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稻瘟病菌亚甲基四氢叶酸还原酶基因(MoMET13)功能的初步研究
作 者: 王红
导 师: 王政逸
学 校: 浙江大学
专 业: 植物病理学
关键词: 稻瘟病菌 T-DNA插入突变 致病缺陷突变体 MoMET13 MoMET12 基因敲除 基因互补 甲硫氨酸
分类号: S435.111
类 型: 硕士论文
年 份: 2011年
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内容摘要
本文利用农杆菌介导的ATMT转化技术成功获得一个稻瘟病菌(Magnaporthe oryzae)致病缺陷突变体Wh-672,并鉴定了T-DNA标记的基因MoMET13,进而通过敲除和互补验证对MoMET13的生物学功能做了初步分析。利用农杆菌介导转化法(ATMT)筛选出一个对大麦和水稻都完全失去致病性的稻瘟病菌突变体Wh-672。Wh-672在CM培养基上菌落生长速率明显减慢,菌落白色,无气生菌丝,不产生分生孢子。采用hiTAIL-PCR的方法扩增了T-DNA右边界的610bp基因组DNA序列,并克隆到pGEM-Teasy载体上。测序和BLAST分析结果显示,T-DNA标记基因编号为MGG01728.6,该基因位于第1染色体的Supercontig 27内,由1948个碱基组成,编码627个氨基酸,内有2个外显子和1个内含子,T-DNA插入位点在MoMET13基因起始密码上游815bp处。MGG 01728与Sc MET13和Sp MET9的同源性分别为46.9%,48.03%,这些序列属于亚甲基四氢叶酸还原酶(Methylenetetrahydrofolate reductase,MTHFR)超家族成员。通过构建MoMET13基因敲除载体和稻瘟病菌原生质体转化得到96个转化子,并通过PCR和Southern杂交筛选出4个MoMET13基因敲除转化子。突变体表型分析结果表明,△Momet13突变体不能在缺甲硫氨酸的基本培养基上生长,对寄主的致病性丧失,其它表型也与Wh-672突变体完全一致。为了进一步验证突变体Wh-672的表型改变是由T-DNA插入引起的,构建了融合MoMETl3和绿色荧光蛋白基因GFP的互补载体,分别对Wh-672和△Momet13突变体进行了互补转化,获得58个互补转化子。选取转化子672-hb3进行表型互补分析,结果显示突变体的所有表型均得到恢复。通过激光扫描共聚焦显微镜在672-hb3的菌丝、孢子和附着胞内几乎都观察不到GFP绿色荧光,说明MoMET13基因在营养生长、产孢和附着胞形成过程中低水平表达。生物信息学分析表明,在稻瘟病菌中除MoMET13外,MoMET12也可编码亚甲基四氢叶酸还原酶,它们分别与酿酒酵母(S. cerevisiae)的MET13和MET12同源。为进一步了解稻瘟病菌MoMET12基因的功能,通过构建MoMET12基因敲除载体和原生质体转化得到269个转化子,用PCR的方法筛选出4个敲除转化子,△Momet12突变体与△Momet13突变体类似也不能在缺甲硫氨酸的基本培养基上正常生长,但△Momet12突变体的其它表型(如产孢、致病性等)与野生菌株Guy11基本一致。综合上述,亚甲基四氢叶酸还原酶基因(MoMET3)在稻瘟病菌致病过程中起关键作用。
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全文目录
致谢 8-9 目录 9-12 摘要 12-14 Abstract 14-16 第一章 文献综述 16-30 1. 稻瘟病概述 16-18 1.1 稻瘟病及病原菌 16 1.2 稻瘟病的发病规律 16-17 1.3 稻瘟病菌的侵染过程 17-18 2. 稻瘟菌致病相关基因的研究进展 18-23 2.1 产孢相关基因 18-19 2.2 附着孢发育相关基因 19-23 2.2.1 界面硬度和疏水性影响附着胞的分化 19 2.2.2 分生孢子分泌疏水蛋白识别胞外信号 19-20 2.2.3 细胞质膜跨膜蛋白和胞外信号传递 20-21 2.2.4 附着胞黑色素层的沉积与膨压的形成 21-22 2.2.5 分生孢子特异性内含物与膨压的形成 22-23 3. 