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MTHFR、IL-10、ALDH2基因多态性与HBV感染后疾病转归的研究

作　者: 刘娟娟
导　师: 高英堂
学　校: 天津医科大学
专　业: 生物化学与分子生物学
关键词: MTHFR IL-10 ALDH2 单核苷酸多态性 HBV 疾病转归
分类号: R512.62
类　型: 硕士论文
年　份: 2010年
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内容摘要

人体感染HBV后病程如何演化是宿主和病毒等多种因素共同作用的结果,宿主基因的多态性可能会影响HBV感染后的疾病进程。基因多态性有较强的地域和民族特征,而且其与肝病之间的关系在不同地区和民族之间的研究结果不尽相同。因此,分析MTHFR、IL-10、ALDH2基因多态性对天津地区汉族人感染HBV后疾病进展的影响,有助于对本地区肝病发生的病因学进行深入研究。研究目的：探讨MTHFR、IL-10、ALDH2基因多态性与HBV感染后疾病转归的关系。研究方法：收集标本995例,包括205例健康对照、161例自愈者、221例慢乙肝患者、172例乙肝肝硬化患者以及236例HBV相关性肝癌患者。从凝血块中提取基因组DNA,采用TaqMan SNP基因分型和基因测序的方法检测MTHFR 677 C/T、IL-10-1082 A/G、-819 T/C和ALDH2 rs4646778 C/A、rs671 G/A等5个位点的多态性,以χ2检验分析以上位点的基因型、等位基因以及IL-10-1082/-819、ALDH2 rs4646778/rs671单倍型在各组中的分布及差异。研究结果：1. MTHFR基因：用于本基因研究的805例研究对象677 CT、TT和CC基因型频率分别为47.09%、30.43%和22.48%；等位基因频率：C为46.02%,T为53.98%,显示天津地区汉族人TT基因型和T等位基因频率明显高于以往其它地区或种族的报道。等位基因和基因型分布在各组无统计学差异(P>0.05)。分析不同性别在各组中的分布特征表明,TT基因型在男性各患病组中显示风险度降低,特别在肝硬化组TT和CT的OR值最低；而在女性的自愈、慢乙肝和肝硬化组,TT和CT显示风险度增加,特别在肝硬化组OR值最高,具有统计学差异(P=0.022)。然而,TT和CT在女性肝癌组却显示风险度降低。对不同临床特征包括肝癌和肝硬化组的Child-Pugh肝功能分级、AFP水平以及所有患者HBsAg表达、DNA拷贝数之间的比较未发现统计学差异(P>0.05)。2.IL-10基因：用于本基因研究的700例研究对象-1082位点的基因型分布为AA占82.29%、AG占16.00%、GG占1.71%；等位基因频率：A为90.29%,G为9.71%。-819位点的基因型分布为TT占41.43%、TC占48.14%、CC占10.43%；等位基因频率：T为65.64%,C为34.36%。两位点等位基因和基因型分布在各组之间比较均无统计学差异(P>0.05),以自愈组为对照,-1082 AG基因型和G等位基因对慢乙肝和肝硬化组的风险度降低,-819 TC对肝癌组风险度降低,CC基因型和C等位基因对三个肝病组的风险度均有降低的趋势。分析IL-10-1082／-819单倍型在各组中的分布,以健康和自愈组为对照,AC单倍型对肝硬化和肝癌组的风险度均降低,且以自愈组为对照时降低程度更大；以自愈组为对照,GC单倍型对慢乙肝和肝硬化组的风险度降低。在不同临床特征的组别之间比较发现,对于-819位点,DNA<103拷贝／mL的患者C等位基因频率显著高于DNA≥103拷贝／mL的患者(P=0.025)。对其它各项的比较未发现统计学差异(P<0.05)。3. ALDH2基因：用于本基因研究的180例研究对象rs4646778位点CC、CA和AA基因型频率分别为51.11%、37.78%和11.11%；等位基因频率：C为70.00%,A为30.00%。rs671位点GG、GA和AA的基因型频率分别为72.22%、24.45%和3.33%；等位基因频率：G为84.44%,A为15.56%。两位点等位基因和基因型分布在各组无统计学差异(P>0.05),以健康组为对照,rs4646778 CA基因型对三个肝病组的风险度均降低,C等位基因对肝癌组的风险度降低。分析rs4646778/rs671单倍型在各组中的分布,以健康组为对照,AG和CA单倍型对三个肝病组的风险度均有降低的趋势。在不同临床特征的组别之间比较未发现统计学差异(P>0.05)。研究结论：1. MTHFR 677在中国天津汉族人中的TT基因型频率明显高于大多数国家和地区的研究结果。同时提示MTHFR 677 TT和CT基因型降低男性HBV感染者患肝硬化的风险和女性HBV感染者患肝癌的风险,而增加女性HBV感染者患肝硬化的风险。2.IL-10-1082AG基因型和G等位基因,-819 TC、CC基因型和C等位基因,-1082/-819AC、GC单倍型对HBV感染后疾病进展有一定的保护作用；-819 C等位基因更有利于HBV感染者病毒的清除。3. ALDH2 rs4646778 CA基因型、C等位基因以及rs4646778/rs671 AG和CA单倍型对HBV感染后疾病进展可能有一定的保护作用。

全文目录

中文摘要  4-6
Abstract  6-10
缩略语  10-11
前言  11-14
  研究现状、成果  11-13
  研究目的、方法  13-14
对象和方法  14-23
  1.1 实验对象  14-17
  1.2 实验方法  17-23
结果  23-50
  2.1 MTHFR、IL-10、ALDH2基因SNP信息的搜索  23
  2.2 自愈组标本的筛选  23-24
  2.3 基因组DNA的提取  24
  2.4 基因型的检测  24-50
讨论  50-57
结论  57-58
参考文献  58-65
发表论文和参加科研情况说明  65-66
综述  66-74
  IL-10基因多态性与肝病的研究进展  66-70
  综述参考文献  70-74
致谢  74-75

MTHFR、IL-10、ALDH2基因多态性与HBV感染后疾病转归的研究

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