H1N1 (A/CA/07/2009)检测,四套引物和探针对同一浓度病毒检测M基因引物组CT12.32;HA基因引物组CT12.67;NA基因引物组CT12.73;NP基因引物组CT12.94。假病毒颗粒感染A549细胞可以看到被感染的细胞表达绿色荧光蛋白,并通过电子显微镜观察到病毒颗粒的形态。使用HA-Primer和IC-Probe检测HlNlpp RNA,原液CT11.3±0.15;1:10稀释CT.15.61±0.17;1:100稀释CT19.16±0.02;1:1000稀释CT24.4±0.19。结论:成功制备出2009H1N1病毒株Real-Time RT-PCR检测的内参照品,并通过Real-Time RT-PCR验证其可行。
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全文目录
中文摘要 5-6 Abstract 6-8 1. 前言 8-11 2. 材料和方法 11-21 2.1 病毒和细胞 11 2.2 菌株和质粒 11 2.3 细胞培养 11 2.4 工具酶和试剂 11 2.5 耗材和仪器 11-12 2.6 流感病毒H1N1膜蛋白表达型载体的构建 12-15 2.7 流感病毒H1N12009株的检测探针和引物的设计 15-17 2.8 内参照品检测靶标基因的构建 17-19 2.9 细胞培养和假病毒颗粒的制作 19-20 2.10 H1N1pp感染试验 20 2.11 H1N1pp Real-Time RT-PCR检测 20-21 3 结果 21-25 3.1 流感病毒H1N1膜蛋白表达型质粒的构建 21-22 3.2 流感病毒H1N12009株的检测探针和引物验证 22-23 3.3 重组EGFP-CI质粒构建 23-24 3.4 假病毒感染实验和透射电子显微镜图 24 3.5 内对照品(H1N1pp)Real Time RT-PCR结果 24-25 4 讨论 25-29 5 结论 29-30 参考文献 30-37 附录 37-43 附录1 pCMV表达载体图谱 37-38 附录2 EGFP报告载体图谱 38-39 附录3 HA测序结果 39-40 附录4 NA测序结果 40-41 附录5 IC测序结果 41-42 附录6 发表论文 42-43 文献综述 43-51 参考文献 46-51 致谢 51-52
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中图分类: > 医药、卫生 > 临床医学 > 诊断学
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