农杆菌介导的稻瘟病菌T-DNA转化和插入突变研究 23-25 3.1 丝状真菌遗传转化的研究进展 23-24 3.2 农杆菌介导的T-DNA转化研究 24-25 3.3 T-DNA插入突变的优势分析 25 4. 扩增侧翼序列技术TAIL-PCR(THERMAL ASMMETRIC INTERLACED PCR) 25-26 5. MTHFR的研究进展 26-28 5.1 叶酸与methionine循环 26-27 5.2 一碳单位代谢中MTHFR调节作用 27-28 6. 本研究的目的意义和技术路线 28-30 第二章 材料与方法 30-45 1. 材料 30-34 1.1 实验菌株、质粒载体及水稻、大麦致病性测定品种 30-31 1.1.1 实验菌株 30 1.1.2 质粒载体 30-31 1.1.3 水稻、大麦致病性测定品种 31 1.2 各类抗生素、培养基及工具酶 31-34 1.2.1 各类抗生素 31-32 1.2.2 培养基 32-34 1.2.3 工具酶 34 1.3 各类生化试剂、溶液及试剂盒 34 2 稻瘟病菌生物学性状测定试验 34-37 2.1 菌落生长速度及菌落特性 35 2.2 稻瘟病菌产孢培养和产孢量 35 2.3 附着胞形成实验 35-36 2.4 稻瘟菌有性生殖实验 36 2.5 大麦和水稻离体接种 36 2.6 稻瘟病菌菌丝、分生孢子和附着孢的GFP观察 36-37 3 PCR扩增 37-38 3.1 常规PCR反应体系 37 3.2 细菌菌落PCR反应体系 37 3.3 高效TAIL-PCR(hiTAIL-PCR)反应体系及反应程序 37-38 4. 质粒DNA、基因组DNA及小片段DNA相关操作 38-41 4.1 质粒DNA提取(CTAB法) 38-39 4.2 基因组DNA抽提 39-40 4.3 DNA酶切 40 4.4 胶回收(Axyprep DNA gel extraction kit回收法) 40 4.5 酶切DNA片段的去磷酸化 40-41 4.6 连接反应 41 5. 细菌和真菌转化 41-45 5.1 农杆菌介导的T-DNA转化 41-42 5.2 大肠杆菌感受态细胞制备及细菌转化 42-43 5.3 稻瘟菌原生质体制备与转化 43-44 5.4 酵母转化 44-45 第三章 结果与分析 45-67 1. 致病缺陷突变体Wh-672的获得 45-47 1.1 农杆菌介导的稻瘟菌T-DNA转化 45 1.2 转化子致病性筛选和突变体Wh-672的获得 45-46 1.3 突变体Wh-672遗传稳定性检测 46-47 2. MoMET13基因的分离与同源性分析 47-52 2.1 MoMET13基因的分离 47-48 2.2 MoMET13基因的克隆、测序 48 2.3 MoMET13基因的获得与序列分析 48-51 2.4 MoMET13的同源基因 51-52 3 MoMET13基因缺失突变 52-55 3.1 MoMET13基因缺失载体构建 52-53 3.2 MoMET13基因缺失突变体的获得及验证 53-55 4 MoMET12基因缺失突变体 55-57 4.1 MoMET12基因缺失载体构建 55-56 4.2 MoMET12基因缺失突变体的获得及验证 56-57 5. 突变体Wh-672性状恢复实验 57-58 5.1 互补载体的构建 57-58 5.2 互补转化 58 6. 酵母互补 58-59 6.1 酵母互补载体的构建 58-59 6.2 酵母互补转化 59 7 突变体生物学性状研究 59-67 7.1 菌落形态和生长速度分析 59-60 7.2 突变体在MM培养基生长状况 60-62 7.3 分生孢子和附着孢形成观察 62-64 7.4 有性生殖实验 64-65 7.5 致病性分析 65-66 7.6 荧光实时定量PCR 66-67 第四章 全文总结讨论及后续研究 67-70 1. 全文总结讨论 67-68 2. 存在的问题和今后的研究 68-70 参考文献 70-74 附表 74
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中图分类: > 农业科学 > 植物保护 > 病虫害及其防治 > 农作物病虫害及其防治 > 禾谷类作物病虫害 > 稻病虫害 > 病害
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