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86个水稻品种的SSR多态性和聚类分析

作　者: 彭生炳
导　师: 贺晓鹏
学　校: 江西农业大学
专　业: 作物遗传育种
关键词: 水稻品种资源传多样性聚类分析
分类号: S511
类　型: 硕士论文
年　份: 2011年
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内容摘要

水稻是我国最重要的粮食作物,明确水稻品种资源的遗传多样性对于这些资源的利用具有重要价值。本研究利用SSR分子标记技术,对86个水稻品种的遗传多样性进行了分析,主要研究结果如下：1.40对引物在86个水稻品种中共检测出114个等位变异,每对引物检出的平均等位变异数为2.85个,等位变异范围为2-6个。不同SSR引物扩增的多态性信息量PIC变化在0.435-0.793之间。根据群体内种质间的Nei和Li相似系数,对86份材料进行了聚类分析,结果表明：整个聚类图可以在相似系数0.53处划分为六组。第一组包括4份材料,第二组包括35份材料,第三组包括5份材料,第四组包括8份材料,第五组包括33份材料,第六组仅有1份材料。2.统计前五组的等位变异数,第一组等位变异总数为60个,平均等位变异数为1.5个,第二组等位变异总数为70个,平均等位变异数为1.75个,第三组等位变异数总数为60个,平均等位变异数为1.55个,第四组等位变异总数为67个,平均等位变异总数为1.675个,第五组等位变异总数为85个,平均等位变异数为2.125个。

全文目录

摘要  3-4
Abstract  4-6
1 文献综述  6-14
  1.1 遗传标记的类型  6-9
    1.1.1 形态标记  6
    1.1.2 细胞学标记  6-7
    1.1.3 蛋白质标记  7
    1.1.4 分子标记  7-9
  1.2 水稻遗传多样性的研究  9-12
    1.2.1 我国水稻遗传资源及其利用  10-11
    1.2.2 水稻遗传多样性研究进展  11-12
  1.3 SSR标记在水稻遗传育种中的应用  12-14
2 材料和方法  14-19
  2.1 试验材料  14
  2.2 DNA提取  14-16
  2.3 SSR多态性检测  16-18
  2.4 数据分析  18-19
3 结果与分析  19-26
  3.1 86个水稻品种的SSR多态性  19-20
  3.2 不同SSR引物扩增的多态性信息量PIC  20-21
  3.3 86份水稻材料基于SSR多态性的聚类分析  21-23
  3.4 各聚类组材料的SSR多态性  23-26
    3.4.1 第一聚类组  23
    3.4.2 第二聚类组  23-24
    3.4.3 第三聚类组  24
    3.4.4 第四聚类组  24-25
    3.4.5 第五聚类组  25-26
4 小结与讨论  26-27
  4.1 86个水稻品种的SSR多态性和聚类分析  26
  4.2 SSR数据分析遗传多样性的代表性  26-27
参考文献  27-30
致谢  30

86个水稻品种的SSR多态性和聚类分析

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