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尼罗罗非鱼翻译延伸因子eEF1A家族的分子克隆和表达研究

作　者: 魏莹莹
导　师: 王德寿
学　校: 西南大学
专　业: 水生生物学
关键词: 尼罗罗非鱼 eEF1A家族系统进化分析性别二态性重组蛋白和抗体制备启动子分析
分类号: S917.4
类　型: 硕士论文
年　份: 2011年
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内容摘要

翻译延伸因子1A(eukaryotic translation elongation factor 1 A, eEFIA)是广泛存在于所有生物许多类型细胞的一类含量丰富且高度保守的蛋白质家族。它属于G蛋白家族,在肽链延伸过程中作为翻译延伸复合物的一部分,促使GTP依赖的氨酰tRNA转移至核糖体。42Sp50是eEFIA家族的特殊成员,目前仅在鱼类和两栖类卵黄发生前期卵母细胞中发现。大量研究表明eEFIA家族通常含有多个成员；在不同物种的不同发育过程中,eEFIA存在许多组织和时期特异表达的亚型,如鸟类、哺乳类等有两个eEFIA:eEFIA1禾(?)eEF1A2,两栖类则有三个：eEF1A1、eEF1A2和42Sp50,但关于真骨鱼类有几个eEF1A家族成员、eEF1A家族的系统进化分析及其在性腺中的表达、作用等鲜有报道。为解决上述问题,本研究从尼罗罗非鱼中克隆了42Sp50基因,从3月龄罗非鱼雌、雄性腺转录组序列中分离得到另外三个不同基因编码的eEF1As,分析了eEFIA家族的系统进化,并通过RT-PCR、Realtime-PCR和原位杂交等方法重点研究了42Sp50和eEF1Ab的表达模式,其结果如下：42Sp50 cDNA全长为1718bp,其开放性阅读框(ORF)长1371bp,编码456个氨基酸；三个eEF1As的ORF长均为1389bp,编码462个氨基酸。通过比对从GenBank下载到的各代表物种的eEF1As序列,我们构建了系统进化树,发现斑马鱼中有五个eEF1As (eEF1A1、eEFA2、eEF1A3、eEF1A4和42Sp50),罗非鱼中也有五个eEF1As (eEFlAla、eEF1Alb、eEF1A3、eEF1A4和42Sp50),而其他真骨鱼类中只找到四个eEF1As (eEF1A1、eEFA3、eEF1A4和42Sp50)。进化树表明来自不同脊椎动物的eEF1As序列聚为明显的两枝：42Sp50和其他eEF1As,其他eEF1As又分别聚为四类：eEF1A1、eEF1A2、eEF1A3禾PeEF1A4。其中,eEF1A1禾PeEF1A2存在于脊椎动物中,而eEF1A3和eEF1A4只在真骨鱼类中发现。42Sp50目前仅在两栖类和真骨鱼类中找到,它与其他eEF1As分开,单独聚为一枝且位于系统进化树的基部。这表明42Sp50可能在进化早期即已与其他eEF1As分离,摒弃了导致eEF1A和42Sp50分离的基因复制发生时间相对较近,随后编码42Sp50的基因快速进化的观点。通过RT-PCR发现eEF1A1b在卵巢和精巢中均有表达,且在精巢中的表达明显高于卵巢,42Sp50则特异地表达于卵巢中。同时,我们发现42Sp50在雌激素诱导的雄鱼卵巢中高表达,而在芳香化酶抑制剂处理后的雌鱼精巢中完全被抑制。eEF1A1b则在雌鱼精巢中表达高于雄鱼卵巢。表明42Sp50和eEF1A1b的表达与基因型无关,只与表型(雌性卵巢或雄性精巢)相关。进而,通过Real-time PCR研究了42Sp50和eEF1A1b基因在罗非鱼个体发生过程中雌、雄性腺的表达模式,结果表明42Sp50从孵化后10天开始在卵巢表达,随发育进程逐渐升高,至孵化后60天表达量达到最高,此后逐渐降低。相反,在雄性性腺发育过程中其表达始终保持在本底水平。罗非鱼雌、雄性腺中,孵化后10天至70天,eEF1A1b仅有微量表达。从孵化后90天开始,eEF1Alb在精巢中的表达剧增,并于孵化后120天达到最高,随后逐渐降低,在孵化后240天又一次增高,但这期间它在卵巢中始终保持较低水平的表达。用原位杂交的方法检测了42Sp50, eEF1A1b以及eEF1A4在罗非鱼性腺表达的细胞类型,结果显示在卵黄发生前期卵母细胞细胞质中,42Sp50均一地表达,而eEF1A4则呈单一小球状集中表达,eEF1A1b没有表达。eEF1A1b和eEF1A4在精巢的初级和次级精母细胞中表达,且eEF1A4的表达量明显高于eEF1A1b, eEF1A1b在次级精母细胞中的表达量高于初级精母细胞,42Sp50则没有表达。本研究进一步采用荧光素酶报告基因研究了HEK293和CHO细胞中雌激素受体(ERα、ERβ1和ERβ2)对42Sp50启动子的影响。结果发现,两种细胞系中,三种雌激素受体都抑制了42Sp50的启动子活性。此外,本研究用pCold I载体在大肠杆菌中表达、纯化了N端带有His标签的42Sp50重组蛋白,并免疫小鼠制备了多克隆抗体,Western blot检测证实抗体工作良好。综上所述,本研究发现罗非鱼中共有五个eEFIA家族基因：42Sp50、eEF1A1a、eEF1A1b、eEF1A3和(eEF1A4已报道)；对eEF1A家族的系统进化分析表明eEF1A1b是eEF1A基因家族的一个新成员；42Sp50和eEF1A1b在性腺中的表达存在明显的性别二态性,42Sp50在卵黄发生前期卵母细胞中特异表达,而eEF1A1b主要在初级和次级精母细胞中表达；荧光素酶分析发现三种雌激素受体对罗非鱼42Sp50启动子活性都有抑制作用。本研究为初次发现雌雄性腺可能分别通过不同的蛋白质翻译延伸因子进行性别特异的蛋白质合成。

