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白菜BIL群体和DH群体的遗传图谱构建及其比较

作　者: 汪骞
导　师: 林良斌；王晓武
学　校: 云南农业大学
专　业: 作物遗传育种
关键词: 白菜遗传图谱 SSR标记 SRAP标记 DH群体 BIL群体
分类号: S634.1
类　型: 硕士论文
年　份: 2009年
下　载: 46次
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内容摘要

白菜是十字花科芸苔属中最重要的蔬菜作物之一。我国大白菜和小白菜的年播种面积和产量约占全国蔬菜的20%,在蔬菜生产中具有举足轻重的地位。本研究是利用相同亲本构建的BIL群体和DH群体为材料,分别构建了DH群体遗传连锁图谱和BIL群体遗传连锁图谱,并进行了图谱比较研究,为今后利用遗传连锁图谱进行大白菜各种性状的QTL定位、图位克隆基因和分子标记辅助育种奠定基础。主要研究结果如下:(1)以大白菜品种Z16×白菜型油菜品种L144的F1DH群体为材料,构建了包含105个SSR标记和140个SRAP标记的10个连锁群遗传图谱,总长度714cM,平均图距为2.9cM。每个连锁群上的标记数在13-50个之间,连锁群长度为45.8-100.9cM。并进行了标记的偏分离分析,168个标记发生偏分离,占68.57%,其中偏向Z16的占58.77%,偏向于L144的占9.80%。(2)根据连锁图谱中已知的SSR标记,可初步确定8C系列SSR标记在连锁群中的位置。在已公布的BRMS系列引物中,BRMS016、BRMS030、BRMS046没有定位在相应的连锁群,本研究把BRMS016、BRMS030定位A09连锁群上、BRMS046定位在A02连锁群上。(3)以大白菜品种Z16×白菜型油菜品种L144的BIL群体为材料,构建了包含82个SSR标记和102个SRAP标记的13个连锁群遗传图谱,总长度453.7cM,平均图距为2.47cM。每个连锁群上的标记数在4-40个之间,连锁群长度为8.7-70.8cM。(4)用DH群体连锁群遗传图谱的97个SSR标记研究供体亲本L144的染色体片段在BIL群体中覆盖基因组比率。结果表明,在BIL群体的每个单株中,供体亲本L144的基因组片段所占的比率为0.84%-35.00%,平均为11.31%,接近理论遗传预期值12.50%。在25个BC2 BIL群体的每个群体中,供体亲本L144的基因组片段所占的比率为1.69%-27.36%,平均比率为11.03%。(5)对两种群体构建的遗传连锁图谱进行比较,发现BIL群体遗传图谱中有些连锁群存在10cM以上的大间隙,并出现断离的连锁群,导致其连锁群数目多于10个连锁群,其中LG3、LG4对应于DH群体遗传图谱的A03连锁群,而LG12、LG13没有相应的连锁群;在两种遗传连锁图谱共有的58个SSR标记中,有43个标记存在线性对应关系,15个标记没有线性对应关系。

全文目录

摘要  7-8
ABSTRACT  8-10
1 前言  10-22
  1.1 遗传标记的发展  10-13
    1.1.1 构建遗传图谱常用的几种分子标记  11-13
      1.1.1.1 RFLP  11
      1.1.1.2 RAPD  11
      1.1.1.3 AFLP  11-12
      1.1.1.4 SSR  12
      1.1.1.5 SRAP  12-13
  1.2 遗传图谱的构建  13-16
  1.3 作图群体的构建  16-19
    1.3.1 亲本的选择  16-17
    1.3.2 作图群体类型  17-19
      1.3.2.1 F_2 及其衍生群体  17
      1.3.2.2 BC 群体  17
      1.3.2.3 RIL 群体  17-18
      1.3.2.4 DH 群体  18
      1.3.2.5 BIL 群体  18-19
      1.3.2.6 NIL 群体  19
    1.3.3 群体大小  19
  1.4 遗传连锁图在白菜类作物育种的应用  19-21
    1.4.1 基因定位  19-20
    1.4.2 分子标记辅助育种  20
    1.4.3 芸薹属植物比较基因组研究  20-21
  1.5 研究目的与意义  21-22
2 材料与方法  22-24
  2.1 试验材料  22
  2.2 DNA 提取  22
  2.3 引物来源  22-23
  2.4 SSR 分析  23
  2.5 SRAP 分析  23
  2.6 数据统计分析  23-24
3 结果与分析  24-53
  3.1 分子标记多态性分析  24-26
  3.2 DH 群体遗传图谱构建  26-31
  3.3 分子标记偏分离分析  31
  3.4 利用SSR 等锚定标记确定DH 遗传连锁群  31-34
  3.5 BIL 群体遗传图谱的构建  34-45
    3.5.1 BIL 群体遗传图谱  34-38
    3.5.2 分子标记的分离分析  38
    3.5.3 利用SSR 等锚定标记确定BIL 遗传连锁群  38-41
    3.5.4 BIL 群体的遗传结构分析  41-45
  3.6 DH 遗传图谱和BIL 遗传图谱总体概况  45-46
  3.7 DH 遗传图谱和BIL 遗传图谱中分子标记的对应关系分析  46-53
4 讨论  53-58
  4.1 分子标记作图效率  53
  4.2 SSR 标记作图效率评价  53
  4.3. SRAP 标记作图效率评价  53-54
  4.4 连锁图与染色体的关联分析  54-55
    4.4.1 DH 群体连锁群与染色体的关系  54
    4.4.2 BIL 群体连锁群与染色体的关系  54-55
  4.5 SSR 标记的共线性分析  55
  4.6 标记的偏分离分析  55-56
  4.7 BIL 群体遗传结构分析  56
  4.8 DH 遗传图谱与BIL 遗传图谱的比较  56-58
5 结论  58-59
参考文献  59-66
致谢  66

白菜BIL群体和DH群体的遗传图谱构建及其比较

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