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大白菜抗缘枯病及霜霉病基因的SRAP标记筛选

作　者: 邸青
导　师: 孙日飞
学　校: 中国农业科学院
专　业: 蔬菜学
关键词: 大白菜 缘枯病 遗传分析 SRAP标记 霜霉病
分类号: S634.1
类　型: 硕士论文
年　份: 2010年
下　载: 81次
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内容摘要


大白菜起源于中国,是十字花科芸薹属中重要的蔬菜作物之一。大白菜在种植过程中由于遭受各种病害造成品质降低,产量下降。本课题研究在大白菜中发现了一种新型病害,缘枯病。该病害主要发生在成株期叶部,严重时可使整株死亡。霜霉病是我国大白菜“三大病害”之一。多年来“高抗、高产、高质”一直都是大白菜的育种目标,选育抗缘枯病及抗霜霉病的优质大白菜品种是大白菜生产高产稳产及其迫切的要求。本研究利用田间鉴定方法,初步确定了缘枯病的抗性遗传规律。用田间鉴定结合室内人工接种鉴定,初步确定了霜霉病的抗性遗传规律。采用SRAP技术结合BSA法找到了一个与缘枯病抗病基因相连锁的标记,2个与霜霉病抗病基因连锁的标记,并将霜霉病抗病基因定位在大白菜A1连锁群上。获得的主要结果如下:(1)对20份高代自交系材料进行鉴定,筛选出对缘枯病及霜霉病同时表现抗性的材料“山西信中籽331”,“山西信中籽338”,“山西信中籽339”,及感病的材料“山西信中籽332”,“山西信中籽340”,配置3个组合331×332,339×332,338×340,分别构建F2群体,作为实验材料。(2)对三个组合构建的F2群体进行缘枯病田间鉴定,结果发现三个组合的F2群体材料抗感分离比符合3:1,符合单显性基因控制模型。利用SRAP技术结合BSA法对其中一个组合339×332的F2群体进行分析,筛选引物672对,筛选到一个与抗病基因连锁的标记BMe10CO11,其遗传距离为11.4cM;(3)对构建的三份实验材料进行霜霉病的田间鉴定及室内人工接种鉴定,结果表明331×332,339×332两个组合的F2材料抗性分离符合3:1分离比,对霜霉病的抗性由单显性基因控制。利用BSA法,对331×332组合进行分析,共筛选引物712对,获得2个与霜霉病抗性基因连锁的SRAP标记,Me1E40和Me3E33,分别位于抗病基因的两侧,与抗病基因的距离分别为8.1cM和10.3cM。对这两个标记的特异条带进行回收,克隆测序,Me1E40标记的长度为159 bp,Me3E33标记的长度为121 bp。根据大白菜基因组测序信息,Me1E40和Me3E33分别比对在A1连锁群的scaffold61和scaffold151上。

全文目录


摘要  6-7
Abstract  7-12
第一章 综述  12-20
  1.1 大白菜缘枯病的研究  12-13
  1.2 大白菜霜霉病的研究  13-15
    1.2.1 霜霉病菌形态特性与生理特征  13-14
    1.2.2 霜霉病病原生理分化  14
    1.2.3 大白菜霜霉病发病症状及发病规律  14-15
  1.3 大白菜抗霜霉病育种研究进展  15-16
    1.3.1 霜霉病抗病性鉴定方法  15
    1.3.2 白菜霜霉病病原保存  15
    1.3.3 白菜霜霉病遗传规律研究  15-16
  1.4 分子标记的研究进展  16-18
    1.4.1 DNA 分子标记的分类  16
    1.4.2 几种常用标记的比较  16-17
    1.4.3 SRAP 分子标记概述  17
    1.4.4 Indel 标记简述  17
    1.4.5 分子标记在白菜育种中的应用  17-18
    1.4.6 白菜霜霉病的分子生物学研究  18
  1.5 本研究的目的意义及技术路线  18-20
    1.5.1 本研究的目的及意义  18-19
    1.5.2 技术路线  19-20
第二章 大白菜缘枯病及霜霉病抗病材料及感病材料的筛选与实验群体的构建  20-26
  2.1 试验材料  20
  2.2 试验方法  20-24
    2.2.1 田间鉴定  20-22
    2.2.2 霜霉病室内人工接种鉴定  22-24
    2.2.3 构建实验群体  24
  2.3 结果  24-25
    2.3.1 确定缘枯病及霜霉病抗源材料  24
    2.3.2 配置杂交组合，构建实验群体  24-25
  2.4 小结与讨论  25-26
第三章 大白菜缘枯病遗传学分析及SRAP 标记筛选  26-31
  3.1 材料与方法  26-27
    3.1.1 实验材料  26
    3.1.2 抗病性的鉴定  26
    3.1.3 基因组DNA 样品提取及抗感池的构建  26-27
    3.1.4 SRAP 反应体系  27
    3.1.5 SRAP 引物的筛选  27
    3.1.6 连锁分析  27
  3.2 结果与分析  27-30
    3.2.1 田间鉴定遗传学分析  27-28
    3.2.2 筛选与目标基因相连锁的SRAP 标记  28-29
    3.2.3 遗传连锁分析  29-30
  3.3 小结与讨论  30-31
第四章 大白菜霜霉病遗传学分析及SRAP 标记筛选  31-41
  4.1 材料与方法  31-34
    4.1.1 实验材料  31
    4.1.2 抗病性的鉴定  31
    4.1.3 基因组DNA 提取及抗感池的构建  31
    4.1.4 SRAP 反应体系  31-32
    4.1.5 SRAP 引物的筛选  32
    4.1.6 多态性标记在F2 群体中的分离  32
    4.1.7 目标片段的回收、连接及转化  32-34
    4.1.8 多态性标记序列分析  34
  4.2 结果  34-40
    4.2.1 遗传规律分析  34-35
    4.2.2 筛选与抗霜霉病基因连锁的 SRAP 标记  35-36
    4.2.3 遗传连锁分析  36-37
    4.2.4 多态性标记序列分析及初步定位  37-40
  4.3 小结与讨论  40-41
第五章 讨论与结论  41-43
  5.1 对大白菜缘枯病抗性的遗传学分析及 SRAP 标记  41
    5.1.1 研究的三个群体对大白菜缘枯病的抗性均由由显性基因控制  41
    5.1.2 筛选到一个与大白菜缘枯病抗病基因相连锁的 SRAP 标记  41
  5.2 大白菜霜霉病进行遗传学分析，并进行了初步定位  41-42
    5.2.1 确定一套行之有效的鉴定霜霉病的方法  41-42
    5.2.2 确定了实验群体对霜霉病抗性的遗传规律并对抗病基因进行了初步定位  42
  5.3 分子标记辅助育种及存在的问题  42-43
参考文献  43-47
附录  47-49
致谢  49-50
作者简历  50

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中图分类: > 农业科学 > 园艺 > 蔬菜园艺 > 白菜类 > 大白菜
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