全文目录

摘要  7-9
Abstract  9-12
第1章文献综述  12-24
  1 eEF1A家族的成员  13-14
  2 eEF1A家族的结构  14-15
  3 eEF1A家族的表达  15-16
  4 eEF1A家族的功能  16-20
    4.1 eEF1A的功能  16-18
    4.2 42Sp50的功能  18-20
  5 eEF1A与42Sp50的区别  20-21
  6 本研究的立项依据和目的意义  21-24
第2章罗非鱼eEF1A家族的克隆和系统进化分析  24-42
  1 引言  24-25
  2 材料和方法  25-35
    2.1 实验动物  25
    2.2 试剂、耗材和仪器  25
    2.3 有关试剂的配置  25-26
    2.4 实验方法  26-35
  3 结果与分析  35-36
    3.1 罗非鱼eEF1As的序列分析  35-36
    3.2 罗非鱼eEF1A家族的系统进化分析  36
  4 讨论  36-42
第3章罗非鱼42Sp50、eEF1A1b和eEF1A4的表达研究  42-62
  1 引言  42-43
  2 材料和方法  43-53
    2.1 实验动物  43
    2.2 试剂、耗材和仪器  43
    2.3 有关试剂的配置  43-46
    2.4 实验方法  46-53
  3 结果与分析  53-60
    3.1 罗非鱼eEF1As的组织表达模式分析  53-54
    3.2 药物处理诱导性逆转对eEF1As表达的影响  54-56
    3.3 罗非鱼个体发生过程中性腺42Sp50和eEF1A1b mRNA的表达  56-57
    3.4 eEF1As表达于不同类型的性腺细胞  57
    3.5 罗非鱼42Sp50的启动子克隆及调控分析  57-59
    3.6 42Sp50重组蛋白的原核表达、纯化及Western blot检测  59-60
  4 讨论  60-62
结论  62-64
参考文献  64-74
致谢  74-76
在读期间所发表的文章  76
在读期间参加科研情况  76

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